Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15129
- Subject:
- XM_006511546.2
- Aligned Length:
- 1124
- Identities:
- 896
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 ATG-ATC-TCAGATCCCCCCTCAAACAACAGCTGGAACTCTGTTCTCTATCTTC--------------TAGAGG 58
||| ||| ||.||||| ||....|||.|| ||.| .|||||
Sbjct 1 ATGAATCGTCCGATCC-------AAGTGAAGCCGG---------------CTGCCAGTGAGGGCCGAGGAGAGG 52
Query 59 ACCGAAAGCTGTTTGTGGGGATGCTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGACGTCAGACGCCTGTTCCAGCCCTTT 132
||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 53 ACCGGAAGCTGTTTGTGGGGATGTTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGATGTCAGACGTCTGTTCCAGCCCTTC 126
Query 133 GGCCACATCGAGGAGTGCACGGTCCTGCGGAGTCCTGACGGCACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCGG 206
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 127 GGCCATATCGAGGAGTGCACTGTCCTGCGGAGTCCGGACGGTACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAATTCGG 200
Query 207 GAGTCAAGGGGAAGCTCAGGCGGCCATCCGGGGTCTGCACGGCAGCCGGACCATGGCGGGCGCCTCGTCCAGCC 280
.||||||||||||||.||.||.|||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||
Sbjct 201 AAGTCAAGGGGAAGCCCAAGCTGCCATCCAGGGACTACACGGTAGCCGGACAATGACGGGTGCCTCCTCCAGCC 274
Query 281 TCGTGGTCAAGCTGGCGGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGGCGGATGCAGCAGATGGCCGGCCACCTGGGC 354
|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 275 TGGTGGTTAAGCTGGCAGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGAAGGATGCAGCAAATGGCTGGCCAGCTGGGT 348
Query 355 GCCTTCCACCCCGCGCCACTGCCGCTAGGGGCCTGCGGCGCCTACACCACGGCGATCCTGCAGCACCAGGCGGC 428
|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 349 GCCTTCCACCCGGCACCGCTGCCCCTCGGGGCCTGTGGCGCCTATACCACTGCGATCCTACAGCACCAGGCAGC 422
Query 429 CCTGCTGGCGGCGGCACAGGGCCCAGGCCTAGGCCCGGTGGCGGCAGTGGCGGCCCAGATGCAACACGTGGCGG 502
..|||||||.||.||.|||||.||.||..||||||.||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 423 GTTGCTGGCCGCAGCGCAGGGTCCGGGGTTAGGCCAGGTGGCCGCGGTGGCCGCCCAGATGCAGCACGTGGCGG 496
Query 503 CCTTTAGCCTGGTAGCTGCGCCTCTGTTGCCCGCGGCAGCAGCCAA---CTCCCCGCCTGGCAGCGGCCCTGGC 573
||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||| |||||||| .|||||...|||||..||||||||.
Sbjct 497 CCTTCAGCTTGGTGGCTGCACCGCTGTTGCCCGCG---GCAGCCAATACATCCCCTGGTGGCAATGGCCCTGGT 567
Query 574 ACCCTCCCAGGTCTTCCGGCGCCCATCGGGGTCAATGGATTCGGC-CCTCTGACCCCCCAGACCAATGGCCAGC 646
.|.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||| ||| ||||||||||||.|||.||.||||
Sbjct 568 GCACTCCCTGGCCTTCCAGCGCCCATGGGAGTCAATGGATTCGGCTCCT-TGACCCCCCAGAGCAACGGACAGC 640
Query 647 CGGGCTCCGACACGCTCTACAATAACGGGCTCTCCCCTTATCCAGCCCAGAGCCCCGGCGTGGCTGACCCCCTG 720
|.|||||||||||||||||.||.||||||.|.||||||
Sbjct 641 CAGGCTCCGACACGCTCTATAACAACGGGGTTTCCCCT------------------------------------ 678
Query 721 CAGCAGGCCTACGCTGGGATGCACCACTACGCAGCAGCCTATCCGTCGGCCTATGCCCCAGTGAGCACAGCTTT 794
|||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 679 ---------------------------TACCCAGCAGCCTATCCCTCGGCCTATGCCCCAGCGAGCACAGCTTT 725
Query 795 TCCCCAGCAGCCTTCAGCCCTGCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACC 868
|.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 TTCCCAACAGCCTTCAGCTCTGCCTCAACAACAAAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACC 799
Query 869 TGCCTCAGGAGTTTGGTGATGCGGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTTGGAGCCGTTGTCTCTGCTAAAGTC 942
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 800 TGCCTCAGGAGTTTGGGGATGCAGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTCGGAGCTGTTGTCTCTGCCAAAGTT 873
Query 943 TTTGTGGATCGAGCCACCAACCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACTAGTGCCCAGAC 1016
||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 874 TTTGTGGACCGTGCCACCAATCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACCAGTGCCCAGAC 947
Query 1017 TGCTATTCAGGCGATGAATGGCTTTCAAATTGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGCGGCCCAAGGATG 1090
.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||
Sbjct 948 CGCCATCCAGGCCATGAATGGCTTTCAAATCGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGAGACCTAAGGATG 1021
Query 1091 CCAACCGGCCTTAC 1104
|||||.||||||||
Sbjct 1022 CCAACAGGCCTTAC 1035