Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15154
- Subject:
- NM_001146259.2
- Aligned Length:
- 1265
- Identities:
- 1192
- Gaps:
- 56
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC 74
Query 75 CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG 148
Query 149 TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT 222
Query 223 GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA 296
||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGA---------------------------------------------------- 244
Query 297 GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 --TCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG 316
Query 371 TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT 390
Query 445 CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGCAACNTNNCCAACTATCACCAGTACAT 518
|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.|||||||||.|..|||||||||||||||||||
Sbjct 391 CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGGACATTGCTGACATGCATAGCAACCTCTCCAACTATCACCAGTACAT 464
Query 519 TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA 592
|||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA 538
Query 593 GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC 612
Query 667 CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 613 CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAAGGATATGGACTTTCTCAA 686
Query 741 CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGAAGNNGATGTGGA 814
|||||||||||||||||||||||||||...|.|||||||||||||||||||||||||||||| ..||||||||
Sbjct 687 CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGAAGAGGAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGA--GAGATGTGGA 758
Query 815 GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC 832
Query 889 CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT 906
Query 963 CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 907 CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG 980
Query 1037 AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 981 AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA 1054
Query 1111 TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCTAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT 1128
Query 1185 GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT 1202
Query 1259 CTTTGCC 1265
|||||||
Sbjct 1203 CTTTGCC 1209