Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15154
- Subject:
- NM_001146260.2
- Aligned Length:
- 1265
- Identities:
- 1108
- Gaps:
- 146
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC 74
Query 75 CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG 148
Query 149 TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT 222
Query 223 GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA 296
Query 297 GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTT-- 368
Query 371 TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT 444
Sbjct 369 -------------------------------------------------------------------------- 368
Query 445 CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGCAACNTNNCCAACTATCACCAGTACAT 518
||||||
Sbjct 369 --------------------------------------------------------------------GTACAT 374
Query 519 TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA 592
|||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA 448
Query 593 GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC 522
Query 667 CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 523 CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAAGGATATGGACTTTCTCAA 596
Query 741 CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGAAGNNGATGTGGA 814
|||||||||||||||||||||||||||...|.|||||||||||||||||||||||||||||| ..||||||||
Sbjct 597 CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGAAGAGGAGAAGAAAATATTTCTGGAGAAGCTGAAGA--GAGATGTGGA 668
Query 815 GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 GTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAAC 742
Query 889 CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 CAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCT 816
Query 963 CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 CTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGG 890
Query 1037 AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 AGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCA 964
Query 1111 TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 TGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCTAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCAT 1038
Query 1185 GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 GGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACAT 1112
Query 1259 CTTTGCC 1265
|||||||
Sbjct 1113 CTTTGCC 1119