Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15154
- Subject:
- XM_006513121.3
- Aligned Length:
- 1446
- Identities:
- 1129
- Gaps:
- 190
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACGGCTGCGCAGGTGAGCACCGCTTCCGGGTCGGGCTTCGGAGTCGCGGCTAGCTCCCGCTTCCACTCGCT 74
Query 1 -----------------ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGC 57
||||||||||||||.|||||.||.|||||.|.|.|.|||||..|.|.||||||||||
Sbjct 75 CGGGTGCGCGGGAGACTATGGCGTCCTCCTCCGTCCCTCCCGCCACCGCACCCGCGGCAGCTGGAGGCCCCGGC 148
Query 58 CCAGGTTTCGGCTTCGCCTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGC 131
||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 149 CCGGGATTCGGCTTCGCCTCCAAAACCAAGAAGAAGCATTTCGTACAGCAGAAAGTGAAGGTGTTCCGGGCCGC 222
Query 132 CGACCCGCTGGTGGGTGTGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTC-------------------------------- 173
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 GGACCCGCTGGTGGGCGTGTTCCTGTGGGGCGTCGCTCACTCGGTCCAGCCCCAGGCTACAGGGACTGGCCAGG 296
Query 174 ---------------------------------------------------GATCAATGAGCTCAGCCAGGTGC 196
|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 ATCCGGCTGCAGCCAGAGGGACATTAAGGGGAGTGGCTCTGAAGGGTTATTGATCAATGAGCTCAGCCAGGTAC 370
Query 197 CTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGATGACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCAC 270
|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 371 CGCCCCCAGTGATGTTGCTGCCAGATGACTTTAAAGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACTTTTTCCAT 444
Query 271 AGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAAGTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATT 344
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||
Sbjct 445 AGAGAAAATCTTCCCAGTCATTTCAAGTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTGAGAGATCGGTT 518
Query 345 TGGCATTGATGACCAAGATTACTTGGTGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTC 418
||.|||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 519 TGCCATCGATGATCACGATTACTTGGTGTCCCTTACTCGAAGCCCCCCAAGCGAAACTGAAGGCAGTGATGGCC 592
Query 419 GCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACTCTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGC 492
|.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||..|.||||..||.||.||.|||
Sbjct 593 GTTTCCTTATCTCCTATGACCGCACTCTGGTCATCAAGGAAGTGTCGAGCGAAGATATTGCGGATATGCACAGC 666
Query 493 AACNTNNCCAACTATCACCAGTACATTGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTA 566
|||.|..|||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|.|||||||||||.||||.|||||
Sbjct 667 AACCTCTCCAACTACCACCAGTACATAGTGAAATGTCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGCATGTA 740
Query 567 CCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACAGCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGC 640
||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 741 CCGAGTCAGTGTAGAAAATGAAGACAGCTACATGCTCGTGATGCGCAATATGTTTAGTCATCGTCTTCCTGTGC 814
Query 641 ACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCCCTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCC 714
|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 815 ATAGGAAGTATGACCTCAAGGGCTCTCTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAACTGCCA 888
Query 715 ACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAACAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAA-----TA 783
||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 889 ACACTAAAGGATATGGACTTTCTTAACAAGAACCAGAAAGTGTATATTGGTGA-----AGAAGAAAAGAAAGTA 957
Query 784 TTTCTGGAGAAGCTGAA--GAAGNNGATGTGGAGTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGC 855
||.|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 958 TTCCTGGAGAAGCTGAAGCGA----GATGTGGAGTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTCCTGT 1027
Query 856 TAGGCATCCACGACATCATTCGGGGCTCTGAACCAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTG 929
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||.|||.|||||||.|||||.|||..|
Sbjct 1028 TGGGCATCCACGACATCATCCGGGGCTCTGAACCCGAGGAAGAGGGGCCTGTGAGGGAGGAGGAGTCTGAGTGG 1101
Query 930 GATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACCTCCTGCTCTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGG 1003
|||||||||||.|.||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1102 GATGGGGACTGTAACCTGGCTGGACCTCCCGCCCTGGTGGGCTCCTATGGTACCTCCCCTGAGGGTATCGGAGG 1175
Query 1004 CTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGGGCCCAGGAGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTG 1077
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1176 CTACATCCATTCCCACCGGCCACTGGGCCCAGGAGAGTTTGAGTCCTTCATCGATGTCTATGCTATCCGGAGTG 1249
Query 1078 CTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTCTACTTCATGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAG 1151
|.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CGGAGGGGGCCCCCCAGAAGGAGGTGTATTTCATGGGCCTCATTGACATTCTGACACAGTATGATGCCAAGAAG 1323
Query 1152 AAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGTCAAGCATGGGGCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTA 1225
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1324 AAAGCAGCTCATGCAGCCAAGACTGTCAAGCACGGGGCGGGGGCAGAGATCTCCACTGTCCATCCTGAGCAGTA 1397
Query 1226 TGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACATCTTTGCC 1265
||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 1398 TGCTAAGCGATTCCTGGACTTTATTGCCAACATCTTTGCC 1437