Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15196
- Subject:
- NM_175362.2
- Aligned Length:
- 3472
- Identities:
- 2983
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ---------------------ATGGATGACTACATGGAGACGCTGAAGGATGAAGAGGACGCCTTGTGGGAGAA 53
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.||
Sbjct 1 ATGCCAGGAGGAGGGCCAGCTATGGATGACTACATGGAGACGCTGAAGGATGAAGAGGAGGCCCTATGGGATAA 74
Query 54 TGTGGAGTGTAACCGGCACATGCTCAGCCGCTATATCAACCCTGCCAAGCTCACGCCCTACCTGCGTCAGTGTA 127
.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 75 CGTGGAATGCAACCGGCACATGCTGAGCCGTTACATCAACCCCGCCAAGCTCACCCCCTACCTGCGCCAGTGCA 148
Query 128 AGGTCATTGATGAGCAGGATGAAGATGAAGTGCTTAATGCCCCTATGCTGCCATCCAAGATCAACCGAGCAGGC 201
|||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 AGGTCATCGATGAGCAAGATGAAGACGAGGTGCTCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGC 222
Query 202 CGGCTGTTGGACATTCTACATACCAAGGGGCAAAGGGGCTATGTGGTCTTCTTGGAGAGCCTAGAATTTTATTA 275
||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 223 CGATTGTTGGACATTCTTCACACCAAGGGACAAAGGGGCTATGTGGTCTTCCTGGAGAGCCTGGAGTTTTACTA 296
Query 276 CCCAGAACTGTACAACTTGGTGACTGGGAAAGAGCCCACTCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC 349
|||||||||.|||||..||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCAGAACTTTACAAACTGGTGACTGGAAAGGAACCCACCCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC 370
Query 350 ACGAGGGCCTCACGCACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAGCTGCAGCAGCAGATGAAGGCCAAGGACCTGCAA 423
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||.
Sbjct 371 ATGAGGGCCTCACACACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAACTGCAGCAGCAAGTGAAAGCCAAGGACCTTCAG 444
Query 424 CGCTGCGAGCTGCTGGCCAGGTTGCGGCAGCTGGAGGATGAGAAGAAGCAGATGACGCTGACGCGCGTGGAGCT 497
|||||.|||||||||||||.||..|||||.|||||||||||||||||||||.|||..||||..||.||||||||
Sbjct 445 CGCTGTGAGCTGCTGGCCAAGTCCCGGCAACTGGAGGATGAGAAGAAGCAGCTGAGCCTGATACGGGTGGAGCT 518
Query 498 GCTAACCTTCCAGGAGCGGTACTACAAGATGAAGGAAGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTGGTCAAGGTGA 571
|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 519 GCTGACCTTCCAGGAGCGATACTACAAGATGAAGGAGGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTCGTCAAGGTCA 592
Query 572 AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCACAGCTCAGTGAGGAGAAGAACATGGCGGTCATGAGGAGC 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 593 AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCCCAGCTCAGTGAGGAGAAAAACATGGCGGTGATGAGGAGC 666
Query 646 CGAGACCTCCAACTCGAGATCGATCAGCTAAAGCACCGGTTGAATAAGATGGAGGAGGAATGTAAGCTGGAGAG 719
||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CGCGACCTCCAACTCGAGATCGACCAGCTCAAACACCGACTGAACAAGATGGAGGAGGAATGCAAGCTGGAGAG 740
Query 720 AAATCAGTCTCTAAAACTGAAGAATGACATTGA-AATCGGCCCAAG-ATGAGCAG--TCTGGAACTGGAGCGGG 789
|||||||||.||.||.||.|||||||||||.|| ||.|||||||.| |.|||||| .|||||.||||||| ||
Sbjct 741 AAATCAGTCCCTCAAGCTCAAGAATGACATCGAGAACCGGCCCAGGAAGGAGCAGGTCCTGGAGCTGGAGC-GG 813
Query 790 GAGAATGAAATGCTGAAGACCAAAAACCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCCGGGAAGCGCAGCCTGCCAGA 863
||||||||.|||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 814 GAGAATGAGATGCTGAAGACGAAAATTCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCTGGCAAGCGCAGCCTCCCTGA 887
Query 864 CTCAGACAAGGCCATCCTGGACATCTTGGAACACGACCGCAAGGAGGCCCTGGAGGACAGGCAGGAGCTGGTCA 937
||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 888 CTCAGACAAGGCCATCTTGGACATCCTGGAACATGACCGGAAGGAGGCGCTAGAGGACCGGCAGGAACTGGTCA 961
Query 938 ACAGGATCTACAACCTGCAGGAGGAGGCCCGCCAGGCAGAGGAGCTGCGAGACAAGTACCTGGAGGAGAAGGAG 1011
|||..||.||||||||.||.|||||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 962 ACAAAATTTACAACCTACAAGAGGAAGTCCGCCAGGCGGAGGAGCTGCGGGATAAGTACCTGGAGGAGAAGGAA 1035
Query 1012 GACCTGGAGCTCAAGTGCTCGACCCTGGGAAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACGGTCATGCT 1085
||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1036 GACCTGGAACTCAAGTGTTCAACCCTGGGGAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACAGTTATGCT 1109
Query 1086 GCAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAAGCTCAGACACAGTACTCGC 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1110 GCAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAGGCACAGACACAGTACTCAC 1183
Query 1160 AGTGCTTAATCGAAAAGGACAAGTACAGGAAGCAGATCCGCGAGCTGGAGGAGAAGAACGACGAGATGAGGATC 1233
|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||.
Sbjct 1184 AGTGCTTAATCGAGAAGGACAAGTACCGGAAGCAGATCCGGGAGCTGGAGGAGAAGAACGATGAGATGCGTATT 1257
Query 1234 GAGATGGTGCGGCGGGAGGCCTGCATCGTCAACCTGGAGAGCAAGCTGCGGCGCCTCTCCAAGGACAGCAACAA 1307
|||||||||.||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||.|..||.
Sbjct 1258 GAGATGGTGAGGAGGGAGGCCTGTATTGTCAACCTGGAAAGCAAGCTCCGGCGCCTGTCCAAGGACAACGGCAG 1331
Query 1308 CCTGGACCAGAGTCTGCCCAGGAACCTGCCAGTAACCATCATCTCTCAGGACTTTGGGGATGCCAGCCCCAGGA 1381
|||.||||||||||||||.||..||||.||||..|||||||||||.|||.||.||||.||..||||||||||||
Sbjct 1332 CCTCGACCAGAGTCTGCCTAGACACCTTCCAGCCACCATCATCTCACAGAACCTTGGAGACACCAGCCCCAGGA 1405
Query 1382 CCAATGGTCAAGAAGCTGACGATTCTTCCACCTCGGAGGAGTCACCTGAAGACAGCAAGTACTTCCTGCCCTAC 1455
|||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1406 CCAATGGCCAGGAAGCTGATGATTCTTCAACCTCAGAAGAGTCTCCCGAAGACAGCAAGTACTTTCTGCCTTAC 1479
Query 1456 CATCCGCCCCAGCGCAGGATGAACCTGAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCCTGAAGCG 1529
||.||.||||.||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1480 CACCCACCCCGGCGCCGGATGAACCTAAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCATGAAGCA 1553
Query 1530 AACATCAGATTTTCAAGCCAAGGGGCACGAGGAAGAAGGCACGGACGCCAGCCCTAGCTCCTGCGGATCTCTGC 1603
|.||||.||.|||||||.||||||||||||.||.||...|||.||||.||||||.||.||||.|.|.||.||||
Sbjct 1554 AGCATCTGAGTTTCAAGTCAAGGGGCACGAAGAGGATTTCACAGACGGCAGCCCCAGTTCCTCCCGCTCGCTGC 1627
Query 1604 CCATCACCAACTCCTTCACCAAGATGCAGCCCCCCCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACCGCCGAGCCC 1677
|..||||||.|||.|||.||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1628 CTGTCACCAGCTCTTTCTCCAAGATGCAACCCCATCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACGGCAGAGCCC 1701
Query 1678 CCGGGAAACGACTCCATCGTCAGACGCTACAAGGAGGACGCGCCCCATCGCAGCACAGTCGAAGAAGACAATGA 1751
||||||||.||||||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1702 CCGGGAAATGACTCCATAGTCAGACGCTGTAAGGAAGATGCGCCACACCGGAGCACGGTGGAAGAAGACAACGA 1775
Query 1752 CAGCGGCGGGTTTGACGCCTTAGATCTGGATGATGACAGTCACGAACGCTACTCCTTCGGACCCTCCTCCATCC 1825
.|||.|.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|.|||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||
Sbjct 1776 TAGCTGTGGGTTTGATGCCTTAGACCTTGACGATGAAAATCACGAACGTTATTCCTTTGGACCTCCCTCCATCC 1849
Query 1826 ACTCCTCCTCCTCCTCCCACCAATCCGAGGGCCTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTCAGG 1899
|||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 1850 ACTCCTCCTCCTCTTCACACCAGTCAGAGGGACTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTACGA 1923
Query 1900 AAGTTCTCTCTGGAAAGACCCTTCCGGCCTTCGGTCACCTCTGTGGGGCACGTGCGGGGCCCAGGGCCCTCGGT 1973
|||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||||.|||.||||||||||||.|.|||||||.|||
Sbjct 1924 AAGTTCTCTTTGGAAAGGCCCTTCCGGCCATCGGTCACATCTGGGGGTCACGTGCGGGGCACCGGGCCCTTGGT 1997
Query 1974 GCAGCACACGACGCTGAATGGCGACAGCCTCACCTCCCAGCTCACCCTGCTGGGGGGCAACGCGCGAGGGAGCT 2047
.||||||||.||.|||||||||||..|.||||.|.|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1998 CCAGCACACAACTCTGAATGGCGATGGGCTCATCACGCAGCTCACCCTTCTGGGCGGCAATGCACGCGGGAGCT 2071
Query 2048 TCGTGCACTCGGTCAAGCCTGGCTCTCTGGCCGAGAAAGCCGGCCTCCGTGAGGGCCACCAGCTGCTGCTGCTA 2121
||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||..|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 2072 TCATTCACTCTGTCAAGCCAGGCTCACTGGCTGAGAGGGCCGGACTGCGTGAGGGCCACCAACTCCTGCTGCTG 2145
Query 2122 GAAGGCTGCATCCGAGGCGAGAGGCAGAGTGTCCCGTTGGACACATGCACCAAAGAGGAAGCCCACTGGACCAT 2195
|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||..||||..|.|||||.|||||.||.||||..||||||||
Sbjct 2146 GAAGGTTGCATCCGAGGCGAAAGGCAGAGCGTTCCACTGGATGCGTGCACAAAAGAAGAGGCCCGTTGGACCAT 2219
Query 2196 CCAGAGGTGCAGCGGCCCCGTCACGCTGCACTACAAGGTCAACCACGAAGGGTACCGGAAGCTGGTGAAGGACA 2269
||||||||||||.||||.|.||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 2220 CCAGAGGTGCAGTGGCCTCATCACTCTGCATTACAAGGTCAACCATGAAGGATACCGGAAGCTGCTGAAGGAGA 2293
Query 2270 TGGAGGACGGCCTGATCACATCGGGGGACTCGTTCTACATCCGGCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGAC 2343
|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2294 TGGAGGATGGTCTGATCACATCAGGGGACTCGTTCTATATCCGCCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGAT 2367
Query 2344 GCCTGCACCATGTCCCTGAAGTGTGACGATGTTGTGCACGTCCGTGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTG 2417
||||||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 GCCTGCTCCATGTCCCTCAAGTGTGACGACGTGGTGCATGTCCTAGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTG 2441
Query 2418 GCTGTGCGCGCGGGTCGACCCTTTCACAGACCATGACCTGGATATGGGCACCATACCCAGCTACAGCCGAGCCC 2491
||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 2442 GCTGTGTGCACGAGTCGACCCCTTCACTGACCAAGACCTGGACACGGGCACCATCCCCAGCTACAGCCGGGCTC 2515
Query 2492 AGCAGCTCCTCCTGGTGAAACTGCAGCGCCTGATGCACCGAGGCAGCCGGGAGGAGGTAGACGGCACCCACCAC 2565
|.|||||.|||||||||||.||.|||||..||.|.|||.||||||.||||||.||||.||||.||.|.||||||
Sbjct 2516 AACAGCTTCTCCTGGTGAAGCTCCAGCGGTTGGTTCACAGAGGCAACCGGGAAGAGGCAGACAGCGCTCACCAC 2589
Query 2566 ACCCTGCGGGCA--CTCCGGAACACCCTGCAGCCGGAAGAAGCGCTTTCAACAAGCGACCCCCGGGTCAG-CCC 2636
||||||| ||| ||||||||||||||||||||.|||||...||||||.||.|||||||||||.||||| |||
Sbjct 2590 ACCCTGC--GCAGCCTCCGGAACACCCTGCAGCCCGAAGAGATGCTTTCGACGAGCGACCCCCGAGTCAGCCCC 2661
Query 2637 CGTTTCTCGGGAGCAAGCTCCTT-TTTGCCCAGCTCCTTCAGTTCGTCAG-CAGTCGAGAAAACAAGTATAAGC 2708
||..||||..||||.||.|.||| ||||.|||||||||.|||||.||||| |.||| ||||||||||||.||..
Sbjct 2662 CGCCTCTCCAGAGCGAGTTTCTTCTTTGGCCAGCTCCTGCAGTTTGTCAGCCGGTC-AGAAAACAAGTACAAAA 2734
Query 2709 GGATGAACAGCAACGAGCGGGTCCGCATCATCTCGGGGAGTCGCTANGGGAGCCTGGCCCGGGTCCTCGCT-GA 2781
|.|||||||||||.|||||.||..|.||||||||.|||||||.|...||||||||..||| |||||||||| ||
Sbjct 2735 GAATGAACAGCAATGAGCGCGTGAGAATCATCTCTGGGAGTCCCCTGGGGAGCCTCTCCC-GGTCCTCGCTGGA 2807
Query 2782 CGCCCACCAAGCTCTGNACTGAGAAGCAGGAAGAGCTGGACCCTGAGAGCGAGCTGGGCAAGAACCTCAGCCTC 2855
.| |||||||.|||...||.||||||||.|||||.|||||.|||||||..|||||..||..||||||||.|||.
Sbjct 2808 TG-CCACCAAACTCCTGACCGAGAAGCATGAAGAACTGGATCCTGAGAATGAGCTCAGCCGGAACCTCACCCTG 2880
Query 2856 ATCCCCTACAGCCTGGTACGCGCCTTCTACTGCGAGCGCCGCCGGCCCGTGCTCTTCACACCCACCGTGCTGGC 2929
|||||.|||||||||||.|||||.|||.||||.|||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 2881 ATCCCTTACAGCCTGGTGCGCGCTTTCCACTGTGAGCGCCGCAGGCCTGTGCTCTTCACGCCCACCATGCTGGC 2954
Query 2930 CAAGACGCTGGTGCAGAGGCTGCTCAACTCGGGAGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATCGTCA 3003
||||||..|||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2955 CAAGACATTGGTGCAGAAGCTGCTCAACTCAGGGGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATTGTCA 3028
Query 3004 CAAGAGATGAGTTCCTCAGAAGGCAGAAGACGGAGACCATCATCTACTCCCGAGAGAAGAACCCCAACGCGTTC 3077
|||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||.
Sbjct 3029 CAAGAGATGAGTTCCTCCGAAAGCAGAAGACAGAGACCATCATCTACTCCCGGGAAAAGAACCCCAACACCTTT 3102
Query 3078 GAATGCATCGCCCCTGCCAACATTGAAGCTGTGGCCGCCAAGAACAAGCACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGG 3151
||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3103 GAATGCATCGTCCCTGCCAACATTGAGGCTGTGGCAGCCAAGAACAAACACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGG 3176
Query 3152 C----TGCACAAGAGACTTGATCAAGTCCAACATCTACCCCATCGTGCTCTTCATCCGGGTGTGTGAGAAGAAC 3221
| ||| |.|||.|||||||||.|||..|.||||||||.|||||..|||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 3177 CTGTGTGC----GCGACCTGATCAAGTGCAAGGTGTACCCCATAGTGCTGCTCATCCGGGTGAGCGAGAAGAAC 3246
Query 3222 ATCAAGAGGTTCAGAAAGCTGCTGCCCCGACCTGAGACGGAGGAGGAGTTCCTGCGCGTGTGCCGGCTGAAGGA 3295
|||||..|||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||.||||.||.||
Sbjct 3247 ATCAAACGGTTCAGGAAGCTGCTGCCGCGGCCAGAGACGGAAGAGGAATTCCTGCGAGTGTGCAGGCTCAAAGA 3320
Query 3296 GAAGGAGCTGGAGGCCCTGCCGTGCCTGTACGCCACGGTGGAACCTGACATGTGGGGCAGCGTAGAGGAGCTGC 3369
|||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||.||||.||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 3321 GAAGGAGCTGGAGGCGCTGCCCTGCCTCTACGCCACCGTGGAAGCTGAGATGTGGAGCAGCGTGGAGGAGCTGC 3394
Query 3370 TCCGCGTTGTCAAGGACAAGATCGGCGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG 3437
|.||.||..||||.||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3395 TGCGAGTCCTCAAAGACAAGATTGTAGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG 3462