Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15207
• Subject: NM_001348718.1
• Aligned Length: 1521
• Identities: 1086
• Gaps: 432

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCTGCTTTACTCACAGGAGCTGTAGAGAGGACCCCGGTACATCTGAAAGCCGGGAAATGATGTTTCAGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATCTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACCAGAAC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATTAAAGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGCTTCTC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------ATGAACATCAGA  12
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  371  CTGAAGTAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGAACATCAGA  444

Query   13  GGTGACACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAA  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTGACACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAA  518

Query   87  AGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAG  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAG  592

Query  161  AATGTGGAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTAT  234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AATGTGGAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTAT  666

Query  235  AAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGA  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGA  740

Query  309  GAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTC  382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTC  814

Query  383  ACATTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACAT  456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACAT  888

Query  457  GAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGT  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGT  962

Query  531  TCGTAGACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTC  604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGTAGACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTC  1036

Query  605  TTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGC  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGC  1110

Query  679  TTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATG  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATG  1184

Query  753  TGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGT  826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGT  1258

Query  827  GTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATCGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAA  900
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAA  1332

Query  901  CCGTATCAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACAC  974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCGTATCAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACAC  1406

Query  975  TGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAA  1048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAA  1480

Query 1049  GGACAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA  1089
            |||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGACACAAACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA  1521