Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15207
• Subject: NM_001348722.1
• Aligned Length: 1356
• Identities: 1086
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGGAAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATTAAAGAAGACAGTCATTGTGGAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGT  222

Query    1  ---------------------------------------------ATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAA  29
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGCTTTGTGTGTGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAA  296

Query   30  GGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACC  103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACC  370

Query  104  CCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATT  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATT  444

Query  178  ATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGG  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGG  518

Query  252  GAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTA  325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTA  592

Query  326  AACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCT  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCT  666

Query  400  TATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGG  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGG  740

Query  474  AGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGA  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGA  814

Query  548  CCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACA  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACA  888

Query  622  CACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTC  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTC  962

Query  696  ATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTC  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTC  1036

Query  770  GTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAA  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAA  1110

Query  844  GCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATCGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGA  917
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGA  1184

Query  918  ATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATG  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATG  1258

Query  992  AATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACAAACACACATAAG  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1259  AATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACACAAACACATAAG  1332

Query 1066  AATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA  1089
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA  1356