Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15207
- Subject:
- XM_017026254.1
- Aligned Length:
- 1422
- Identities:
- 993
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 ATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCA 74
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1 ATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCA 74
Query 75 ACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCT 148
||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 75 ACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCA 148
Query 149 ATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGG 222
||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.|||||||||..|||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 149 ATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGG 222
Query 223 GATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 GATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAAT 296
Query 297 TCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATAC 370
||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATAC 370
Query 371 ATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCC 444
||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 ATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCC 444
Query 445 TGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTG 518
|.||..|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 445 TATCGTAGACATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTG 518
Query 519 TCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAG 592
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAG 592
Query 593 CATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 593 CATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATA 666
Query 667 TGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAA 740
|||||.||||.|||||.|||||..||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 TGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAA 740
Query 741 ATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGA 814
|||.|||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGA 814
Query 815 AACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATCGCATGGTAGGACTCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||.|..||||||||||||||||
Sbjct 815 AACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCAC 888
Query 889 ACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTG-------CCT------------ 943
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||.|| |||
Sbjct 889 ACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGA 962
Query 944 -----------CACAACTTCGAATCCA-TC--------------------GTAGGAT----------------- 968
||||..|..||||.|| || |||.|||
Sbjct 963 AAGGACACAAACACACATAAGAATACACTCTGGAGAAAGACGTTATAAATGTAAGATATGTGGGAAAGGCTTTT 1036
Query 969 ----------------------------------TCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGAAATGT--G 1006
|||||||||||||||||.|||||||||.|||.||.|| .
Sbjct 1037 ATTGTCCCAAATCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAACGTTCA 1110
Query 1007 GGAAAGCCTTCAGATATGTCCAG-AACTTTCGATTTCATGAAAGGACAAACAC---ACATAAG-------AAT- 1068
|.|...||||||| ||..||||| ..||||.|||.||||||||||||..|||| |.|.||| |||
Sbjct 1111 GTAGTTCCTTCAG-TAGTTCCAGTTCCTTTTGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATG 1183
Query 1069 ---GCACTCTGGAGAAAGACCTTA-------------------------------------------------- 1089
|||.|.||| ||||| ||||.
Sbjct 1184 CGAGCAATGTGG-GAAAG-CCTTCAGAGCTGTGTCAATCCTTTGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGAGAA 1255
Query 1090 -------------------------------------------------------------------------- 1089
Sbjct 1256 ACCCTATGAGTGTGAGCAATGACGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCACACCTTTGAATACGTGGTAGGACACACA 1329
Query 1090 -------------------------------------------------------------------------- 1089
Sbjct 1330 ATGGAGAGAAGCCCTATGCATGTAAGGAATGTGGGAAACCCTTCGGATCTGCCCAGAACCTTCGAATTCATGAA 1403
Query 1090 ---------------- 1089
Sbjct 1404 AGGACACAAACACACA 1419