Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15225
• Subject: NM_001184714.2
• Aligned Length: 999
• Identities: 989
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGTTGTGGCTGTTCCAATCGCTCCTGTTTGTCTTCTGCTTTGGCCCAGGGAATGTAGTTTCACAAAGCAGCTT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTTGTGGCTGTTCCAATCGCTCCTGTTTGTCTTCTGCTTTGGCCCAGGGAATGTAGTTTCACAAAGCAGCTT  74

Query  75  AACCCCATTGATGGTGAACGGGATTCTGGGGGAGTCAGTAACTCTTCCCCTGGAGTTTCCTGCAGGAGAGAAGG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AACCCCATTGATGGTGAACGGGATTCTGGGGGAGTCAGTAACTCTTCCCCTGGAGTTTCCTGCAGGAGAGAAGG  148

Query 149  TCAACTTCATCACTTGGCTTTTCAATGAAACATCTCTTGCCTTCATAGTACCCCATGAAACCAAAAGTCCCAGA  222
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 149  TCAACTTCATCACTTGGCTTTTCAATGAAACATCTCTTGCCTTCATAGTACCCCATGAAACCAAAAGT-CCAGA  221

Query 223  AATCCACGTGGACTAATCCGAAACAGGGAAAGCGACTGAACTTCACCCAGNNCTACTCCCTGCAACTCAGCAAC  296
           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 222  AATCCACGT-GACTAATCCGAAACAGGGAAAGCGACTGAACTTCACCCAGTCCTACTCCCTGCAACTCAGCAAC  294

Query 297  CTGAAGATGGAAGACACAGGCTCTTACAGAGCCCAGATATCCACAAAGACCTCTGCAAAGCTGTCCAGTTACAC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  CTGAAGATGGAAGACACAGGCTCTTACAGAGCCCAGATATCCACAAAGACCTCTGCAAAGCTGTCCAGTTACAC  368

Query 371  TCTGAGGATATTAAGACAACTGAGGAACATACAAGTTACCAATCACAGTCAGCTATTTCAGAATATGACCTGTG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369  TCTGAGGATATTAAGACAACTGAGGAACATACAAGTTACCAATCACAGTCAGCTATTTCAGAATATGACCTGTG  442

Query 445  AGCTCCATCTGACTTGCTCTGTGGAGGATGCAGATGACAATGTCTCATTCAGATGGGAGGCCTTGGGAAACACA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443  AGCTCCATCTGACTTGCTCTGTGGAGGATGCAGATGACAATGTCTCATTCAGATGGGAGGCCTTGGGAAACACA  516

Query 519  CTTTCAAGTCAGCCAAACCTCACTGTCTCCTGGGACCCCAGGATTTCCAGTGAACAGGACTACACCTGCATAGC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517  CTTTCAAGTCAGCCAAACCTCACTGTCTCCTGGGACCCCAGGATTTCCAGTGAACAGGACTACACCTGCATAGC  590

Query 593  AGAGAATGCTGTCAGTAATTTATCCTTCTCTGTCTCTGCCCAGAAGCTTTGCGAAGATGTTAAAATTCAATATA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591  AGAGAATGCTGTCAGTAATTTATCCTTCTCTGTCTCTGCCCAGAAGCTTTGCGAAGATGTTAAAATTCAATATA  664

Query 667  CAGATACCAAAATGATTCTGTTTATGGTTTCTGGGATATGCATAGTCTTCGGTTTCATCATACTGCTGTTACTT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665  CAGATACCAAAATGATTCTGTTTATGGTTTCTGGGATATGCATAGTCTTCGGTTTCATCATACTGCTGTTACTT  738

Query 741  GTTTTGAGGAAAANNAGAGATTCCCTATCTTTGTCTACTCAGCGAACACAGGGCCCC---GAGTCCGCAAGGAA  811
           |||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||
Sbjct 739  GTTTTGAGGAAAAGAAGAGATTCCCTATCTTTGTCTACTCAGCGAACACAGGGCCCCGCAGAGTCCGCAAGGAA  812

Query 812  CCTAGAAGTATGTTTCAGTGTCTCCAACGAACAACACTGTGTATGCTTCAGTCACTCATTCAAACAGGGAAACA  885
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813  CCTAG-AGTATGTTTCAGTGTCTCCAACGAACAACACTGTGTATGCTTCAGTCACTCATTCAAACAGGGAAACA  885

Query 886  GAAATCTGGACACCTAGAGAAAATGATACTATCACAATTTACTCCACAATTAATCATTCCAAAGAGAGTAAACC  959
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886  GAAATCTGGACACCTAGAGAAAATGATACTATCACAATTTACTCCACAATTAATCATTCCAAAGAGAGTAAACC  959

Query 960  CACTTTTTCCAGGGCAACTGCCCTTGACAATGTCGTG  996
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960  CACTTTTTCCAGGGCAACTGCCCTTGACAATGTCGTG  996