Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15225
• Subject: NM_001184715.2
• Aligned Length: 996
• Identities: 842
• Gaps: 150

Alignment

Query   1  ATGTTGTGGCTGTTCCAATCGCTCCTGTTTGTCTTCTGCTTTGGCCCAGGGAATGTAGTTTCACAAAGCAGCTT  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct   1  ATGTTGTGGCTGTTCCAATCGCTCCTGTTTGTCTTCTGCTTTGGCCC---------------------------  47

Query  75  AACCCCATTGATGGTGAACGGGATTCTGGGGGAGTCAGTAACTCTTCCCCTGGAGTTTCCTGCAGGAGAGAAGG  148
                                                                                     
Sbjct  48  --------------------------------------------------------------------------  47

Query 149  TCAACTTCATCACTTGGCTTTTCAATGAAACATCTCTTGCCTTCATAGTACCCCATGAAACCAAAAGTCCCAGA  222
                                                         |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  48  ----------------------------------------------AGTACCCCATGAAACCAAAAGT-CCAGA  74

Query 223  AATCCACGTGGACTAATCCGAAACAGGGAAAGCGACTGAACTTCACCCAGNNCTACTCCCTGCAACTCAGCAAC  296
           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AATCCACGT-GACTAATCCGAAACAGGGAAAGCGACTGAACTTCACCCAGTCCTACTCCCTGCAACTCAGCAAC  147

Query 297  CTGAAGATGGAAGACACAGGCTCTTACAGAGCCCAGATATCCACAAAGACCTCTGCAAAGCTGTCCAGTTACAC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148  CTGAAGATGGAAGACACAGGCTCTTACAGAGCCCAGATATCCACAAAGACCTCTGCAAAGCTGTCCAGTTACAC  221

Query 371  TCTGAGGATATTAAGACAACTGAGGAACATACAAGTTACCAATCACAGTCAGCTATTTCAGAATATGACCTGTG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222  TCTGAGGATATTAAGACAACTGAGGAACATACAAGTTACCAATCACAGTCAGCTATTTCAGAATATGACCTGTG  295

Query 445  AGCTCCATCTGACTTGCTCTGTGGAGGATGCAGATGACAATGTCTCATTCAGATGGGAGGCCTTGGGAAACACA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296  AGCTCCATCTGACTTGCTCTGTGGAGGATGCAGATGACAATGTCTCATTCAGATGGGAGGCCTTGGGAAACACA  369

Query 519  CTTTCAAGTCAGCCAAACCTCACTGTCTCCTGGGACCCCAGGATTTCCAGTGAACAGGACTACACCTGCATAGC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370  CTTTCAAGTCAGCCAAACCTCACTGTCTCCTGGGACCCCAGGATTTCCAGTGAACAGGACTACACCTGCATAGC  443

Query 593  AGAGAATGCTGTCAGTAATTTATCCTTCTCTGTCTCTGCCCAGAAGCTTTGCGAAGATGTTAAAATTCAATATA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  AGAGAATGCTGTCAGTAATTTATCCTTCTCTGTCTCTGCCCAGAAGCTTTGCGAAGATGTTAAAATTCAATATA  517

Query 667  CAGATACCAAAATGATTCTGTTTATGGTTTCTGGGATATGCATAGTCTTCGGTTTCATCATACTGCTGTTACTT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518  CAGATACCAAAATGATTCTGTTTATGGTTTCTGGGATATGCATAGTCTTCGGTTTCATCATACTGCTGTTACTT  591

Query 741  GTTTTGAGGAAAANNAGAGATTCCCTATCTTTGTCTACTCAGCGAACACAGGGCCCCGAGTCCGCAAGGAACCT  814
           |||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  GTTTTGAGGAAAAGAAGAGATTCCCTATCTTTGTCTACTCAGCGAACACAGGGCCCCGAGTCCGCAAGGAACCT  665

Query 815  AGAAGTATGTTTCAGTGTCTCCAACGAACAACACTGTGTATGCTTCAGTCACTCATTCAAACAGGGAAACAGAA  888
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666  AG-AGTATGTTTCAGTGTCTCCAACGAACAACACTGTGTATGCTTCAGTCACTCATTCAAACAGGGAAACAGAA  738

Query 889  ATCTGGACACCTAGAGAAAATGATACTATCACAATTTACTCCACAATTAATCATTCCAAAGAGAGTAAACCCAC  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739  ATCTGGACACCTAGAGAAAATGATACTATCACAATTTACTCCACAATTAATCATTCCAAAGAGAGTAAACCCAC  812

Query 963  TTTTTCCAGGGCAACTGCCCTTGACAATGTCGTG  996
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813  TTTTTCCAGGGCAACTGCCCTTGACAATGTCGTG  846