Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_15225
Subject:
NM_052931.5
Aligned Length:
996
Identities:
989
Gaps:
3

Alignment

Query   1  ATGTTGTGGCTGTTCCAATCGCTCCTGTTTGTCTTCTGCTTTGGCCCAGGGAATGTAGTTTCACAAAGCAGCTT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTTGTGGCTGTTCCAATCGCTCCTGTTTGTCTTCTGCTTTGGCCCAGGGAATGTAGTTTCACAAAGCAGCTT  74

Query  75  AACCCCATTGATGGTGAACGGGATTCTGGGGGAGTCAGTAACTCTTCCCCTGGAGTTTCCTGCAGGAGAGAAGG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AACCCCATTGATGGTGAACGGGATTCTGGGGGAGTCAGTAACTCTTCCCCTGGAGTTTCCTGCAGGAGAGAAGG  148

Query 149  TCAACTTCATCACTTGGCTTTTCAATGAAACATCTCTTGCCTTCATAGTACCCCATGAAACCAAAAGTCCCAGA  222
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 149  TCAACTTCATCACTTGGCTTTTCAATGAAACATCTCTTGCCTTCATAGTACCCCATGAAACCAAAAGT-CCAGA  221

Query 223  AATCCACGTGGACTAATCCGAAACAGGGAAAGCGACTGAACTTCACCCAGNNCTACTCCCTGCAACTCAGCAAC  296
           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 222  AATCCACGT-GACTAATCCGAAACAGGGAAAGCGACTGAACTTCACCCAGTCCTACTCCCTGCAACTCAGCAAC  294

Query 297  CTGAAGATGGAAGACACAGGCTCTTACAGAGCCCAGATATCCACAAAGACCTCTGCAAAGCTGTCCAGTTACAC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  CTGAAGATGGAAGACACAGGCTCTTACAGAGCCCAGATATCCACAAAGACCTCTGCAAAGCTGTCCAGTTACAC  368

Query 371  TCTGAGGATATTAAGACAACTGAGGAACATACAAGTTACCAATCACAGTCAGCTATTTCAGAATATGACCTGTG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369  TCTGAGGATATTAAGACAACTGAGGAACATACAAGTTACCAATCACAGTCAGCTATTTCAGAATATGACCTGTG  442

Query 445  AGCTCCATCTGACTTGCTCTGTGGAGGATGCAGATGACAATGTCTCATTCAGATGGGAGGCCTTGGGAAACACA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443  AGCTCCATCTGACTTGCTCTGTGGAGGATGCAGATGACAATGTCTCATTCAGATGGGAGGCCTTGGGAAACACA  516

Query 519  CTTTCAAGTCAGCCAAACCTCACTGTCTCCTGGGACCCCAGGATTTCCAGTGAACAGGACTACACCTGCATAGC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517  CTTTCAAGTCAGCCAAACCTCACTGTCTCCTGGGACCCCAGGATTTCCAGTGAACAGGACTACACCTGCATAGC  590

Query 593  AGAGAATGCTGTCAGTAATTTATCCTTCTCTGTCTCTGCCCAGAAGCTTTGCGAAGATGTTAAAATTCAATATA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591  AGAGAATGCTGTCAGTAATTTATCCTTCTCTGTCTCTGCCCAGAAGCTTTGCGAAGATGTTAAAATTCAATATA  664

Query 667  CAGATACCAAAATGATTCTGTTTATGGTTTCTGGGATATGCATAGTCTTCGGTTTCATCATACTGCTGTTACTT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665  CAGATACCAAAATGATTCTGTTTATGGTTTCTGGGATATGCATAGTCTTCGGTTTCATCATACTGCTGTTACTT  738

Query 741  GTTTTGAGGAAAANNAGAGATTCCCTATCTTTGTCTACTCAGCGAACACAGGGCCCCGAGTCCGCAAGGAACCT  814
           |||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739  GTTTTGAGGAAAAGAAGAGATTCCCTATCTTTGTCTACTCAGCGAACACAGGGCCCCGAGTCCGCAAGGAACCT  812

Query 815  AGAAGTATGTTTCAGTGTCTCCAACGAACAACACTGTGTATGCTTCAGTCACTCATTCAAACAGGGAAACAGAA  888
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813  AG-AGTATGTTTCAGTGTCTCCAACGAACAACACTGTGTATGCTTCAGTCACTCATTCAAACAGGGAAACAGAA  885

Query 889  ATCTGGACACCTAGAGAAAATGATACTATCACAATTTACTCCACAATTAATCATTCCAAAGAGAGTAAACCCAC  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886  ATCTGGACACCTAGAGAAAATGATACTATCACAATTTACTCCACAATTAATCATTCCAAAGAGAGTAAACCCAC  959

Query 963  TTTTTCCAGGGCAACTGCCCTTGACAATGTCGTG  996
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960  TTTTTCCAGGGCAACTGCCCTTGACAATGTCGTG  993