Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15229
- Subject:
- XM_005248842.3
- Aligned Length:
- 1234
- Identities:
- 1202
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGACGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTTGTGCAAAACAGCGCAGACGCCGGGGACATGAGGGCAGGCGTGCAGCTGGAGCCCTTCCTGCACCAGGT 74
Query 75 CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGGGGGCACATGAGCGTGATGAAGTATGACGAGCATACGGTGTGCAAGCCCCTCGTCTCCCGGGAGCAGAGGT 148
Query 149 TCTATGAATCCCTGCCGCTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTATGAATCCCTGCCGCTGGCCATGAAGCGGTTCACCCCACAGTACAAAGGTACCGTCACAGTGCACCTCTGG 222
Query 223 AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGACAGCACAGGCCATCTCAGCTTGGTTGCCAACCCAGTGAAGGAGAGCCAGGAGCCCTTCAAGGTCTCCAC 296
Query 297 AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCCAGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGTCGGCGGCGGTGGCCATATGGCAGACGCTCCAGCAGACCACCGGCAGCAATGGCAGCGACTGCACCCTTG 370
Query 371 CCCAGTGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAGCCCGGCCAAGGCTCTTCTGAGGTCCGAGCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCAGTGGCCGCATGCCCAGCTGGCACGCTCACCCAAGGAGAGCCCGGCCAAGGCTCTTCTGAGGTCCGAGCCC 444
Query 445 CACCTNANCANTCCCANCCTTNTCGNTGGTNGAAGGACACCAACGGAAACCAGGTTGAGAGGAAGAGCTTNAAC 518
|||||.|.||.| |||.||||.|||.||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 445 CACCTCAACACT-CCAGCCTTCTCGCTGGTGGAA-GACACCAACGGAAACCAGGTTGAGAGGAAGAGCTTCAAC 516
Query 519 CCGTGGGNCNNNNAATGCCACCAGNCCCACNTGACCCCGCCTGTGCTCNNAGTACCCANAGAACAAGCGGGCAT 592
|||||||.|....|||||||||||.|||||.||| |||||||||||||..||||||||.||||||||| |||||
Sbjct 517 CCGTGGGGCCTGCAATGCCACCAGGCCCACCTGA-CCCGCCTGTGCTCCGAGTACCCAGAGAACAAGC-GGCAT 588
Query 593 CGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATNCCTGTGTCCTGGATCTGAAGATGGGGACCCG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 CGGTTCTTGTTGCTGGAAAATGTAGTGTCACAGTACACGCATCCCTGTGTCCTGGATCTGAAGATGGGGACCCG 662
Query 667 GCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGAGCACCTCAGCCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 GCAGCACGGCGATGATGCATCGGAGGAGAAGAAGGCCCGCCACATGAGGAAGTGTGCGCAGAGCACCTCAGCCT 736
Query 741 GCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGNAGTACTTTCTNNNNNAAGACAAGTAC 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.....|||||||||||
Sbjct 737 GCCTGGGTGTGCGCATCTGCGGCATGCAGGTTTATCAAACAGATAAGAAGTACTTTCTCTGCAAAGACAAGTAC 810
Query 815 TATGGNAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGGAAGCCACCTCCG 888
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 TATGGAAGAAAACTCTCAGTGGAGGGGTTCAGACAAGCCCTCTATCAGTTCCTACATAATGGAAGCCACCTCCG 884
Query 889 GAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCCATCATTAGGAGCCAGAGTTCATACC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 GAGGGAGCTCCTGGAGCCCATCCTGCACCAGCTCCGGGCCCTCCTCTCTGTCATTAGGAGCCAGAGTTCATACC 958
Query 963 GCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCAGGCAGCCCGCAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GCTTCTATTCCAGCTCTCTCCTTGTCATCTATGATGGGCAGGAACCACCAGAAAGAGCCCCAGGCAGCCCGCAT 1032
Query 1037 CCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACATCCGCATGATTGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 CCTCACGAGGCTCCCCAGGCAGCCCACGGTAGCTCTCCCGGTGGTCTCACCAAGGTTGACATCCGCATGATTGA 1106
Query 1111 CTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACCCTGGCTATATTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 CTTTGCTCATACCACATACAAGGGCTACTGGAATGAGCACACCACCTACGATGGACCAGACCCTGGCTATATTT 1180
Query 1185 TTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 TTGGCCTGGAAAACCTCATCAGGATCCTGCAGGATATCCAAGAGGGAGAA 1230