Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15236
- Subject:
- NM_001364731.1
- Aligned Length:
- 1812
- Identities:
- 1538
- Gaps:
- 183
Alignment
Query 1 ATGGACCC------AGTGGCTTTTAAGGATGTGGCT-GTGA----------ACTTC----ACCCA------GGA 47
||| ||| |||..| ||||.||| | |.|| ||.|| |.||| |||
Sbjct 1 ATG--CCCTGCTGTAGTCAC-----AGGAGGTG--TAGAGAGGACCCCGGGACATCTGAAAGCCAGGAAATGGA 65
Query 48 GGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGA 121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 GGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACAAGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGA 139
Query 122 CCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGT 195
|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 CCTCTGTAGGAAAAAGTTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGT 213
Query 196 CTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGA 269
|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 214 CTCATAGAAAAGAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGA 287
Query 270 CAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTG 343
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 CAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAATAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTG 361
Query 344 GCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATAT 417
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 362 GCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCCTATGAGTATCAGGAATAT 435
Query 418 GGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAG 491
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 436 GGACCGAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACCACAAAG 509
Query 492 GGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAA 565
||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.||
Sbjct 510 GGATCACACTGGAGAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAACTTTTATTTCCCATTCAAGCATTCAAA 583
Query 566 GACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGA 639
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 584 GACACGTGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAATTTTGTGGGAAAGCCTTCCATTGTCTCAGT 657
Query 640 TTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAG 713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 658 TTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCATATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCCTTTAG 731
Query 714 TTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGA 787
||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.|||||||
Sbjct 732 TTATTCTGCTACCCTTCGAATACACGAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGA 805
Query 788 AAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGACATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAG 861
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 806 AAGCATTTCATAGTCCCAGATGCTATCGTAGACATGAAAGGATTCACACGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAG 879
Query 862 GAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTA 935
||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 880 GAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCAGTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACCCTA 953
Query 936 TGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAG 1009
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 954 TGAATGTACGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAG 1027
Query 1010 AAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATT 1083
||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1028 AAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGGAAAGGCTTTTGTTCTGCCAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAACT 1101
Query 1084 CACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCA 1157
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||..||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1102 CACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCATTCATTCCAGTTCCCTTCGTTATCA 1175
Query 1158 TGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACC 1231
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1176 TGAAAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAGGCCTTCAGATCTTCCTCACACC 1249
Query 1232 TTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATAT 1305
|||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1250 TTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCT 1323
Query 1306 GTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACATAAGAATACACTCTGGAGAAAGACGTTATAAATG 1379
.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1324 ATGAAGAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACGTAAGAATACACTCTGGAGAAAGACCTTATAAATG 1397
Query 1380 TAAGATATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCAAATCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAAC 1453
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 TAAGCTATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCAAATCATTGCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAAC 1471
Query 1454 TCTATGAATGCAAGCAACGTTCAGTAGTTCCTTCAGTAGTTCCAGTTCCTTTTGATATCATGAAAGGACTCACA 1527
|||||||||||||||||.||...|.|| |||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1472 TCTATGAATGCAAGCAATGTGGTGAAG--CCTTCAGTAGTTCCAGTTCCTTTCGATACCATGAAAGGACTCACA 1543
Query 1528 CTGGAGAGAAGCCCTATAAATGCGAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAGCTGTGTCAATCCTTTGAATGCATGGT 1601
||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1544 CTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAGCTGCCTCAGTCCTTCGAATGCATGGT 1617
Query 1602 AGGACTCACCCTGAAGAGAAACCCTATGAGTGTGAGCAATGACGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCACACCTTTG 1675
|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1618 AGGACTCACCCTGAAGATAAACCCTATGAGTGTAAGCAA----------------------------------- 1656
Query 1676 AATACGTGGTAGGACACACAATGGAGAGAAGCCCTATGCATGTAAGGAATGTGGGAAACCCTTCGGATCTGCCC 1749
Sbjct 1657 -------------------------------------------------------------------------- 1656
Query 1750 ATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA 1785
Sbjct 1657 ------------------------------------ 1656