Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15236
• Subject: XM_006722873.4
• Aligned Length: 1854
• Identities: 1549
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------AT------GGA  5
                                                                           ||      |||
Sbjct    1  ATGCCCTGCTGTAGTCACAGGAGGTGTAGAGAGGACCCCGGGACATCTGAAAGCCAGGAAATGATGTTTCAGGA  74

Query    6  CCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGA  79
            |||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAGTGGCCTTTGATGATGTTGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGA  148

Query   80  AACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAAC  153
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  AACTCTACAAGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTGTAGGAAAAAGTTGGAAAGACCAGAAC  222

Query  154  ATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGA  227
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAAAGAAAGTCAATGAAATTAAAGA  296

Query  228  TGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTC  301
            |||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTC  370

Query  302  CTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATC  375
            |||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGAAATAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATC  444

Query  376  AGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAA  449
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAGGTGACATTGGACACAAGGCCTATGAGTATCAGGAATATGGACCGAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAA  518

Query  450  AAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTA  523
            |||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  519  AAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACCACAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCTATGCTTGTA  592

Query  524  AAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCT  597
            |||.||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAATGTGGAAAAACTTTTATTTCCCATTCAAGCATTCAAAGACACGTGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCT  666

Query  598  TATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGG  671
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATAAATGTAAATTTTGTGGGAAAGCCTTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGG  740

Query  672  AGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAA  745
            |||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||
Sbjct  741  AGAGAAACCATATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCTTCGAATACACGAAAGAA  814

Query  746  CTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGA  819
            |||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  815  CTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATGCTATCGTAGA  888

Query  820  CATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTA  893
            ||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  889  CATGAAAGGATTCACACGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCAGTA  962

Query  894  TGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCT  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACCCTATGAATGTACGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCT  1036

Query  968  CTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAA  1041
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  CTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGGAAA  1110

Query 1042  GACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCA  1115
            |.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GGCTTTTGTTCTGCCAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCA  1184

Query 1116  GTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATG  1189
            .|||||||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATGTGGTAAAGCCTTCATTCATTCCAGTTCCCTTCGTTATCATGAAAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATG  1258

Query 1190  AGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAG  1263
            |||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTGTAAGCAATGTGGGAAGGCCTTCAGATCTTCCTCACACCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAG  1332

Query 1264  AAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACA  1337
            ||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGCCCTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTATGAAGAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACA  1406

Query 1338  AACACACATAAGAATACACTCTGGAGAAAGACGTTATAAATGTAAGATATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCA  1411
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AACACACGTAAGAATACACTCTGGAGAAAGACCTTATAAATGTAAGCTATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCA  1480

Query 1412  AATCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAACGTTCAGTAGTTCCT  1485
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||...|.||  |||
Sbjct 1481  AATCATTGCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAATGTGGTGAAG--CCT  1552

Query 1486  TCAGTAGTTCCAGTTCCTTTTGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAGCCCTATAAATGCGAGCAATGT  1559
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1553  TCAGTAGTTCCAGTTCCTTTCGATACCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGT  1626

Query 1560  GGGAAAGCCTTCAGAGCTGTGTCAATCCTTTGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGAGAAACCCTATGAGTG  1633
            |||||||||||||||||||..|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1627  GGGAAAGCCTTCAGAGCTGCCTCAGTCCTTCGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGATAAACCCTATGAGTG  1700

Query 1634  TGAGCAATGACGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCACACCTTTGAATACGTGGTAGGACACACAATGGAGAGAAGC  1707
            |.|||||                                                                   
Sbjct 1701  TAAGCAA-------------------------------------------------------------------  1707

Query 1708  CCTATGCATGTAAGGAATGTGGGAAACCCTTCGGATCTGCCCATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACA  1781
                                                                                      
Sbjct 1708  --------------------------------------------------------------------------  1707

Query 1782  CACA  1785
                
Sbjct 1708  ----  1707