Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15246
• Subject: NM_173491.4
• Aligned Length: 1086
• Identities: 1077
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGAGGAGCGGGAGCGGGCCCGNGGGGCGAGGTCGGCTGGCGCCGGGAGCCCCGCGCGCCCGCCCAGCCCGCG  74
            ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAGCGGGAGCGG------GGGGCGAGGTCGGCTGGCGCCGGGAGCCCCGCGCGCCCGCCCAGCCCGCG  68

Query   75  GCTGGATGTCAGCTCTGACAGCTTCGACCCGCTGCTGGCCCTGTACGCGCCCCGCCTGCCTCCCATTCCCTACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  GCTGGATGTCAGCTCTGACAGCTTCGACCCGCTGCTGGCCCTGTACGCGCCCCGCCTGCCTCCCATTCCCTACC  142

Query  149  CCAATGCCCCCTGCTTCAACAACGTGGCGGAGTACGAGAGCTTCCTCAGGACCGGAGTCCGGGGCGGCGGGCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  CCAATGCCCCCTGCTTCAACAACGTGGCGGAGTACGAGAGCTTCCTCAGGACCGGAGTCCGGGGCGGCGGGCGC  216

Query  223  GGGCGCGGGCGGGCTCGGGGCGCGGCCGCGGGCTCTGGGGTTCCCGCCGCACCCGGGCCCTCGGGCAGGACTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  GGGCGCGGGCGGGCTCGGGGCGCGGCCGCGGGCTCTGGGGTTCCCGCCGCACCCGGGCCCTCGGGCAGGACTCG  290

Query  297  TCGCCGCCCGGACGCGCCCGCCCCGGACCCCGAGCGCATCCAGCGCCTCCGCCGTCTCATGGTGGCCAAAGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  TCGCCGCCCGGACGCGCCCGCCCCGGACCCCGAGCGCATCCAGCGCCTCCGCCGTCTCATGGTGGCCAAAGAGG  364

Query  371  AAGGGGACGGGGGAGCGGGAGCGGGCCGGAGGGGTCCGGGTCGGAGCAGGAAGGCGCCACGCAACGTGCTCACG  444
            ||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  AAGGGGACGGGGCCGCAGGAGCGGGCCGGAGGGGTCCGGGTCGGAGCAGGAAGGCGCCACGCAACGTGCTCACG  438

Query  445  CGAATGCCCTTGCACGAAGGCAGCCCTCTGGGTGAACTCCATCGCTGTATCCGTGAGGGGGTGAAGGTGAATGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  CGAATGCCCTTGCACGAAGGCAGCCCTCTGGGTGAACTCCATCGCTGTATCCGTGAGGGGGTGAAGGTGAATGT  512

Query  519  TCACATCCGCACTTTCAAGGGACTTCGGGGCGTCTGTACAGGCTTCCTTGTTGCATTCGACAAGTTCTGGAATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  TCACATCCGCACTTTCAAGGGACTTCGGGGCGTCTGTACAGGCTTCCTTGTTGCATTCGACAAGTTCTGGAATA  586

Query  593  TGGCACTTACTGATGTGGATGAGACCTACCGAAAACCTGTCCTAGGCAAAGCATATGAACGGGATTCTTCACTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TGGCACTTACTGATGTGGATGAGACCTACCGAAAACCTGTCCTAGGCAAAGCATATGAACGGGATTCTTCACTG  660

Query  667  ACTCTCACTAGGCTATTTGATCGGCTGAAACTTCAAGATTCCTCCAAGAAGGAAGCAGATTCTAAGTCTGCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACTCTCACTAGGCTATTTGATCGGCTGAAACTTCAAGATTCCTCCAAGAAGGAAGCAGATTCTAAGTCTGCAGT  734

Query  741  TGAAGATTCCACTCTGTCTAGATACTCACAGACATCCACTTGGAAGTTGGCTTCAGTGTGGGGAAGAGCAGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  TGAAGATTCCACTCTGTCTAGATACTCACAGACATCCACTTGGAAGTTGGCTTCAGTGTGGGGAAGAGCAGACA  808

Query  815  CTGGCCGGGGCTCACACAAGCGTTCCCGCTCTGTCCCTTCTTCCCTGCAGGCCTCTGCAAGGGAGGAGTCCAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  CTGGCCGGGGCTCACACAAGCGTTCCCGCTCTGTCCCTTCTTCCCTGCAGGCCTCTGCAAGGGAGGAGTCCAGG  882

Query  889  TCAGAGCTGTCAGGGAGGACTACACGGACAGACGGCTCCAGTGTGGGAGGTACCTTTTCCAGGGCTACCACCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TCAGAGCTGTCAGGGAGGACTACACGGACAGACGGCTCCAGTGTGGGAGGTACCTTTTCCAGGGCTACCACCCT  956

Query  963  TTCCAGAGGCCAGTCCCGTAAGAAAAAGCGAAAGCCCAAAGTGGATTACCAGCAGGTATTCACTCGACACATAA  1036
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Sbjct  957  TTCCAGAGGCCAGTCCCGTAAGAAAAAGCGAAAGCCCAAAGTGGATTACCAGCAGGTATTCACTCGACACATAA  1030

Query 1037  ATCAGATTTTCATTCGAGGCGAGAATGTCCTGCTGGTTCATCTTGCACAG  1086
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Sbjct 1031  ATCAGATTTTCATTCGAGGCGAGAATGTCCTGCTGGTTCATCTTGCACAG  1080