Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15247
• Subject: XM_024446659.1
• Aligned Length: 2530
• Identities: 2360
• Gaps: 152

Alignment

Query    1  ATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAAC  74

Query   75  TGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAGA  148

Query  149  CGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTCG  222

Query  223  GACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGGA  296

Query  297  GGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCTG  370

Query  371  GGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATAT  444

Query  445  GTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATCT  518

Query  519  CCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAGG  592

Query  593  CGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTTG  666

Query  667  GATGGCAATGAGATAGAAG-AATCAGTGGACTAGAGATGTGCA--CACCTAATTCACCTTAGTTTGGCC-ACAA  736
            ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  .||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  667  GATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACCTTAGTTTGGCCAACAA  740

Query  737  T-AGATCACGAC-ATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTTCTGAGCAATAACCAGATTGAG  808
            | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTG-TCTGAGCAATAACCAGATTGAG  813

Query  809  ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA  887

Query  883  AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG  961

Query  957  AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT  1035

Query 1031  TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT  1109

Query 1105  TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA  1183

Query 1179  GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCTCCTTATCCCATGCTGATACTA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCCCCTTATCCCATGCTGATACTA  1257

Query 1253  GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA  1331

Query 1327  TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG  1405

Query 1401  ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA  1479

Query 1475  AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG  1553

Query 1549  AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT  1627

Query 1623  ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTATAATAAA  1696
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.||
Sbjct 1628  ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTAT-ATTAA  1700

Query 1697  AATTAATCAGAATTTTCCGGGGATATTTGAATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATG-TGCCTTACAAAAA  1769
            |||||||||||||||||| |||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||.||||
Sbjct 1701  AATTAATCAGAATTTTCC-GGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATGTTGCC-TACCAAAA  1772

Query 1770  ACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATGGAATGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATG  1843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  ACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATG  1846

Query 1844  TAAAGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTGCAT  1917
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  TTAAGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTGCAT  1920

Query 1918  TCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTC  1991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  TCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTC  1994

Query 1992  TATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTC  2065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  TATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTC  2068

Query 2066  AAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGT  2139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  AAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGT  2142

Query 2140  TTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGT  2213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143  TTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGT  2216

Query 2214  TTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCA  2287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217  TTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCA  2290

Query 2288  TTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGC----------------  2345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 2291  TTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGCCAGAAGAGAAAGTGAG  2364

Query 2346  ------------------ACTACCTATACAATCATTTTCACATGAAAAAGAGTCT-----------------CA  2384
                              |.||  ||||||.|.||          |.||||||||                 ||
Sbjct 2365  GGGAAGGGAGCATTTTGGAATA--TATACAGTAAT----------AGAAGAGTCTGCTTGATTTCTGTATTCCA  2426

Query 2385  CCAACACAGACAACACTCGGTCCCAGTCATCAGTCGCCCAGGTTCCAACGTCAAACCCACCCTCCCTCCAATCC  2458
            .||..|.|||                                                                
Sbjct 2427  GCAGGAGAGA----------------------------------------------------------------  2436

Query 2459  CTCAGGGCCGCAGG  2472
                          
Sbjct 2437  --------------  2436