Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15255
• Subject: XM_006526325.3
• Aligned Length: 1801
• Identities: 1518
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ATGCCAGCTTTGTCAACGGGATCTGGGAGTGACACTGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCAGCCCAGCT  74
            ||||||||..||.|.||.|||||.|...|.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCAGCGCTGGCCACAGGATCGGCTTGCGACATGGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCTGCCCAGCT  74

Query   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAAGACCTGACCTTCCTCTGGGATATGTTTGGTGAAAAAAGCCTGCATTCAT  148
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAGGACCTGACCTTCCTCTGGGACGTGTTTGGTGAAAAGAGCCTGCATTCAC  148

Query  149  TGGTAAAGATTCATGAAAAACTACACTACTATGAGAAGCAGAGTCCGGTGCCCATTCTCCATGGTGCGGCGGCC  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TGGTCAAGATTCATGAAAAACTTCACTGCTATGAGAAGCAGAATCCGTTGCCCATTCTCCATGGTGCAGCAGCG  222

Query  223  TTGGCCGATGATCTGGCCGAAGAGCTTCAGAACAAGCCATTAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTACT  296
            |||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TTGGCTGATGATCTGACTGAAGAGCTACAGAACAAGCTACCAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTGCT  296

Query  297  GTCAAAACCCAATGTGAAGGCTTTGCTCTCTGTACATGATACTGTGGCTCAGAAGAATTACGACCCAGTGTTGC  370
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||.||.||||
Sbjct  297  GTCAAAACCCAATGTCAAGGCTTTGCTGTCAGTACATGATACTGTGGCTCAAAAGAGTTATGATCCTGTATTGC  370

Query  371  CTCCTATGCCTGAAGATATTGACGATGAGGAAGACTCAGTAAAAATAATCCGTCTGGTCAAAAATAGAGAACCA  444
            ||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  CTCCCGTGCCTGACGATATTGATGATGAGGAAGACTCTGTGAAAATAATCCGCCTGGTCAAAAATAGCGAGCCC  444

Query  445  CTGGGAGCTACCATTAAGAAGGATGAACAGACCGGGGCGATCATTGTGGCCAGAATCATGAGAGGAGGAGCTGC  518
            |||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||.|||||||.||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  445  CTGGGTGCTACCATTAAAAAAGATGAGCAGACCGGAGCAATCACTGTGGCCCGAATCATGCGGGGAGGAGCTGC  518

Query  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCATGTTGGTGATGAACTTAGGGAAGTCAACGGGATACCAGTGGAGGATAAAAGGC  592
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCACGTGGGTGATGAGCTGAGGGAAGTGAATGGAATCCCAGTGGAAGATAAGAGGC  592

Query  593  CTGAGGAAATAATACAGATTTTGGCTCAGTCTCAGGGAGCAATTACATTTAAGATTATACCCGGCAGCAAAGAG  666
            ||||||||||||||.||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||
Sbjct  593  CTGAGGAAATAATAAAGATTTTGAGTCAGTCCAAGGGAGCAATTACATTTAAGATAATACCCAGCACCAAAGAG  666

Query  667  GAGACACCATCAAAAGAAGGCAAGATGTTTATCAAAGCCCTCTTTGACTATAATCCTAATGAGGATAAAGGCAA  740
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|| .|||||||
Sbjct  667  GAGACACCTTCGAAAGAAGGCAAGATATTTATCAAAGCCCTCTTTGACTACGATCCTAAGGAAGA-CAAGGCAA  739

Query  741  TTCCATGTAAGGAAGCTGGGCTTTCTTTCAAAAAGGGAGATATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGCAACT  814
            |.||.|||||.||.||.|||||.|||||||..|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||.
Sbjct  740  TCCCGTGTAAAGAGGCAGGGCTGTCTTTCAGGAAGGGGGACATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGTGACA  813

Query  815  TGGTGGCAAGCGAAACACGAAGCTGATGCCAACCCCAGGGCAGGCTTGATCCCCTCAAAGCATTTCCAGGAAAG  888
            ||||||||.||.||.||.||||..||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||.|
Sbjct  814  TGGTGGCAGGCTAAGCATGAAGGAGATGCCAACCCCAGAGCGGGCCTGATTCCCTCCAAGCACTTCCAGGAACG  887

Query  889  GAGATTGGCTTTGAGACGACCAGAAATATTGGTTCAGCCCCTGAAAGTTTCCAACAGGAAATCAT---------  953
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||.|||||||||.||||||||         
Sbjct  888  GAGACTGGCTCTGAGACGACCAGAAATAGTAGTTCAGCCTCTGAAACTTTCCAACACGAAATCATATGAGGAAA  961

Query  954  ---------------------------------------------------------------CTGGTTTTAGA  964
                                                                           |||||||||||
Sbjct  962  CAGTTGAATGTGAGGAAATTAAAGACACTGGACATGATGGTAACAACAGCGGAACCTACATAGCTGGTTTTAGA  1035

Query  965  AGAAGATGTCGTCTTAGTAGAAAAGATAAGAAAACAAATAAATCCATGTATGAATGCAAGAAGAGTGATCAGTA  1038
            |||||.|..||||||||.||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1036  AGAAGTTTCCGTCTTAGCAGAAAAAATAAGAAAATAAATAAGTCCATGTATGAATGCAAAAAGAGTGAGCAGTA  1109

Query 1039  CGACACAGCTGACGTACCCACATACGAAGAAGTGACACCGTATCGGCGACAAACTAATGAAAAATACAGACTCG  1112
            .|||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|...||||.||||||||||||.
Sbjct 1110  TGACACGGCAGATGTGCCCACATATGAGGAGGTGACACCCTACCGGCGGCAGATCCATGACAAATACAGACTCA  1183

Query 1113  TTGTCTTGGTTGGTCCCGTGGGAGTAGGGCTGAATGAACTGAAACGAAAGCTGCTGATCAGTGACACCCAGCAC  1186
            |||||.||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||..||||.|||||..|.||||||
Sbjct 1184  TTGTCCTGGTTGGTCCTGTCGGAGTCGGGCTAAATGAGCTGAAGCGAAAGCTATTGATGAGTGATGCACAGCAC  1257

Query 1187  TATGGCGTGACAGTGCCCCATACCACCAGAGCAAGAAGAAGCCAGGAGAGTGATGGTGTTGAATACATTTTCAT  1260
            |||||.||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1258  TATGGTGTGATAGTGCCCCACACCACTAGAGCAAGAAGAAGCCAAGAGAGTGATGGTGTGGAATATATTTTTAT  1331

Query 1261  TTCCAAGCATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTTATTGAATATGGAGAATATAAAAACAACTACT  1334
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1332  TTCCAAACATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTCATTGAGTATGGTGAATATAAAAACAACTATT  1405

Query 1335  ACGGCACAAGTATAGACTCAGTTCGGTCTGTCCTTGCTAAAAACAAAGTTTGTTTGTTGGATGTTCAGCCTCAT  1408
            |.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 1406  ATGGTACAAGTATAGACTCGGTTCGCTCTGTCCTAGCTAAGAACAAGGTTTGTCTGTTGGATGTCCAGCCTCAT  1479

Query 1409  ACAGTGAAGCATTTAAGGACACTAGAATTTAAGCCCTATGTGATATTTATAAAGCCTCCATCAATAGAGCGTTT  1482
            |||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480  ACAGTGAAGCATTTAAGGACACTGGAGTTCAAACCCTATGTGATATTTATAAAACCTCCATCCATAGAGCGTTT  1553

Query 1483  GAGAGAAACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGTGCTGCAAAACCCTTCACAGAAG  1556
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.||||
Sbjct 1554  GAGAGAGACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGGACTGCAAAGCCCTTCACGGAAG  1627

Query 1557  AAGATTTTCAAGAAATGATTAAATCTGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGTCATCTTTTTGACAAAATTATA  1630
            ||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1628  AAGACTTTCAGGAAATGATTAAATCAGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGCCATCTTTTTGACAAAATCATA  1701

Query 1631  ATAAATGATGACCTCACTGTGGCATTCAATGAGCTCAAAACAACTTTTGACAAATTAGAGACAGAGACCCATTG  1704
            ||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||
Sbjct 1702  ATCAATGATGATCTTACTGTGGCATTTAATGAGCTAAAAACAACATTTGACAAACTAGAGACTGATACCCATTG  1775

Query 1705  GGTGCCAGTGAGCTGGTTACATTCA  1729
            |||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1776  GGTCCCAGTGAGTTGGTTACATTCA  1800