Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15255
• Subject: XM_006526327.2
• Aligned Length: 1804
• Identities: 1451
• Gaps: 157

Alignment

Query    1  ATGCCAGCTTTGTCAACGGGATCTGGGAGTGACACTGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCAGCCCAGCT  74
            ||||||||..||.|.||.|||||.|...|.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCAGCGCTGGCCACAGGATCGGCTTGCGACATGGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCTGCCCAGCT  74

Query   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAAGACCTGACCTTCCTCTGGGATATGTTTGGTGAAAAAAGCCTGCATTCAT  148
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAGGACCTGACCTTCCTCTGGGACGTGTTTGGTGAAAAGAGCCTGCATTCAC  148

Query  149  TGGTAAAGATTCATGAAAAACTACACTACTATGAGAAGCAGAGTCCGGTGCCCATTCTCCATGGTGCGGCGGCC  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TGGTCAAGATTCATGAAAAACTTCACTGCTATGAGAAGCAGAATCCGTTGCCCATTCTCCATGGTGCAGCAGCG  222

Query  223  TTGGCCGATGATCTGGCCGAAGAGCTTCAGAACAAGCCATTAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTACT  296
            |||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TTGGCTGATGATCTGACTGAAGAGCTACAGAACAAGCTACCAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTGCT  296

Query  297  GTCAAAACCCAATGTGAAGGCTTTGCTCTCTGTACATGATACTGTGGCTCAGAAGAATTACGACCCAGTGTTGC  370
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||.||.||||
Sbjct  297  GTCAAAACCCAATGTCAAGGCTTTGCTGTCAGTACATGATACTGTGGCTCAAAAGAGTTATGATCCTGTATTGC  370

Query  371  CTCCTATGCCTGAAGATATTGACGATGAGGAAGACTCAGTAAAAATAATCCGTCTGGTCAAAAATAGAGAACCA  444
            ||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  CTCCCGTGCCTGACGATATTGATGATGAGGAAGACTCTGTGAAAATAATCCGCCTGGTCAAAAATAGCGAGCCC  444

Query  445  CTGGGAGCTACCATTAAGAAGGATGAACAGACCGGGGCGATCATTGTGGCCAGAATCATGAGAGGAGGAGCTGC  518
            |||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||.|||||||.||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  445  CTGGGTGCTACCATTAAAAAAGATGAGCAGACCGGAGCAATCACTGTGGCCCGAATCATGCGGGGAGGAGCTGC  518

Query  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCATGTTGGTGATGAACTTAGGGAAGTCAACGGGATACCAGTGGAGGATAAAAGGC  592
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCACGTGGGTGATGAGCTGAGGGAAGTGAATGGAATCCCAGTGGAAGATAAGAGGC  592

Query  593  CTGAGGAAATAATACAGATTTTGGCTCAGTCTCAGGGAGCAATTACATTTAAGATTATACCCGGCAGCAAAGAG  666
            ||||||||||||||.||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||
Sbjct  593  CTGAGGAAATAATAAAGATTTTGAGTCAGTCCAAGGGAGCAATTACATTTAAGATAATACCCAGCACCAAAGAG  666

Query  667  GAGACACCATCAAAAGAAGGCAAGATGTTTATCAAAGCCCTCTTTGACTATAATCCTAATGAGGATAAAGGCAA  740
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|| .|||||||
Sbjct  667  GAGACACCTTCGAAAGAAGGCAAGATATTTATCAAAGCCCTCTTTGACTACGATCCTAAGGAAGA-CAAGGCAA  739

Query  741  TTCCATGTAAGGAAGCTGGGCTTTCTTTCAAAAAGGGAGATATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGCAACT  814
            |.||.|||||.||.||.|||||.|||||||..|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||.
Sbjct  740  TCCCGTGTAAAGAGGCAGGGCTGTCTTTCAGGAAGGGGGACATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGTGACA  813

Query  815  TGGTGGCAAGCGAAACACGAAGCTGATGCCAACCCCAGGGCAGGCTTGATCCCCTCAAAGCATTTCCAGGAAAG  888
            ||||||||.||.||.||.||||..||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||.|
Sbjct  814  TGGTGGCAGGCTAAGCATGAAGGAGATGCCAACCCCAGAGCGGGCCTGATTCCCTCCAAGCACTTCCAGGAACG  887

Query  889  GAGATTGGCTTTGAGACGACCAGAAATATTGGTTCAGCCCCTGAAAGTTTCCAACAGGAAATCAT---------  953
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||.|||||||||.||||||||         
Sbjct  888  GAGACTGGCTCTGAGACGACCAGAAATAGTAGTTCAGCCTCTGAAACTTTCCAACACGAAATCATATGAGGAAA  961

Query  954  ------------------------------------------------------------------CTGGTTTT  961
                                                                              ||||||||
Sbjct  962  CAGTTGAATGTGAGGAAATTAAAGAAGACACTGGACATGATGGTAACAACAGCGGAACCTACATAGCTGGTTTT  1035

Query  962  AGAAGAAGATGTCGTCTTAGTAGAAAAGATAAGAAAACAAATAAATCCATGTATGAATGCAAGAAGAGTGATCA  1035
            ||||||||.|..||||||||.||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1036  AGAAGAAGTTTCCGTCTTAGCAGAAAAAATAAGAAAATAAATAAGTCCATGTATGAATGCAAAAAGAGTGAGCA  1109

Query 1036  GTACGACACAGCTGACGTACCCACATACGAAGAAGTGACACCGTATCGGCGACAAACTAATGAAAAATACAGAC  1109
            |||.|||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|...||||.||||||||||
Sbjct 1110  GTATGACACGGCAGATGTGCCCACATATGAGGAGGTGACACCCTACCGGCGGCAGATCCATGACAAATACAGAC  1183

Query 1110  TCGTTGTCTTGGTTGGTCCCGTGGGAGTAGGGCTGAATGAACTGAAACGAAAGCTGCTGATCAGTGACACCCAG  1183
            ||.|||||.||||||                                                           
Sbjct 1184  TCATTGTCCTGGTTG-----------------------------------------------------------  1198

Query 1184  CACTATGGCGTGACAGTGCCCCATACCACCAGAGCAAGAAGAAGCCAGGAGAGTGATGGTGTTGAATACATTTT  1257
                                  |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1199  ----------------------ACACCACTAGAGCAAGAAGAAGCCAAGAGAGTGATGGTGTGGAATATATTTT  1250

Query 1258  CATTTCCAAGCATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTTATTGAATATGGAGAATATAAAAACAACT  1331
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1251  TATTTCCAAACATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTCATTGAGTATGGTGAATATAAAAACAACT  1324

Query 1332  ACTACGGCACAAGTATAGACTCAGTTCGGTCTGTCCTTGCTAAAAACAAAGTTTGTTTGTTGGATGTTCAGCCT  1405
            |.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||||||||.||||||
Sbjct 1325  ATTATGGTACAAGTATAGACTCGGTTCGCTCTGTCCTAGCTAAGAACAAGGTTTGTCTGTTGGATGTCCAGCCT  1398

Query 1406  CATACAGTGAAGCATTTAAGGACACTAGAATTTAAGCCCTATGTGATATTTATAAAGCCTCCATCAATAGAGCG  1479
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1399  CATACAGTGAAGCATTTAAGGACACTGGAGTTCAAACCCTATGTGATATTTATAAAACCTCCATCCATAGAGCG  1472

Query 1480  TTTGAGAGAAACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGTGCTGCAAAACCCTTCACAG  1553
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.|
Sbjct 1473  TTTGAGAGAGACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGGACTGCAAAGCCCTTCACGG  1546

Query 1554  AAGAAGATTTTCAAGAAATGATTAAATCTGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGTCATCTTTTTGACAAAATT  1627
            |||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1547  AAGAAGACTTTCAGGAAATGATTAAATCAGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGCCATCTTTTTGACAAAATC  1620

Query 1628  ATAATAAATGATGACCTCACTGTGGCATTCAATGAGCTCAAAACAACTTTTGACAAATTAGAGACAGAGACCCA  1701
            |||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 1621  ATAATCAATGATGATCTTACTGTGGCATTTAATGAGCTAAAAACAACATTTGACAAACTAGAGACTGATACCCA  1694

Query 1702  TTGGGTGCCAGTGAGCTGGTTACATTCA  1729
            ||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1695  TTGGGTCCCAGTGAGTTGGTTACATTCA  1722