Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15300
• Subject: NM_001080448.3
• Aligned Length: 3390
• Identities: 3390
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC  74

Query   75  ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC  148

Query  149  CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC  222

Query  223  ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA  296

Query  297  AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG  370

Query  371  TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA  444

Query  445  AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT  518

Query  519  GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA  592

Query  593  TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT  666

Query  667  TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC  740

Query  741  TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC  814

Query  815  CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT  888

Query  889  TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC  962

Query  963  CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG  1036

Query 1037  CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC  1110

Query 1111  CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT  1184

Query 1185  AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA  1258

Query 1259  TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA  1332

Query 1333  TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA  1406

Query 1407  CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG  1480

Query 1481  TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG  1554

Query 1555  AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT  1628

Query 1629  AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC  1702

Query 1703  TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCC  1776

Query 1777  AGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATA  1850

Query 1851  CAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGA  1924

Query 1925  TTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACT  1998

Query 1999  GGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCA  2072

Query 2073  TTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAAT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAAT  2146

Query 2147  TTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGT  2220

Query 2221  AGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGA  2294

Query 2295  TCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAG  2368

Query 2369  AAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGG  2442

Query 2443  TTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAG  2516

Query 2517  ACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACT  2590

Query 2591  TCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTAT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTAT  2664

Query 2665  GTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCT  2738

Query 2739  CTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAG  2812

Query 2813  CCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAG  2886

Query 2887  GTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTA  2960

Query 2961  CAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAA  3034

Query 3035  ATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACC  3108

Query 3109  CTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGG  3182

Query 3183  TGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACC  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACC  3256

Query 3257  TGATTTCAAGAATGAGCATTGATGACATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTC  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  TGATTTCAAGAATGAGCATTGATGACATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTC  3330

Query 3331  AGCAGCATACAGACTTTACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA  3390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  AGCAGCATACAGACTTTACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA  3390