Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_15300
Subject:
NM_007938.2
Aligned Length:
3398
Identities:
3050
Gaps:
16

Alignment

Query    1  ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCG-AAGCAGCTG  73
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||| ||| |||||||||
Sbjct    1  ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCCAGGAGCTCCCCGGCGGCGCAGGCAGCATCGTCC-CCGCAAGCAGCTG  73

Query   74  CACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTC-CCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACC  146
            |.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||..| ||||| ||||||||.||||||||||||||||..|
Sbjct   74  CTCCAGCACCTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGCGCACCGGG-CCTCGCGCGGGGGGCGCCCCGGGACTTC  146

Query  147  CCCTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGA------CGTGGACAAGGACCCCCATCCTA  214
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |.|||...||||||||||..|||
Sbjct  147  CCCTGCGGACCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAGAGCTTGGTTCAGGACCCCCACGCTA  220

Query  215  CCCAGAACACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGG  288
            |...|||||||||.|||||||||.|||||||||.||||||   |||||.||||||.||.|..|||.||||||||
Sbjct  221  CTAGGAACACCTGGCTGCGCTGCTGCCACTTCTTTTTAAG---GAGGAGAAGAGAACCAACCAGAGCCATGGGG  291

Query  289  GGCTGCGAAGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTG  362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||.|.||||||||
Sbjct  292  GGCTGCGAAGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCCCTGCTAACGGCTTGGACCGGCGACTG  365

Query  363  CAGTCACGTCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACAT  436
            ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||.||||||||||||||||
Sbjct  366  CAGTCACGTCTC---CAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACCACAGTGATGGGAGAACTAGGATGGAAAACAT  436

Query  437  ATCCATTAAATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGT  510
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  437  ATCCATTAAATGGGTGGGATGCCATTACTGAAATGGATGAACACAATAGGCCCATACATACATACCAGGTATGC  510

Query  511  AATGTAATGGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTA  584
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  511  AATGTCATGGAACCAAACCAGAACAACTGGCTTCGTACTAACTGGATCTCTCGTGATGCTGCACAGAAAATTTA  584

Query  585  TGTGGAAATGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTA  658
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  585  TGTGGAAATGAAGTTCACACTGAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGTAAAGAAACCTTTA  658

Query  659  ATCTGTTTTATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACA  732
            |.||||.||||||.|||||.|||||.|||||.||.|..|||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct  659  ACCTGTATTATATAGAATCCGATGAATCCCATGGGACAAAATTCAAGCCAAGCCAATATATAAAGATCGACACA  732

Query  733  ATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGA  806
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  733  ATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACTCAGATGGATTTGGGTGACCGCATCCTTAAACTCAACACTGAAATCCGTGA  806

Query  807  GGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAG  880
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  807  GGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGATTTTATTTGGCTTTTCAAGATATTGGAGCATGCATCGCTCTGGTCTCAG  880

Query  881  TCCGTGTTTTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTT  954
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  881  TCCGAGTTTTCTACAAAAAATGCCCCTTCACCGTGCGGAACTTGGCTATGTTTCCTGATACCATCCCAAGGGTT  954

Query  955  GATTCCTCCTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTA  1028
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  955  GATTCTTCCTCTTTGGTTGAAGTGCGGGGCTCATGTGTAAAGAGTGCTGAGGAGCGAGATACTCCTAAACTCTA  1028

Query 1029  TTGTGGAGCTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGG  1102
            .||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1029  CTGTGGAGCTGATGGGGATTGGCTTGTTCCTCTTGGAAGGTGTATCTGCAGTACAGGGTATGAAGAAATCGAGG  1102

Query 1103  GTTCTTGCCATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCA  1176
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1103  GTTCTTGCCATGCTTGCAGACCAGGATTCTACAAAGCATTTGCTGGGAACACAAAATGTTCCAAATGCCCTCCA  1176

Query 1177  CACAGTTTAACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCC  1250
            |||||.|.|||.|||.||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1177  CACAGCTCAACCTACGTGGAAGCAACGTCAGTCTGTCATTGTGAAAAGGGTTACTTCCGGGCAGAAAAAGACCC  1250

Query 1251  ACCTTCTATGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTA  1324
            |||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  ACCTTCTATGGCATGCACTAGACCACCTTCAGCTCCTAGAAATGTGGCTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTA  1324

Query 1325  TTTTGGAATGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGT  1398
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  TTTTGGAATGGAGCCCACCCAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGT  1398

Query 1399  GGCTTAGACACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAA  1472
            ||.||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1399  GGTTTAGACACTACCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACACACTGGACTGATCAA  1472

Query 1473  CAATTCCGTGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTT  1546
            ||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1473  CAATTCTGTGGTAGTACTGGACTTTGTGTCTCACGTCAATTATACCTTTGAAATAGAAGCCATGAATGGAGTTT  1546

Query 1547  CTGAGTTGAGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATA  1620
            ||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1547  CTGAGTTGAGCATCTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACTACAGATCACGATGCACCTTCTCTGATT  1620

Query 1621  GGTGTGGTAAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGG  1694
            |||.||.|.||.||||||||||||||.||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1621  GGTATGATGAGAAAGGACTGGGCATCTCAGAACAGCCTTGCTCTATCGTGGCAAGCACCTGCATTTTCCAATGG  1694

Query 1695  AGCCATTCTGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCA  1768
            |||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1695  AGCTATTCTGGACTATGAGATCAAGTACTACGAGAAAGAGCATGAGCAGCTCACCTATTCCTCCACGAGGTCCA  1768

Query 1769  AAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCG  1842
            |.|||||.||.||||||.||||.||.||.|||||.|||||||..||..|||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1769  AGGCCCCAAGCGTCATCGTCACGGGCCTCAAGCCCGCCACCACGTACATATTTCACATCCGAGTGAGGACGGCG  1842

Query 1843  ACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACA  1916
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1843  ACAGGCTACAGTGGCTACAGTCAGAAGTTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCGGCAGAACA  1916

Query 1917  AGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCT  1990
            |||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||||||.|.|||||||||||..|.||||||.
Sbjct 1917  AGGGCAGATTCTGGTCATAGCCACTGCAGCCGTCGGGGGATTCACTCTCTTAGTCATCCTCACCCTGTTCTTCC  1990

Query 1991  TGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAG  2064
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1991  TCATCACTGGGAGGTGTCAATGGTACATAAAGGCCAAAATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAACTCACTTACAG  2064

Query 2065  AATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGT  2138
            ||.||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065  AACGGCCACCTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACATACATTGATCCAGACACCTATGAAGACCCATCCCTAGCAGT  2138

Query 2139  CCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAG  2212
            |||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2139  CCACGAATTTGCAAAAGAGATTGATCCTTCAAGAATTCGCATTGAGAGAGTGATTGGAGCAGGTGAATTTGGAG  2212

Query 2213  AAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGC  2286
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2213  AAGTCTGCAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGGGAGATCCCAGTTGCAATTAAAACATTGAAAGGTGGC  2286

Query 2287  CACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCAT  2360
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2287  CACATGGACCGACAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGCATCATGGGTCAGTTTGACCACCCAAACATCAT  2360

Query 2361  TCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGA  2434
            ||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2361  TCGCCTAGAAGGTGTTGTCACTAAAAGATCCTTCCCGGCGATTGGGGTGGAAGCCTTCTGCCCCAGCTTCCTAA  2434

Query 2435  GGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCT  2508
            ||||.||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||.|.|..|||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 2435  GGGCTGGGTTTTTAAATGGCATCCAAGCGCCACATCCAGTGACTGCAGGAGGCTCTCTGCCCCCCAGGATTCCT  2508

Query 2509  GCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGA  2582
            ||.||..|.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2509  GCAGGTCGGCCAGTAATGATCGTAGTAGAGTATATGGAGAATGGATCACTGGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGA  2582

Query 2583  TGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATA  2656
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2583  TGGCCACTTCACCGTCATCCAGTTGGTCGGCATGCTGAGGGGCATCGCGTCAGGCATGAAGTATCTTTCTGACA  2656

Query 2657  TGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGAT  2730
            ||||.||||||||||||||.||.||.||..||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2657  TGGGATATGTTCATCGAGATCTTGCCGCGAGGAACATACTGGTGAACAGCAACTTAGTATGCAAGGTCTCTGAT  2730

Query 2731  TTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAG  2804
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||.|
Sbjct 2731  TTTGGTCTCTCCCGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCAGCTTATACAACAACGGGAGGGAAAATCCCTATACG  2804

Query 2805  GTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCA  2878
            ||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2805  GTGGACAGCCCCAGAAGCTATTGCTTACAGAAAGTTCTCCTCAGCCAGTGACGCGTGGAGCTACGGGATTGTCA  2878

Query 2879  TGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAA  2952
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||..|||||||||||
Sbjct 2879  TGTGGGAGGTGATGTCCTATGGAGAGAGACCGTACTGGGAAATGTCCAACCAGGATGTTATCTTGTCCATTGAA  2952

Query 2953  GAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAA  3026
            |||||.|||.|||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2953  GAAGGTTACCGACTTCCTGCTCCGATGGGCTGCCCACCGTCTCTGCACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAA  3026

Query 3027  GGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCC  3100
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 3027  GGAGAGAAACCACAGGCCAAAATTCACTGACATCGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGCAACCCCAGTGCCC  3100

Query 3101  TTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTC  3174
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 3101  TTCACACGCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAATCCCCTGGTGATGTTCCTGAATATCCATTGTTTGTC  3174

Query 3175  ACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAAC  3248
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||.||||||||
Sbjct 3175  ACAGTAGGTGACTGGCTGGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAGTAACTTCATGGCAGCGGGTTTTACAAC  3248

Query 3249  ATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGACATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGAC  3322
            .|||||.|||||||||.||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 3249  GTTTGATCTGATTTCACGAATGAGCATCGATGATATTAGGCGAATTGGAGTCATTCTCATTGGACATCAGAGAC  3322

Query 3323  GAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA  3390
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 3323  GAATAGTCAGCAGCATACAAACTTTACGTTTACATATGATGCACATACAGGAAAAAGGATTTCATGTA  3390