Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15300
- Subject:
- NM_007938.2
- Aligned Length:
- 3398
- Identities:
- 3050
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCG-AAGCAGCTG 73
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||| ||| |||||||||
Sbjct 1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCCAGGAGCTCCCCGGCGGCGCAGGCAGCATCGTCC-CCGCAAGCAGCTG 73
Query 74 CACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTC-CCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACC 146
|.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||..| ||||| ||||||||.||||||||||||||||..|
Sbjct 74 CTCCAGCACCTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGCGCACCGGG-CCTCGCGCGGGGGGCGCCCCGGGACTTC 146
Query 147 CCCTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGA------CGTGGACAAGGACCCCCATCCTA 214
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|||...||||||||||..|||
Sbjct 147 CCCTGCGGACCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGAGAGCTTGGTTCAGGACCCCCACGCTA 220
Query 215 CCCAGAACACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGG 288
|...|||||||||.|||||||||.|||||||||.|||||| |||||.||||||.||.|..|||.||||||||
Sbjct 221 CTAGGAACACCTGGCTGCGCTGCTGCCACTTCTTTTTAAG---GAGGAGAAGAGAACCAACCAGAGCCATGGGG 291
Query 289 GGCTGCGAAGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTG 362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||.|.||||||||
Sbjct 292 GGCTGCGAAGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCCCTGCTAACGGCTTGGACCGGCGACTG 365
Query 363 CAGTCACGTCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACAT 436
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 366 CAGTCACGTCTC---CAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACCACAGTGATGGGAGAACTAGGATGGAAAACAT 436
Query 437 ATCCATTAAATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGT 510
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 437 ATCCATTAAATGGGTGGGATGCCATTACTGAAATGGATGAACACAATAGGCCCATACATACATACCAGGTATGC 510
Query 511 AATGTAATGGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTA 584
|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 511 AATGTCATGGAACCAAACCAGAACAACTGGCTTCGTACTAACTGGATCTCTCGTGATGCTGCACAGAAAATTTA 584
Query 585 TGTGGAAATGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTA 658
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 585 TGTGGAAATGAAGTTCACACTGAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGTAAAGAAACCTTTA 658
Query 659 ATCTGTTTTATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACA 732
|.||||.||||||.|||||.|||||.|||||.||.|..|||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct 659 ACCTGTATTATATAGAATCCGATGAATCCCATGGGACAAAATTCAAGCCAAGCCAATATATAAAGATCGACACA 732
Query 733 ATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGA 806
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 733 ATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACTCAGATGGATTTGGGTGACCGCATCCTTAAACTCAACACTGAAATCCGTGA 806
Query 807 GGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAG 880
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 807 GGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGATTTTATTTGGCTTTTCAAGATATTGGAGCATGCATCGCTCTGGTCTCAG 880
Query 881 TCCGTGTTTTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTT 954
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 881 TCCGAGTTTTCTACAAAAAATGCCCCTTCACCGTGCGGAACTTGGCTATGTTTCCTGATACCATCCCAAGGGTT 954
Query 955 GATTCCTCCTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTA 1028
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 955 GATTCTTCCTCTTTGGTTGAAGTGCGGGGCTCATGTGTAAAGAGTGCTGAGGAGCGAGATACTCCTAAACTCTA 1028
Query 1029 TTGTGGAGCTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGG 1102
.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1029 CTGTGGAGCTGATGGGGATTGGCTTGTTCCTCTTGGAAGGTGTATCTGCAGTACAGGGTATGAAGAAATCGAGG 1102
Query 1103 GTTCTTGCCATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCA 1176
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1103 GTTCTTGCCATGCTTGCAGACCAGGATTCTACAAAGCATTTGCTGGGAACACAAAATGTTCCAAATGCCCTCCA 1176
Query 1177 CACAGTTTAACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCC 1250
|||||.|.|||.|||.||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1177 CACAGCTCAACCTACGTGGAAGCAACGTCAGTCTGTCATTGTGAAAAGGGTTACTTCCGGGCAGAAAAAGACCC 1250
Query 1251 ACCTTCTATGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTA 1324
|||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 ACCTTCTATGGCATGCACTAGACCACCTTCAGCTCCTAGAAATGTGGCTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTA 1324
Query 1325 TTTTGGAATGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGT 1398
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 TTTTGGAATGGAGCCCACCCAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGT 1398
Query 1399 GGCTTAGACACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAA 1472
||.||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1399 GGTTTAGACACTACCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACACACTGGACTGATCAA 1472
Query 1473 CAATTCCGTGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTT 1546
||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1473 CAATTCTGTGGTAGTACTGGACTTTGTGTCTCACGTCAATTATACCTTTGAAATAGAAGCCATGAATGGAGTTT 1546
Query 1547 CTGAGTTGAGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATA 1620
||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1547 CTGAGTTGAGCATCTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACTACAGATCACGATGCACCTTCTCTGATT 1620
Query 1621 GGTGTGGTAAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGG 1694
|||.||.|.||.||||||||||||||.||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1621 GGTATGATGAGAAAGGACTGGGCATCTCAGAACAGCCTTGCTCTATCGTGGCAAGCACCTGCATTTTCCAATGG 1694
Query 1695 AGCCATTCTGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCA 1768
|||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1695 AGCTATTCTGGACTATGAGATCAAGTACTACGAGAAAGAGCATGAGCAGCTCACCTATTCCTCCACGAGGTCCA 1768
Query 1769 AAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCG 1842
|.|||||.||.||||||.||||.||.||.|||||.|||||||..||..|||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1769 AGGCCCCAAGCGTCATCGTCACGGGCCTCAAGCCCGCCACCACGTACATATTTCACATCCGAGTGAGGACGGCG 1842
Query 1843 ACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACA 1916
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1843 ACAGGCTACAGTGGCTACAGTCAGAAGTTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCGGCAGAACA 1916
Query 1917 AGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCT 1990
|||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||||||.|.|||||||||||..|.||||||.
Sbjct 1917 AGGGCAGATTCTGGTCATAGCCACTGCAGCCGTCGGGGGATTCACTCTCTTAGTCATCCTCACCCTGTTCTTCC 1990
Query 1991 TGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAG 2064
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1991 TCATCACTGGGAGGTGTCAATGGTACATAAAGGCCAAAATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAACTCACTTACAG 2064
Query 2065 AATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGT 2138
||.||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 AACGGCCACCTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACATACATTGATCCAGACACCTATGAAGACCCATCCCTAGCAGT 2138
Query 2139 CCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAG 2212
|||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2139 CCACGAATTTGCAAAAGAGATTGATCCTTCAAGAATTCGCATTGAGAGAGTGATTGGAGCAGGTGAATTTGGAG 2212
Query 2213 AAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGC 2286
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2213 AAGTCTGCAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGGGAGATCCCAGTTGCAATTAAAACATTGAAAGGTGGC 2286
Query 2287 CACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCAT 2360
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2287 CACATGGACCGACAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGCATCATGGGTCAGTTTGACCACCCAAACATCAT 2360
Query 2361 TCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGA 2434
||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2361 TCGCCTAGAAGGTGTTGTCACTAAAAGATCCTTCCCGGCGATTGGGGTGGAAGCCTTCTGCCCCAGCTTCCTAA 2434
Query 2435 GGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCT 2508
||||.||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||.|.|..|||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 2435 GGGCTGGGTTTTTAAATGGCATCCAAGCGCCACATCCAGTGACTGCAGGAGGCTCTCTGCCCCCCAGGATTCCT 2508
Query 2509 GCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGA 2582
||.||..|.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2509 GCAGGTCGGCCAGTAATGATCGTAGTAGAGTATATGGAGAATGGATCACTGGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGA 2582
Query 2583 TGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATA 2656
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2583 TGGCCACTTCACCGTCATCCAGTTGGTCGGCATGCTGAGGGGCATCGCGTCAGGCATGAAGTATCTTTCTGACA 2656
Query 2657 TGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGAT 2730
||||.||||||||||||||.||.||.||..||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2657 TGGGATATGTTCATCGAGATCTTGCCGCGAGGAACATACTGGTGAACAGCAACTTAGTATGCAAGGTCTCTGAT 2730
Query 2731 TTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAG 2804
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||.|
Sbjct 2731 TTTGGTCTCTCCCGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCAGCTTATACAACAACGGGAGGGAAAATCCCTATACG 2804
Query 2805 GTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCA 2878
||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 2805 GTGGACAGCCCCAGAAGCTATTGCTTACAGAAAGTTCTCCTCAGCCAGTGACGCGTGGAGCTACGGGATTGTCA 2878
Query 2879 TGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAA 2952
||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||..|||||||||||
Sbjct 2879 TGTGGGAGGTGATGTCCTATGGAGAGAGACCGTACTGGGAAATGTCCAACCAGGATGTTATCTTGTCCATTGAA 2952
Query 2953 GAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAA 3026
|||||.|||.|||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2953 GAAGGTTACCGACTTCCTGCTCCGATGGGCTGCCCACCGTCTCTGCACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAA 3026
Query 3027 GGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCC 3100
|||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 3027 GGAGAGAAACCACAGGCCAAAATTCACTGACATCGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGCAACCCCAGTGCCC 3100
Query 3101 TTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTC 3174
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 3101 TTCACACGCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAATCCCCTGGTGATGTTCCTGAATATCCATTGTTTGTC 3174
Query 3175 ACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAAC 3248
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||.||||||||
Sbjct 3175 ACAGTAGGTGACTGGCTGGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAGTAACTTCATGGCAGCGGGTTTTACAAC 3248
Query 3249 ATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGACATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGAC 3322
.|||||.|||||||||.||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 3249 GTTTGATCTGATTTCACGAATGAGCATCGATGATATTAGGCGAATTGGAGTCATTCTCATTGGACATCAGAGAC 3322
Query 3323 GAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 3390
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 3323 GAATAGTCAGCAGCATACAAACTTTACGTTTACATATGATGCACATACAGGAAAAAGGATTTCATGTA 3390