Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15300
- Subject:
- XM_006521787.2
- Aligned Length:
- 3390
- Identities:
- 2633
- Gaps:
- 468
Alignment
Query 1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT 518
|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 ------------------------ATGGATGAACACAATAGGCCCATACATACATACCAGGTATGCAATGTCAT 50
Query 519 GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA 592
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 51 GGAACCAAACCAGAACAACTGGCTTCGTACTAACTGGATCTCTCGTGATGCTGCACAGAAAATTTATGTGGAAA 124
Query 593 TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT 666
||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||.|
Sbjct 125 TGAAGTTCACACTGAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGTAAAGAAACCTTTAACCTGTAT 198
Query 667 TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC 740
|||||.|||||.|||||.|||||.||.|..|||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 199 TATATAGAATCCGATGAATCCCATGGGACAAAATTCAAGCCAAGCCAATATATAAAGATCGACACAATTGCTGC 272
Query 741 TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC 814
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 273 TGATGAGAGTTTTACTCAGATGGATTTGGGTGACCGCATCCTTAAACTCAACACTGAAATCCGTGAGGTGGGGC 346
Query 815 CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT 888
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 347 CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATTTGGCTTTTCAAGATATTGGAGCATGCATCGCTCTGGTCTCAGTCCGAGTT 420
Query 889 TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC 962
||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 421 TTCTACAAAAAATGCCCCTTCACCGTGCGGAACTTGGCTATGTTTCCTGATACCATCCCAAGGGTTGATTCTTC 494
Query 963 CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG 1036
|||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 495 CTCTTTGGTTGAAGTGCGGGGCTCATGTGTAAAGAGTGCTGAGGAGCGAGATACTCCTAAACTCTACTGTGGAG 568
Query 1037 CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC 1110
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 569 CTGATGGGGATTGGCTTGTTCCTCTTGGAAGGTGTATCTGCAGTACAGGGTATGAAGAAATCGAGGGTTCTTGC 642
Query 1111 CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT 1184
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|.
Sbjct 643 CATGCTTGCAGACCAGGATTCTACAAAGCATTTGCTGGGAACACAAAATGTTCCAAATGCCCTCCACACAGCTC 716
Query 1185 AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA 1258
|||.|||.||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 717 AACCTACGTGGAAGCAACGTCAGTCTGTCATTGTGAAAAGGGTTACTTCCGGGCAGAAAAAGACCCACCTTCTA 790
Query 1259 TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 1332
|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 TGGCATGCACTAGACCACCTTCAGCTCCTAGAAATGTGGCTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 864
Query 1333 TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA 1406
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 865 TGGAGCCCACCCAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGTTTAGA 938
Query 1407 CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG 1480
|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 939 CACTACCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACACACTGGACTGATCAACAATTCTG 1012
Query 1481 TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 1554
||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 TGGTAGTACTGGACTTTGTGTCTCACGTCAATTATACCTTTGAAATAGAAGCCATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 1086
Query 1555 AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT 1628
||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||.||.|
Sbjct 1087 AGCATCTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACTACAGATCACGATGCACCTTCTCTGATTGGTATGAT 1160
Query 1629 AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC 1702
.||.||||||||||||||.||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1161 GAGAAAGGACTGGGCATCTCAGAACAGCCTTGCTCTATCGTGGCAAGCACCTGCATTTTCCAATGGAGCTATTC 1234
Query 1703 TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCC 1776
|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1235 TGGACTATGAGATCAAGTACTACGAGAAAGAGCATGAGCAGCTCACCTATTCCTCCACGAGGTCCAAGGCCCCA 1308
Query 1777 AGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATA 1850
||.||||||.||||.||.||.|||||.|||||||..||..|||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1309 AGCGTCATCGTCACGGGCCTCAAGCCCGCCACCACGTACATATTTCACATCCGAGTGAGGACGGCGACAGGCTA 1382
Query 1851 CAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGA 1924
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1383 CAGTGGCTACAGTCAGAAGTTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCGGCAGAACAAGGGCAGA 1456
Query 1925 TTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACT 1998
||||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||||||.|.|||||||||||..|.||||||.|.||||||
Sbjct 1457 TTCTGGTCATAGCCACTGCAGCCGTCGGGGGATTCACTCTCTTAGTCATCCTCACCCTGTTCTTCCTCATCACT 1530
Query 1999 GGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCA 2072
|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||.||
Sbjct 1531 GGGAGGTGTCAATGGTACATAAAGGCCAAAATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAACTCACTTACAGAACGGCCA 1604
Query 2073 TTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAAT 2146
..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1605 CCTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACATACATTGATCCAGACACCTATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCACGAAT 1678
Query 2147 TTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGT 2220
|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1679 TTGCAAAAGAGATTGATCCTTCAAGAATTCGCATTGAGAGAGTGATTGGAGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGC 1752
Query 2221 AGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGA 2294
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1753 AGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGGGAGATCCCAGTTGCAATTAAAACATTGAAAGGTGGCCACATGGA 1826
Query 2295 TCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAG 2368
.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1827 CCGACAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGCATCATGGGTCAGTTTGACCACCCAAACATCATTCGCCTAG 1900
Query 2369 AAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGG 2442
||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1901 AAGGTGTTGTCACTAAAAGATCCTTCCCGGCGATTGGGGTGGAAGCCTTCTGCCCCAGCTTCCTAAGGGCTGGG 1974
Query 2443 TTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAG 2516
|||||||||.|||||||.||.||.|||||||||.|.|..|||||.|||.|||||||||||||||||||.||..|
Sbjct 1975 TTTTTAAATGGCATCCAAGCGCCACATCCAGTGACTGCAGGAGGCTCTCTGCCCCCCAGGATTCCTGCAGGTCG 2048
Query 2517 ACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACT 2590
.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049 GCCAGTAATGATCGTAGTAGAGTATATGGAGAATGGATCACTGGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACT 2122
Query 2591 TCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTAT 2664
||||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2123 TCACCGTCATCCAGTTGGTCGGCATGCTGAGGGGCATCGCGTCAGGCATGAAGTATCTTTCTGACATGGGATAT 2196
Query 2665 GTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCT 2738
|||||||||||.||.||.||..||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2197 GTTCATCGAGATCTTGCCGCGAGGAACATACTGGTGAACAGCAACTTAGTATGCAAGGTCTCTGATTTTGGTCT 2270
Query 2739 CTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAG 2812
||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 2271 CTCCCGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCAGCTTATACAACAACGGGAGGGAAAATCCCTATACGGTGGACAG 2344
Query 2813 CCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAG 2886
||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2345 CCCCAGAAGCTATTGCTTACAGAAAGTTCTCCTCAGCCAGTGACGCGTGGAGCTACGGGATTGTCATGTGGGAG 2418
Query 2887 GTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTA 2960
||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||||||||.||
Sbjct 2419 GTGATGTCCTATGGAGAGAGACCGTACTGGGAAATGTCCAACCAGGATGTTATCTTGTCCATTGAAGAAGGTTA 2492
Query 2961 CAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAA 3034
|.|||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2493 CCGACTTCCTGCTCCGATGGGCTGCCCACCGTCTCTGCACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAA 2566
Query 3035 ATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACC 3108
|.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2567 ACCACAGGCCAAAATTCACTGACATCGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGCAACCCCAGTGCCCTTCACACG 2640
Query 3109 CTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGG 3182
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2641 CTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAATCCCCTGGTGATGTTCCTGAATATCCATTGTTTGTCACAGTAGG 2714
Query 3183 TGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACC 3256
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2715 TGACTGGCTGGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAGTAACTTCATGGCAGCGGGTTTTACAACGTTTGATC 2788
Query 3257 TGATTTCAAGAATGAGCATTGATGACATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTC 3330
||||||||.||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2789 TGATTTCACGAATGAGCATCGATGATATTAGGCGAATTGGAGTCATTCTCATTGGACATCAGAGACGAATAGTC 2862
Query 3331 AGCAGCATACAGACTTTACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 3390
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2863 AGCAGCATACAAACTTTACGTTTACATATGATGCACATACAGGAAAAAGGATTTCATGTA 2922