Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15300
- Subject:
- XM_006713592.3
- Aligned Length:
- 3438
- Identities:
- 3390
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC 74
Query 75 ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC 148
Query 149 CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC 222
Query 223 ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA 296
Query 297 AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG 370
Query 371 TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA 444
Query 445 AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT 518
Query 519 GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA 592
Query 593 TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT 666
Query 667 TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC 740
Query 741 TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC 814
Query 815 CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT 888
Query 889 TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC 962
Query 963 CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG 1036
Query 1037 CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC 1110
Query 1111 CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT 1184
Query 1185 AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA 1258
Query 1259 TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 1332
Query 1333 TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA 1406
Query 1407 CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG 1480
Query 1481 TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 1554
Query 1555 AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT 1628
Query 1629 AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC 1702
Query 1703 TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGA----------------------------------------------- 1729
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGTCTACCCACGGATAGCGCCGGCATTTTGGCACTACCTGCGGGTA 1776
Query 1730 -AAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC 1802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC 1850
Query 1803 AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT 1924
Query 1877 TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT 1998
Query 1951 GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC 2072
Query 2025 CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT 2146
Query 2099 ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA 2172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA 2220
Query 2173 ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA 2246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA 2294
Query 2247 AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG 2320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG 2368
Query 2321 AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC 2442
Query 2395 CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA 2516
Query 2469 TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA 2542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA 2590
Query 2543 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG 2616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG 2664
Query 2617 CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA 2690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA 2738
Query 2691 TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG 2764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG 2812
Query 2765 AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA 2838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA 2886
Query 2839 TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA 2912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA 2960
Query 2913 TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC 2986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC 3034
Query 2987 CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT 3108
Query 3061 GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC 3134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC 3182
Query 3135 AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG 3208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG 3256
Query 3209 GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC 3330
Query 3283 ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA 3356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA 3404
Query 3357 CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 3438