Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15300
• Subject: XM_017006213.1
• Aligned Length: 3438
• Identities: 2922
• Gaps: 516

Alignment

Query    1  ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT  518
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT  50

Query  519  GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   51  GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA  124

Query  593  TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125  TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT  198

Query  667  TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC  272

Query  741  TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  273  TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC  346

Query  815  CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  347  CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT  420

Query  889  TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC  494

Query  963  CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495  CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG  568

Query 1037  CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  569  CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC  642

Query 1111  CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT  716

Query 1185  AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA  790

Query 1259  TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA  864

Query 1333  TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA  938

Query 1407  CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG  1012

Query 1481  TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG  1086

Query 1555  AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT  1160

Query 1629  AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC  1234

Query 1703  TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGA-----------------------------------------------  1729
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 1235  TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGTCTACCCACGGATAGCGCCGGCATTTTGGCACTACCTGCGGGTA  1308

Query 1730  -AAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC  1802
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309  GAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC  1382

Query 1803  AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT  1876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383  AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT  1456

Query 1877  TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT  1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457  TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT  1530

Query 1951  GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC  2024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531  GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC  1604

Query 2025  CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT  2098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1605  CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT  1678

Query 2099  ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA  2172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679  ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA  1752

Query 2173  ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA  2246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753  ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA  1826

Query 2247  AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG  2320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827  AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG  1900

Query 2321  AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC  2394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901  AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC  1974

Query 2395  CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA  2468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975  CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA  2048

Query 2469  TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA  2542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049  TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA  2122

Query 2543  TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG  2616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2123  TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG  2196

Query 2617  CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA  2690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197  CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA  2270

Query 2691  TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG  2764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271  TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG  2344

Query 2765  AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA  2838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2345  AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA  2418

Query 2839  TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA  2912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2419  TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA  2492

Query 2913  TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC  2986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2493  TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC  2566

Query 2987  CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT  3060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567  CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT  2640

Query 3061  GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC  3134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641  GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC  2714

Query 3135  AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG  3208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2715  AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG  2788

Query 3209  GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC  3282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2789  GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC  2862

Query 3283  ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA  3356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2863  ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA  2936

Query 3357  CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA  3390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2937  CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA  2970