Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15308
• Subject: NM_001009565.2
• Aligned Length: 951
• Identities: 942
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAAAAGTATGAAAAATTAGCTAAGACTGGAGAAGGGTCTTATGGGGTTGTATTCAAATGCAGAAACAAAAC  74

Query  75  CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CTCTGGACAAGTAGTAGCTGTTAAAAAATTTGTGGAATCTGAAGATGATCCTGTTGTTAAGAAAATAGCACTAA  148

Query 149  GAGAAATACGTATGTTGAAGCAAATTAAAACAATNCCAAATCTTGTGAACCTCATCGAAGGTGTTCAGGAGAAA  222
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||  .|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 149  GAGAAATACGTATGTTGAAGC-AATTAAAACA--TCCAAATCTTGTGAACCTCATCG-AGGTGTTCAGGAG-AA  217

Query 223  AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218  AAAGGAAAATGCATTTAGTTTTTGAATACTGTGATCATACACTTTTAAATGAGCTGGAAAGAAACCCAAATGGA  291

Query 297  GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292  GTTGCTGATGGAGTGATCAAAAGCGTATTATGGCAAACACTTCAAGCTCTTAATTTCTGTCATATACATAACTG  365

Query 371  TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366  TATTCACAGAGATATAAAACCTGAAAATATTCTAATAACTAAGCAAGGAATAATCAAGATTTGTGACTTCGGGT  439

Query 445  TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440  TTGCACAAATTCTGATTCCAGGAGATGCCTACACCGATTATGTAGCTACGAGATGGTACCGAGCTCCTGAACTT  513

Query 519  CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514  CTTGTGGGAGATACTCAGTATGGTTCTTCAGTCGATATATGGGCTATTGGTTGTGTTTTTGCAGAGCTCCTGAC  587

Query 593  AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588  AGGCCAGCCACTGTGGCCTGGAAAATCAGATGTGGACCAACTTTATCTGATAATCAGAACACTAGGAAAATTAA  661

Query 667  TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662  TCCCAAGACATCAATCAATCTTTAAAAGTAACGGGTTTTTCCATGGCATCAGTATACCTGAGCCAGAAGACATG  735

Query 741  GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGCTTCTGAACTTCATGAANGGNTGTCTGAAGATGA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 736  GAAACTCTTGAGGAAAAGTTCTCAGATGTTCATCCTGTGGC-TCTGAACTTCATGAAGGGGTGTCTGAAGATGA  808

Query 815  ATCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809  ATCCAGATGACAGATTAACCTGTTCCCAACTCCTGGAGAGCTCCTACTTTGATTCTTTTCAAGAGGCCCAAATT  882

Query 889  AAAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAGGTACTTCCGCTCAAAAGT  951
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883  AAAAGAAAAGCACGTAATGAAGGAAGAAACAGAAGACGCCAACAGGTACTTCCGCTCAAAAGT  945