Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15319
- Subject:
- XM_017026790.2
- Aligned Length:
- 1135
- Identities:
- 879
- Gaps:
- 256
Alignment
Query 1 ATGCATAATCTGTATTCCATCACTGGGTACCCGGACCCACCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGA 222
|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------ATGGAGGAGGAGGAGGA 17
Query 223 GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA 91
Query 297 GACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTGGAC 370
|||||||||||| |||||||||||
Sbjct 92 GACCTCCAAGGG---------------------------------------------------CAGGCCTGGAC 114
Query 371 CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115 CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC 188
Query 445 CGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGTACC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 CGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGTACC 262
Query 519 TGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAGGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 TGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAGGAG 336
Query 593 TTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATGACTGGCATGGCAGGGCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 TTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATGACTGGCATGGCAGGGCT 410
Query 667 AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT 484
Query 741 TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC 558
Query 815 ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC 632
Query 889 TGAGCACAATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 TGAGCACAATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGG 706
Query 963 AAGGGGACTGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 AAGGGGACTGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATC 780
Query 1037 CACGATGAGGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CACGATGAGGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTG 854
Query 1111 GATTTGTGAGCGGAAATGTTCCTGT 1135
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 GATTTGTGAGCGGAAATGTTCCTGT 879