Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15319
• Subject: XM_017026791.2
• Aligned Length: 1135
• Identities: 729
• Gaps: 406

Alignment

Query    1  ATGCATAATCTGTATTCCATCACTGGGTACCCGGACCCACCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGA  222
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGGAGGAGGAGGA  17

Query  223  GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA  91

Query  297  GACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTGGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  GACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTGGAC  165

Query  371  CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC  239

Query  445  CGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGTACC  518
            ||                                                                        
Sbjct  240  CG------------------------------------------------------------------------  241

Query  519  TGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAGGAG  592
                                                                                      
Sbjct  242  --------------------------------------------------------------------------  241

Query  593  TTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATGACTGGCATGGCAGGGCT  666
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  242  -------------------------------------------------------TGACTGGCATGGCAGGGCT  260

Query  667  AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT  334

Query  741  TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC  408

Query  815  ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC  482

Query  889  TGAGCACAATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  TGAGCACAATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGG  556

Query  963  AAGGGGACTGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  AAGGGGACTGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATC  630

Query 1037  CACGATGAGGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  CACGATGAGGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTG  704

Query 1111  GATTTGTGAGCGGAAATGTTCCTGT  1135
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  GATTTGTGAGCGGAAATGTTCCTGT  729