Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15319
• Subject: XM_017026792.1
• Aligned Length: 1135
• Identities: 714
• Gaps: 421

Alignment

Query    1  ATGCATAATCTGTATTCCATCACTGGGTACCCGGACCCACCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGA  222
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGGAGGAGGAGGA  17

Query  223  GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  GGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCACCAA  91

Query  297  GACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTGGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  GACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTGGAC  165

Query  371  CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  CTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCTGGC  239

Query  445  CGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGTACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  CGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGTACC  313

Query  519  TGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  TGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAGGAG  387

Query  593  TTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATGACTGGCATGGCAGGGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  TTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATGACTGGCATGGCAGGGCT  461

Query  667  AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  AGCTGGCCTGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTAT  535

Query  741  TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  TAGACTGCCGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGC  609

Query  815  ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  ACCAAGTCATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGC  683

Query  889  TGAGCACAATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGG  962
            |||||||                                                                   
Sbjct  684  TGAGCAC-------------------------------------------------------------------  690

Query  963  AAGGGGACTGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATC  1036
                                                       ||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  691  -------------------------------------------CTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAA-------  714

Query 1037  CACGATGAGGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTG  1110
                                                                                      
Sbjct  715  --------------------------------------------------------------------------  714

Query 1111  GATTTGTGAGCGGAAATGTTCCTGT  1135
                                     
Sbjct  715  -------------------------  714