Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15360
• Subject: XM_011520105.3
• Aligned Length: 2023
• Identities: 1741
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACAGCTCCAGTGGGACACTTGGAGGTCATGATGAACGCAAAGAACGTGGTGCTGGCTAGAGTGTATACGTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGGACCCAAGCTTAACTTTTCCAATGTGGAATCCTGGGCCTTCATTGATCATCCAATGGCAGACCAGAGAATGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGT  222

Query    1  -------------------------------------ATGATTAATATAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATG  37
                                                 .|||.||..| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGTGGATTGCAACCGCAAACGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCA-AGAAAGCATGGACACAGACAAAGATG  295

Query   38  ACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATT  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  ACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATT  369

Query  112  GAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAAT  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  GAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAAT  443

Query  186  GTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCA  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCA  517

Query  260  ATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCA  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCA  591

Query  334  GCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGAT  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGAT  665

Query  408  CCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAG  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAG  739

Query  482  TCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTT  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  TCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTT  813

Query  556  AAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTG  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTG  887

Query  630  TAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGCAGATCGAAAAA  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
Sbjct  888  TAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAA---AGATCGAAAAA  958

Query  704  GCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAAC  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  GCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAAC  1032

Query  778  GAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACA  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  GAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACA  1106

Query  852  ACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTT  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  ACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTT  1180

Query  926  TTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATAT  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  TTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATAT  1254

Query 1000  TTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAAC  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  TTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAAC  1328

Query 1074  TAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACC  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  TAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACC  1402

Query 1148  CTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGAC  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  CTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGAC  1476

Query 1222  CCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGA------------  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct 1477  CCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGATTCCTTTGT  1550

Query 1284  ---AGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAA  1354
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  TGTAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAA  1624

Query 1355  TAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCC  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCC  1698

Query 1429  AGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGG  1502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  AGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGG  1772

Query 1503  GACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATA  1576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  GACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATA  1846

Query 1577  GTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCC  1650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  GTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCC  1920

Query 1651  AGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGA  1724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  AGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGA  1994

Query 1725  CTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1749
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  CTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  2019