Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15360
• Subject: XM_024448522.1
• Aligned Length: 1827
• Identities: 1749
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCTTTCTGCTGAAGTTCACAGGTCGAATTTGGGGAGCACAATGGCTGGAGGTCAGATGCCCACTAGGAGA  74

Query    1  ----ATGATTAATATAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACC  70
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTATGATTAATATAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACC  148

Query   71  AAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTT  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTT  222

Query  145  ATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAG  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAG  296

Query  219  GATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTT  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTT  370

Query  293  TTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGAC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGAC  444

Query  367  CGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCA  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCA  518

Query  441  GAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCAC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCAC  592

Query  515  CCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTA  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTA  666

Query  589  TGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGA  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGA  740

Query  663  CTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGCAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGA  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGCAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGA  814

Query  737  AAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGC  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGC  888

Query  811  CTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTAT  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTAT  962

Query  885  GGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCAT  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCAT  1036

Query  959  ATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAA  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAA  1110

Query 1033  TGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTC  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTC  1184

Query 1107  TTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAA  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAA  1258

Query 1181  CTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCAC  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCAC  1332

Query 1255  AGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGG  1328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGG  1406

Query 1329  GGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAG  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAG  1480

Query 1403  GGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCA  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCA  1554

Query 1477  GGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGA  1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGA  1628

Query 1551  GAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTG  1624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTG  1702

Query 1625  ACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCA  1698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCA  1776

Query 1699  GATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1749
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1827