Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15379
• Subject: NM_007647.3
• Aligned Length: 1363
• Identities: 1124
• Gaps: 86

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACCCTGCCTCCACAGGAGTGTGAGCAGCACTGCTTCAGCAACAAAGCCTCAGGTCCACATCTTGGGAAGAA  74

Query    1  -ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAG-G  72
             |||||||||||.|||||..|.|||   |||||||||.|..||.||||.|||.|||||.||||||.|.|||| |
Sbjct   75  TATGGCCACTTCCTGGGGGGCTGTC---TTCATGCTGATCATAGCCTGCGTTGGCAGCACTGTCTTCTACAGAG  145

Query   73  AACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTA  146
            || ||||||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct  146  AA-CAGCAGACCTGGTTTGAAGGTGTCTTCTTGTCTTCCATGTGCCCCATTAATGTCAGTGCCGGCACCTTTTA  218

Query  147  TGGAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGAC  220
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||...||||||
Sbjct  219  TGGAATTATGTTTGATGCGGGCAGCACTGGAACTCGGATTCATGTTTACACTTTTGTGCAGAAAACAGCAGGAC  292

Query  221  AGCTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAG  294
            ||||.||..||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct  293  AGCTCCCCTTTCTGGAAGGTGAAATTTTTGATTCTGTGAAGCCGGGACTTTCTGCTTTTGTGGATCAGCCCAAA  366

Query  295  CAGGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGAC  368
            ||||||||||||||.||.||.|.||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||.|||.|||
Sbjct  367  CAGGGTGCTGAGACTGTCCAGGAGCTCTTGGAGGTGGCCAAAGACTCGATCCCCAGAAGCCACTGGGAAAGGAC  440

Query  369  CCCAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGG  442
            |||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct  441  CCCGGTGGTTCTGAAAGCAACGGCCGGACTCCGTTTGCTGCCTGAGCAGAAAGCCCAGGCTCTGCTCTTGGAGG  514

Query  443  TAAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAA  516
            ||.||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||
Sbjct  515  TAGAGGAGATCTTCAAGAATTCACCTTTCCTGGTCCCAGATGGCAGCGTTAGCATCATGGATGGGTCCTATGAA  588

Query  517  GGCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGAC  590
            ||||||.||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|...|.|||||||||||||||||
Sbjct  589  GGCATACTAGCCTGGGTTACCGTGAACTTTCTAACAGGTCAGCTGCATGGTCGTGGCCAGGAGACTGTGGGGAC  662

Query  591  CTTGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTA  664
            |.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  663  CCTTGACCTGGGGGGTGCCTCCACCCAAATCACGTTTCTACCCCAGTTTGAGAAAACCCTGGAACAAACACCTA  736

Query  665  GGGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGA  738
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  737  GGGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTTTAAGCTCTATACACATAGTTACTTGGGATTTGGA  810

Query  739  TTGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGC  812
            .||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||.|||||||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct  811  CTGAAAGCTGCAAGACTGGCAACTCTGGGAGCCCTGGAAGCAAAAGGGACTGATGGACATACGTTTCGAAGTGC  884

Query  813  CTGTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAG  886
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  885  CTGTTTACCAAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGTAACCAAGAAG  958

Query  887  GGGAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAG  960
            |||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  959  GGGAGATGGGCTTTGAACCCTGCTATGCGGAAGTGCTGAGGGTAGTACAGGGGAAACTTCACCAGCCAGAAGAA  1032

Query  961  GTCCAGA-GAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATG  1033
            |||| || ||.|..|||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|.|||||||.||.||||.|||||||
Sbjct 1033  GTCC-GAGGAAGCGCCTTCTACGCTTTCTCTTACTACTACGATCGAGCCGCTGACACACACTTGATCGATTATG  1105

Query 1034  AAAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTC  1107
            |||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||
Sbjct 1106  AAAAGGGCGGGGTTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGAGAAGTGTGTGACAACTTGGGGAGCTTC  1179

Query 1108  ACCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGC  1181
            .||||.||||||||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1180  TCCTCGGGCAGTCCTTTCCTCTGCATGGACCTCACTTACATCACAGCCCTGTTGAAAGATGGTTTTGGCTTTGC  1253

Query 1182  AGACAGCACAGTCTTACAGCTCACAAAGAAAGTGAACAACATAGAGACGGGCTGGGCCTTGGGGGCCACCTTTC  1255
            .|||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  CGACGGCACCCTCTTACAGCTCACAAAGAAAGTGAACAACATAGAGACTGGTTGGGCCTTGGGGGCCACCTTTC  1327

Query 1256  ACCTGTTGCAGTCTCTGGGCATCTCC--CAT  1284
            |||||.|.|||||||||||||||.||  |  
Sbjct 1328  ACCTGCTCCAGTCTCTGGGCATCACCAGC--  1356