Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15394
- Subject:
- XM_011240431.2
- Aligned Length:
- 1659
- Identities:
- 1287
- Gaps:
- 252
Alignment
Query 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA 74
Query 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG 148
Query 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC 222
Query 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
Query 297 GAAGACAGG----------------------------------------------------------------- 305
||||||.||
Sbjct 297 GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC 370
Query 306 -------------------------------------------------------------------------- 305
Sbjct 371 GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA 444
Query 306 -------------------------------------------------------------------------- 305
Sbjct 445 CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA 518
Query 306 ---------------------------------------GGTTCCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATG 340
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGGTTCCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATG 592
Query 341 ATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATGGCTATTCGTTTGAGGATTTTGAAGAACGGTTTGCTGCAGCCACC 414
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|.||||||||.||....||.|||||.||||||||.
Sbjct 593 ATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATAGCCAGCCGCTGGAGGATTTCGACTCGCGCTTTGCCGCAGCCACG 666
Query 415 CCGAACAGAAACCTGCCCACAGACTTTGATGAGATTTTTGAGGCAACGAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTT 488
||||||||.||||||.|.|..||||||||||||.||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCGAACAGGAACCTGTCAATGGACTTTGATGAGCTTCTCGAGGCAACCAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTT 740
Query 489 TGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCAT 562
|||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.|
Sbjct 741 TGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGT 814
Query 563 CTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCA 636
|.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCA 888
Query 637 GGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCAT 710
|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|.|||
Sbjct 889 GGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCAT 962
Query 711 GGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTC 784
||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 GGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTC 1036
Query 785 CTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTT 858
|||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTT 1110
Query 859 ATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCAC 932
||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||..|
Sbjct 1111 ATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGC 1184
Query 933 CAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCC 1006
|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 1185 CAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCC 1258
Query 1007 AGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTAC 1080
|||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTAC 1332
Query 1081 TTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCC 1154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||
Sbjct 1333 TTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCC 1406
Query 1155 TGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCAT 1228
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCAT 1480
Query 1229 CTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAA 1302
|.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481 CAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAA 1554
Query 1303 GAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAG 1376
||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 GAACAAGAAGCACCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTGATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAG 1628
Query 1377 TGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC 1407
|||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1629 TGGTGATAATATAAGTCCACAAGACGGTAGC 1659