Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15394
- Subject:
- XM_011240434.2
- Aligned Length:
- 1576
- Identities:
- 1272
- Gaps:
- 185
Alignment
Query 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA 74
Query 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG 148
Query 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC 222
Query 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
Query 297 GAAGACAGGGG---TTC----CCACCA-GC----CA--AAA-------------GAAGGA------AGGT---- 333
||||||.|||| ||| .||||| || || ||| |||||| ||.|
Sbjct 297 GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC 370
Query 334 --------------GTTT---------------AT----GATGTG-------CCAAAAAG----------TCAA 357
|||| || |||.|| |.|||.|| |.||
Sbjct 371 GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA 444
Query 358 CCTGTAAGTAATGG-CT------AT-TCGTT-----------TGAG---------------GATTTTGAAGAA- 396
|||||.| |..||| || || ||.|| |||| ||.||.|||.||
Sbjct 445 CCTGTTA-TCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAA 517
Query 397 -----------------CGGTTT------GCTG-----CAG----CCACC--CCGAACAGA---AACCTGCCCA 433
|.||.| |||| ||| ||||| || ||.||| ||..||
Sbjct 518 AGGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGGTTCCCACCAGCC-AAAAGAAGGAAGGTG---- 586
Query 434 CAGACTTTGATGAGATTTTTG------AGGCAAC---GAAG-GCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACAT 497
||.|||| |.|| ||.|||| .||| ||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 587 ------TTTATGA----TGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGAGACAT 650
Query 498 GTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTC 571
||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|
Sbjct 651 GTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGTCGTCGTCCC 724
Query 572 AGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTT 645
||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 725 AGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTATGTC 798
Query 646 GCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCA 719
||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||.||
Sbjct 799 GCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCATGGGTGCTCA 872
Query 720 GCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTC 793
||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 873 GCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTCCTGCCACCC 946
Query 794 AGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTG 867
||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 947 AGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTA 1020
Query 868 CCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAG 941
.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||..||||||||||
Sbjct 1021 GCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGCCAGGTCAAG 1094
Query 942 TCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGC 1015
||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1095 TCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCCAGCCTCCAC 1168
Query 1016 CCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAA 1089
||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 CCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAA 1242
Query 1090 GTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTC 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1243 GTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCCTGTGACTTC 1316
Query 1164 TACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCC 1237
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1317 TACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCATCAGCATCCC 1390
Query 1238 ATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAA 1311
|.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1391 ACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAAGAACAAGAA 1464
Query 1312 GCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAA 1385
||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1465 GCACCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTGATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAGTGGTGATAA 1538
Query 1386 TATAAGTCCACAGGCCGGTAGC 1407
||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1539 TATAAGTCCACAAGACGGTAGC 1560