Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15394
• Subject: XM_011240435.2
• Aligned Length: 1573
• Identities: 1269
• Gaps: 185

Alignment

Query    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA  74

Query   75  TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG  148

Query  149  ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC  222
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC  222

Query  223  GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296

Query  297  GAAGACAGGGG---TTC----CCACCA-GC----CA--AAA-------------GAAGGA------AGGT----  333
            ||||||.||||   |||    .||||| ||    ||  |||             ||||||      ||.|    
Sbjct  297  GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC  370

Query  334  --------------GTTT---------------AT----GATGTG-------CCAAAAAG----------TCAA  357
                          ||||               ||    |||.||       |.|||.||          |.||
Sbjct  371  GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA  444

Query  358  CCTGTAAGTAATGG-CT------AT-TCGTT-----------TGAG---------------GATTTTGAAGAA-  396
            |||||.| |..||| ||      || ||.||           ||||               ||.||.|||.|| 
Sbjct  445  CCTGTTA-TCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAA  517

Query  397  -----------------CGGTTT------GCTG-----CAG----CCACC--CCGAACAGA---AACCTGCCCA  433
                             |.||.|      ||||     |||    |||||  || ||.|||   ||..||    
Sbjct  518  AGGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGGTTCCCACCAGCC-AAAAGAAGGAAGGTG----  586

Query  434  CAGACTTTGATGAGATTTTTGAGGCAACGAAG-------GCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACATGTC  500
                  ||.||||      ||.|.||| .|||       ||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  587  ------TTTATGA------TGTGCCAA-AAAGTCAACCTGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGAGACATGTC  647

Query  501  CACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTCAGA  574
            |||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.||||
Sbjct  648  CACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGTCGTCGTCCCAGA  721

Query  575  CCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTTGCA  648
            |.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  722  CGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTATGTCGCT  795

Query  649  ATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCAGCC  722
            ||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||
Sbjct  796  ATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCATGGGTGCTCAGCC  869

Query  723  ACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGC  796
            |||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  870  ACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTCCTGCCACCCAGC  943

Query  797  AGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTGCCA  870
            |..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  944  AAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTAGCA  1017

Query  871  GCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAGTCC  944
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||
Sbjct 1018  GCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGCCAGGTCAAGTCC  1091

Query  945  ACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCG  1018
            |||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1092  ACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCCAGCCTCCACCCG  1165

Query 1019  TGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTC  1092
            |.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  TACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTC  1239

Query 1093  GGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTCTAC  1166
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  GGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCCTGTGACTTCTAC  1313

Query 1167  CACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCCATG  1240
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1314  CACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCATCAGCATCCCACG  1387

Query 1241  CCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCT  1314
            .||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1388  TCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAAGAACAAGAAGCA  1461

Query 1315  CCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAATAT  1388
            ||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1462  CCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTGATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAGTGGTGATAATAT  1535

Query 1389  AAGTCCACAGGCCGGTAGC  1407
            |||||||||.|.|||||||
Sbjct 1536  AAGTCCACAAGACGGTAGC  1554