Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15394
- Subject:
- XM_017319950.1
- Aligned Length:
- 1674
- Identities:
- 1222
- Gaps:
- 327
Alignment
Query 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA 74
Query 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG 148
Query 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC 222
Query 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
Query 297 GAAGACAGGGG---TTC----CCACCA-GC----CA--AAA-------------GAAGGA------AGGT---- 333
||||||.|||| ||| .||||| || || ||| |||||| ||.|
Sbjct 297 GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC 370
Query 334 --------------GTTT---------------AT----GATGTG-------CCAAAAAG----------TCAA 357
|||| || |||.|| |.|||.|| |.||
Sbjct 371 GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA 444
Query 358 CCTGT-------------------------------------------AAGTAATG------------------ 370
||||| |||.||.|
Sbjct 445 CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA 518
Query 371 ----------------------------GCTAT--------TCGTTT-----GAGGATTTTGAAGAAC------ 397
|||.| .|.||| ||||||.|.|||||.|
Sbjct 519 GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGACCATTTTGGAAGAGGATGTGGAAGATCCCGTGT 592
Query 398 ------------GGTTTGCTGC--------AGCCACCCCG---------AACAGAA------------------ 424
.|||||..|| |||||..||| |||||||
Sbjct 593 ACCAGTACATTGTGTTTGAGGCTGGACATGAGCCAATCCGTGATCCTGAAACAGAAGAGAACATTTACCAGGTT 666
Query 425 ---ACCTGCCCACAGA--------CTTTGATGAGATTTTTG------AGGCAAC---GAAG-GCTGTGACCCAA 477
|||.|||.|.||| .||| |||| |.|| ||.|||| .||| ||||||||||||
Sbjct 667 CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTT-ATGA----TGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTGCTGTGACCCAA 735
Query 478 TTAGAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGC 551
||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 736 TTAGAACTTTTTGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGC 809
Query 552 CTTTATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTG 625
||||.||||.||.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..|||||||||||||||
Sbjct 810 CTTTCTCCCGTCGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTG 883
Query 626 CTGTACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAG 699
||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 884 CTGTACCCTCAGGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAG 957
Query 700 CAGATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCC 773
|||||.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 CAGATCGCCATGGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCC 1031
Query 774 GGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCA 847
.|||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 AGGTCTCTTTCCTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCA 1105
Query 848 CACAAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACG 921
|||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1106 CACAAACTGTTATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACG 1179
Query 922 AGTGACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTT 995
|.||||||..||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||
Sbjct 1180 AATGACTCTGCCAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTT 1253
Query 996 CCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCT 1069
||||||||.|||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1254 CCAGATGGTCCAGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCT 1327
Query 1070 TCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTG 1143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 1328 TCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTG 1401
Query 1144 AATTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCC 1217
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1402 AACTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCC 1475
Query 1218 ATCCAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCA 1291
||||||||||||.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1476 ATCCAAATCATCAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCA 1549
Query 1292 GCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAG-GCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAG 1364
|||||||.|||||.|||||||| .||.| ||| ||||| ||.|| |.||
Sbjct 1550 GCAAAAGTGAAGAACAAGAAGC-------AGAGC-CAGAGCCTC------------TCTAT---GCGA------ 1594
Query 1365 TGGGGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC--- 1407
||.||.||||.|| ||..
Sbjct 1595 ------------------------AAATCAACAGACC--TAAGAAA 1614