Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15394
• Subject: XM_017319951.1
• Aligned Length: 1671
• Identities: 1219
• Gaps: 327

Alignment

Query    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA  74

Query   75  TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG  148

Query  149  ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC  222
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC  222

Query  223  GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296

Query  297  GAAGACAGGGG---TTC----CCACCA-GC----CA--AAA-------------GAAGGA------AGGT----  333
            ||||||.||||   |||    .||||| ||    ||  |||             ||||||      ||.|    
Sbjct  297  GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC  370

Query  334  --------------GTTT---------------AT----GATGTG-------CCAAAAAG----------TCAA  357
                          ||||               ||    |||.||       |.|||.||          |.||
Sbjct  371  GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA  444

Query  358  CCTGT-------------------------------------------AAGTAATG------------------  370
            |||||                                           |||.||.|                  
Sbjct  445  CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA  518

Query  371  ----------------------------GCTAT--------TCGTTT-----GAGGATTTTGAAGAAC------  397
                                        |||.|        .|.|||     ||||||.|.|||||.|      
Sbjct  519  GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGACCATTTTGGAAGAGGATGTGGAAGATCCCGTGT  592

Query  398  ------------GGTTTGCTGC--------AGCCACCCCG---------AACAGAA------------------  424
                        .|||||..||        |||||..|||         |||||||                  
Sbjct  593  ACCAGTACATTGTGTTTGAGGCTGGACATGAGCCAATCCGTGATCCTGAAACAGAAGAGAACATTTACCAGGTT  666

Query  425  ---ACCTGCCCACAGA--------CTTTGATGAGATTTTTGAGGCAACGAAG-------GCTGTGACCCAATTA  480
               |||.|||.|.|||        .||| ||||      ||.|.||| .|||       |||||||||||||||
Sbjct  667  CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTT-ATGA------TGTGCCAA-AAAGTCAACCTGCTGTGACCCAATTA  732

Query  481  GAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTT  554
            |||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  733  GAACTTTTTGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTT  806

Query  555  TATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTG  628
            |.||||.||.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..||||||||||||||||||
Sbjct  807  TCTCCCGTCGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTG  880

Query  629  TACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAG  702
            |||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  881  TACCCTCAGGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAG  954

Query  703  ATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGG  776
            ||.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  955  ATCGCCATGGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGG  1028

Query  777  TCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACAC  850
            |||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  TCTCTTTCCTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACAC  1102

Query  851  AAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGT  924
            ||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 1103  AAACTGTTATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAAT  1176

Query  925  GACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCA  998
            |||||..||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||||||||||
Sbjct 1177  GACTCTGCCAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCA  1250

Query  999  GATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCT  1072
            |||||.|||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  GATGGTCCAGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCT  1324

Query 1073  CCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAAT  1146
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.
Sbjct 1325  CCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAAC  1398

Query 1147  TTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATC  1220
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1399  TTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATC  1472

Query 1221  CAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCA  1294
            |||||||||.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473  CAAATCATCAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCA  1546

Query 1295  AAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAG-GCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGG  1367
            ||||.|||||.||||||||       .||.| ||| |||||            ||.||   |.||         
Sbjct 1547  AAAGTGAAGAACAAGAAGC-------AGAGC-CAGAGCCTC------------TCTAT---GCGA---------  1588

Query 1368  GGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC---  1407
                                 ||.||.||||.||  ||..   
Sbjct 1589  ---------------------AAATCAACAGACC--TAAGAAA  1608