Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15412
• Subject: XM_006514511.2
• Aligned Length: 1986
• Identities: 1837
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74

Query   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG  148

Query  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC  222

Query  223  ACT------------------GGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTA  278
            |||                  |||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  223  ACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATA  296

Query  279  TGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCAT  352
            |||||||||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||
Sbjct  297  TGGCACTGGGACTTATGACAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCAT  370

Query  353  ATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGA  426
            |||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  ATGGCACCCAGCCTGCCTACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGT  444

Query  427  AACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA  500
            ||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACAAGCCTGCTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA  518

Query  501  GAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTC  574
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  519  GAGTAACTACAGCTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTC  592

Query  575  CTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAA  648
            ||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  CTACCAGCTACTCCTCTTCACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAG  666

Query  649  CCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCC  722
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CCGAGCAGCTATGGACAACAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCC  740

Query  723  ACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT  796
            .||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCTCAGACTGGATCCTACAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT  814

Query  797  CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG  888

Query  871  AACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG  944
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCGGAGCTTGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG  962

Query  945  TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGAATGG---GCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCA  1015
            |||||||||||||||||||||||||.|||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGACTGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCA  1036

Query 1016  TGGATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTAT  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGATGAAGGACCAGATCTTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTAT  1110

Query 1090  GTACAAGGATTAAATGACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGAT  1163
            ||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GTGCAAGGATTAAATGACAATGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAGAT  1184

Query 1164  GAACAAGAGAACTGGGCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCA  1237
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1185  GAACAAGAGAACTGGACAACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGCCA  1258

Query 1238  CAGTGTCCTATGAAGACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGC  1311
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  CAGTGTCCTATGAAGATCCACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAAGC  1332

Query 1312  AAACTTAAAGTCTCCCTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGG  1385
            |||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||..|||||||.||||||||
Sbjct 1333  AAACTTAAAGTGTCTCTTGCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAGGG  1406

Query 1386  CAGAGGCATGCCACCACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGG  1459
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGGGGGATGCCACCACCACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCATGG  1480

Query 1460  GAGGCCGTGGAGGAGATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGA  1533
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGGCCGTGGAGGAGACAGAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAGGA  1554

Query 1534  GGAAACGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAG  1607
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555  GGAAATGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGGAG  1628

Query 1608  AACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTG  1681
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1629  AACAGAATGCAACCAGTGTAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGGTG  1702

Query 1682  ATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGA  1755
            |||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1703  ATCGTGGACGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAGGA  1776

Query 1756  ATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGG  1829
            |||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGTTCAGAGGTGGCAGAGGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTTGG  1850

Query 1830  TGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGAC  1903
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  TGGAGGAAGACGAGGTGGTCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGGAC  1924

Query 1904  GTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC  1965
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1925  GTGGAGGACCTGGGAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCCTAC  1986