Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15412
• Subject: XM_017028651.2
• Aligned Length: 1968
• Identities: 1841
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC  74

Query   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG  148

Query  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC  222

Query  223  ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA  296

Query  297  TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT  370

Query  371  ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT  444

Query  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC  518

Query  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA  592

Query  593  CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG  666

Query  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA  740

Query  741  CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC  814

Query  815  CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC  888

Query  889  CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG  962

Query  963  CGGTGGAATGG---GCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATC  1033
            |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGTGGAATGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGATGAAGGACCAGATC  1036

Query 1034  TTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAATGAC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAATGAC  1110

Query 1108  AGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGGGCA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGGGCA  1184

Query 1182  ACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAGACC  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAGACC  1258

Query 1256  CACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCCCTT  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 1259  CACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGAT---------------------------------------  1293

Query 1330  GCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACCACC  1403
                                                                                      
Sbjct 1294  --------------------------------------------------------------------------  1293

Query 1404  ACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATA  1477
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294  ----------GGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAGATA  1357

Query 1478  GAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGA  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  GAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCACCGA  1431

Query 1552  GCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTG  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  GCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGTTGTGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTG  1505

Query 1626  TAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCC  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  TAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCC  1579

Query 1700  CTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGT  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580  CTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTCATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGT  1653

Query 1774  GGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGG  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654  GGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCGGGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGG  1727

Query 1848  CCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAA  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728  CCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAA  1801

Query 1922  TGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC  1965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802  TGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGAGATCGGCCCTAC  1845