Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15453
• Subject: XM_006496431.3
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1561
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACGGGGCTGCCGCA  74

Query   75  CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA  148
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  CAACCGCAAGTGTTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTGAACATGACGGTCGGCTCGTTCGTGTGCA  148

Query  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA  222
            ||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGAGAGGGTTAAATCCACCTCACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTTACA  222

Query  223  CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAGCAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA  296
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAACAGGAAATTGAATTCCTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGCAAACAGATATGGCTAGGATTATTTGATGA  296

Query  297  TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  297  CAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAGAAATATGAAAAGA  370

Query  371  AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC  444
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  AAAGATGGTATGTTCCGCCAGAGCAAGCCAAAGTGGTGGCCTCGGTTCATGCGTCTATTTCAGGGTCTTCTGCC  444

Query  445  AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT  518
            ||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||..||||||||.|
Sbjct  445  AGCAGCACAAGCAGCACCCCGGAGGTCAAGCCCCTGAAATCCCTGTTGGGAGAGTCTGCACCCGCACTGCACCT  518

Query  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGCTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAGTTTG  592

Query  593  ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTTTTGAGTGATCTTGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666

Query  667  AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG  740
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTTTGCACACTTTAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG  740

Query  741  ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTTCTTTTCAGCCCCAGACTACAG  814

Query  815  GTGGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTT  888
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGAAGTGCTGGATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCTAAATCCTCCAGTGCTGATTTT  888

Query  889  GGAACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTT  962
            ||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GGAACCTTCAGTACATCCCAGAGTCATCAGACAGCATCAACTGTTAGTAAAGTTTCAACAAACAAAGCTGGTTT  962

Query  963  ACAGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGG  1036
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  963  ACAGACAGCAGACAAATATGCGGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCTGGGCAAGGAGGTGATCAAG  1036

Query 1037  GAAGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCT  1110
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  GGAGTGGTTTTGGGACCACGGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCATTCAAGTGCATCT  1110

Query 1111  TCAGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATAC  1184
            |||||||||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  TCAGACAAGTATGCAGCCCTGGCAGAGTTAGACAGCGTGTTCAGCTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTACAC  1184

Query 1185  TTCCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTT  1258
            ..||||.||||||||||||||   |||.||||||||||||||.||||.|||.|||||.||||||||.|||||| 
Sbjct 1185  GCCCACCAGTAATGCTAGCAG---TGTCTTTGGAACAGTGCCTGTGGGTGCCTCTGCTCAGACACAACCTGCT-  1254

Query 1259  CATCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTG  1332
              |||||||..||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 1255  --TCAAGTGGTCCTGCTCCGTTTGGGGCTACGCCTTCTACGAATCCATTTGTTGCTGCTACTGGTCCTTCTGCG  1326

Query 1333  GCATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACA-----------------------------  1377
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct 1327  GCATCGTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACAGGCCTTTCTGGAGCAATGCATTCTCAAGT  1400

Query 1378  -------------------GCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAGCATGCCCACGGGATTCGGCACTCCTG  1432
                               |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..|.|||||.||||||||||
Sbjct 1401  GTTTCCTCACGCTCATTTTGCGGCAACCTTTGGCACCGCATCTATGAGTATGCCAGCAGGATTTGGCACTCCTG  1474

Query 1433  CTCCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTGCCTTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCT  1506
            |.|..||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  CCCAGTATAGTCTCCCTACCAGCTTTAGTGGCAGTTTCCAGCAGCCTGCCTTCCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCT  1548

Query 1507  CAACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCATTTGGACAAACAAAGCCAGTAGTAAC  1580
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1549  CAGCAGACAGCCTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTCGCCACGTTTGGACAAACAAAACCAGTGGTAAC  1622

Query 1581  CCCTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCACCAACAGGACAATTTC  1654
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||
Sbjct 1623  CCCTTTCGGTCAAGTAGCAGCTGCTGGAGTGTCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCGCCGACAGGACAACTTC  1696

Query 1655  CAACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA  1686
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1697  CAACAGGAAGCTCATCCACCAACCCTTTCTTA  1728