Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15547
• Subject: NM_008947.3
• Aligned Length: 1320
• Identities: 1209
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGTCAAAGTCAGAGTGGTGGTCATGGTCCTGGAGGTGGCAAGAAGGATGACAAGGACAAGAAAAAGAAATA  74
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTCAAAGCCAGAGTGGTGGCCATGGTCCTGGGGGTGGCAAGAAGGATGACAAGGACAAGAAAAAGAAATA  74

Query   75  TGAACCTCCTGTACCAACTAGAGTGGGGAAAAAGAAGAAGAAAACAAAGGGACCAGATGCTGCCAGCAAACTGC  148
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAACCTCCTGTCCCAACTAGAGTGGGGAAAAAGAAGAAGAAAACAAAGGGACCAGATGCTGCCAGCAAACTGC  148

Query  149  CACTGGTGACACCTCACACTCAGTGCCGGTTAAAATTACTGAAGTTAGAGAGAATTAAAGGCTATCTTCTCATG  222
            |||||||.|||||||||||.||||||||..|.||||||||||||.||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct  149  CACTGGTAACACCTCACACCCAGTGCCGCCTGAAATTACTGAAGCTAGAGAGAATAAAAGACTATCTTCTCATG  222

Query  223  GAGGAAGAATTCATTAGAAATCAGGAACAAATGAAACCATTAGAAGAAAAGCAAGAGGAGGAAAGATCAAAAGT  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGAGGAATTCATTAGAAACCAGGAACAGATGAAACCATTAGAAGAAAAGCAAGAGGAGGAAAGATCAAAAGT  296

Query  297  GGATGATCTGAGGGGGACCCCGATGTCAGTAGGAACCTTGGAAGAGATTATTGATGACAATCATGCCATCGTGT  370
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  297  GGATGATCTCAGGGGGACCCCCATGTCTGTAGGAACCTTGGAAGAGATCATTGATGATAATCACGCCATTGTGT  370

Query  371  CTACATCTGTGGGCTCAGAACACTACGTCAGCATTCTTTCATTTGTAGACAAGGATCTGCTGGAACCTGGCTGC  444
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  CCACATCTGTGGGCTCAGAACACTACGTCAGCATCCTGTCGTTTGTAGACAAGGATCTGCTGGAACCAGGCTGC  444

Query  445  TCGGTCCTGCTCAACCACAAGGTGCATGCCGTGATAGGGGTGCTGATGGATGACACGGATCCCCTGGTCACAGT  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCGTCCTGCTCAACCACAAGGTGCATGCTGTGATAGGGGTGCTAATGGATGACACGGATCCCCTGGTCACAGT  518

Query  519  GATGAAGGTAGAAAAGGCCCCCCAGGAGACCTATGCAGATATTGGGGGGTTGGACAACCAAATTCAGGAAATTA  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  519  GATGAAGGTGGAAAAGGCCCCCCAGGAGACCTACGCAGATATTGGGGGACTGGACAACCAGATCCAAGAAATTA  592

Query  593  AGGAATCTGTGGAGCTTCCTCTCACCCATCCTGAATATTATGAAGAGATGGGTATAAAGCCTCCTAAGGGGGTC  666
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  AGGAGTCTGTGGAGCTCCCGCTTACCCATCCTGAGTATTACGAGGAGATGGGGATAAAGCCCCCTAAGGGGGTC  666

Query  667  ATTCTCTATGGTCCACCTGGCACAGGTAAAACCTTGTTAGCCAAAGCAGTAGCAAACCAAACCTCAGCCACTTT  740
            ||||||||.|||||.||.||.|||||||||||..|.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  667  ATTCTCTACGGTCCGCCAGGAACAGGTAAAACTCTATTGGCCAAAGCAGTAGCGAACCAGACTTCAGCCACTTT  740

Query  741  CTTGAGAGTGGTTGGCTCTGAACTTATTCAGAAGTACCTAGGTGATGGGCCCAAACTCGTACGGGAATTGTTCC  814
            ||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|.||||
Sbjct  741  CTTGCGAGTGGTTGGCTCAGAGCTTATCCAGAAGTACCTAGGTGACGGGCCCAAACTTGTCCGGGAGCTCTTCC  814

Query  815  GAGTTGCTGAAGAACATGCACCGTCCATCGTGTTTATTGATGAAATTGACGCCATTGGGACAAAAAGATATGAC  888
            |.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  GGGTCGCTGAGGAGCATGCGCCGTCCATCGTGTTCATTGATGAGATCGACGCCATTGGGACCAAAAGATATGAT  888

Query  889  TCCAATTCTGGTGGTGAGAGAGAAATTCAGCGAACAATGTTGGAACTGCTGAACCAGTTGGATGGATTTGATTC  962
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAAATTCTGGAGGTGAGAGAGAAATTCAGCGAACAATGTTGGAACTGTTGAACCAGTTGGATGGATTTGATTC  962

Query  963  TAGGGGAGATGTGAAAGTTATCATGGCCACAAACCGAATAGAAACTTTGGATCCAGCACTTATCAGACCAGGCC  1036
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  963  GAGGGGAGATGTAAAAGTTATCATGGCCACAAACCGAATAGAAACTTTGGATCCAGCACTTATCAGGCCAGGCC  1036

Query 1037  GCATTGACAGGAAGATTGAGTTCCCCCTGCCTGATGAAAAGACGAAGAAGCGCATATTTCAGATTCACACAAGC  1110
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1037  GCATTGACAGAAAGATCGAGTTCCCCCTGCCGGATGAGAAGACCAAGAAGCGTATCTTCCAGATTCACACCAGC  1110

Query 1111  AGGATGACGCTGGCTGATGATGTAACCCTGGACGACCTGATCATGGCTAAAGATGACCTCTCTGGTGCTGACAT  1184
            ||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111  AGGATGACACTGGCTGATGATGTAACCTTGGATGACTTGATCATGGCAAAGGATGACCTCTCTGGGGCCGACAT  1184

Query 1185  CAAGGCAATCTGTACAGAAGCTGGTCTGATGGCCTTAAGAGAACGTAGAATGAAAGTAACAAATGAAGACTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||..||||||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGGCAATCTGTACAGAAGCTGGCTTGATGGCCTTGCGGGAACGCAGAATGAAAGTAACAAATGAAGACTTCA  1258

Query 1259  AAAAATCTAAAGAAAATGTTCTTTATAAGAAACAGGAAGGCACCCCTGAGGGGCTGTATCTC  1320
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  AAAAATCTAAAGAGAATGTTCTTTATAAAAAACAAGAAGGCACCCCTGAGGGGCTCTATCTC  1320