Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15579
• Subject: NM_009094.2
• Aligned Length: 789
• Identities: 639
• Gaps: 0

Alignment

Query   1  ATGGCCCGGGGCCCCAAGAAGCACTTAAAGCGTGTTGCAGCGCCGAAGCATTGGATGCTTGACAAACTAACGGG  74
           |||||.||.||.||||||||.|||.|.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||..|.||.||
Sbjct   1  ATGGCTCGTGGTCCCAAGAAACACCTGAAGCGTGTAGCTGCTCCAAAACATTGGATGCTGGATAAGTTGACTGG  74

Query  75  TGTATTTGCACCTCGTCCATCGACAGGTCCCCACAAGCTGAGGGAATGTCTTCCTCTGATCGTCTTCCTCAGGA  148
           .||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||
Sbjct  75  CGTGTTTGCTCCTCGTCCATCCACTGGTCCTCACAAGCTGAGGGAATGCCTGCCTCTCATCATTTTCCTAAGGA  148

Query 149  ATAGACTCAAGTATGCGTTGACTGGAGATGAGGTAAAGAAGATATGTATGCAACGTTTCATCAAAATTGATGGC  222
           |.|||||.||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 149  ACAGACTTAAGTATGCCCTGACTGGAGATGAAGTAAAAAAGATTTGCATGCAGCGATTCATTAAGATTGATGGG  222

Query 223  AAGGTTCGAGTGGATGTCACATACCCTGCTGGATTCATGGATGTCATCAGCATCGAGAAGACAGGTGAACATTT  296
           ||.||..|....|||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||..|.||
Sbjct 223  AAAGTCAGGACCGATATAACCTACCCTGCTGGGTTTATGGATGTCATCAGCATTGACAAGACCGGAGAGAACTT  296

Query 297  CCGCCTGGTCTATGACACCAAGGGCCGTTTTGCTGTTCACCGCATCACAGTGGAAGAGGCAAAGTACAAGTTGT  370
           |||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||..|||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 297  CCGTCTGATCTATGACACCAAGGGTCGCTTTGCTGTTCATCGTATTACACCGGAGGAGGCCAAGTACAAGTTGT  370

Query 371  GCAAAGTGAGGAAGATTACTGTGGGAGTGAAGGGAATCCCTCACCTGGTGACTCATGATGCTCGAACCATCCGC  444
           ||||||||||.|||||...|||.||....||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 371  GCAAAGTGAGAAAGATCTTTGTAGGCACAAAAGGAATCCCGCACCTGGTGACCCATGATGCTCGTACTATTCGG  444

Query 445  TACCCAGATCCTGTCATCAAGGTGAACGATACTGTGCAGATTGATTTAGGGACTGGCAAGATAATCAACTTTAT  518
           |||||.|||||..||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.|.|||.|||||.||||...||||.||
Sbjct 445  TACCCTGATCCCCTCATCAAGGTGAACGACACCATTCAGATTGATTTGGAGACAGGCAAAATAACTGACTTCAT  518

Query 519  CAAATTTGATACAGGCAATTTGTGTATGGTGATTGGTGGAGCCAACCTCGGTCGTGTTGGTGTGATCACCAACA  592
           |||.|||||.||.||.||..||||||||||||.|||.||.||.|||.|.||..|..|||||||.||||||||||
Sbjct 519  CAAGTTTGACACTGGGAACCTGTGTATGGTGACTGGAGGTGCTAACTTGGGAAGAATTGGTGTAATCACCAACA  592

Query 593  GGGAAAGACATCCTGGTTCTTTTGATGTGGTGCATGTGAAGGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCCACGAGGCTT  666
           |.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||.
Sbjct 593  GAGAGAGACATCCCGGCTCTTTTGATGTGGTTCATGTGAAAGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCCACTCGGCTG  666

Query 667  TCCAACATTTTTGTCATTGGCAATGGCAATAAACCTTGGATTTCCCTGCCCAGGGGAAAGGGCATTCGACTTAC  740
           ||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct 667  TCCAACATTTTTGTTATTGGCAAGGGTAACAAACCATGGATCTCTCTTCCCAGAGGAAAAGGAATCCGCCTCAC  740

Query 741  TGTTGCTGAAGAGAGAGATAAGAGGCTGGCCACCAAACAGAGCAGTGGC  789
           ..||||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||.
Sbjct 741  CATTGCTGAAGAGAGAGACAAGAGGCTTGCGGCCAAACAGAGCAGTGGG  789