Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15687
- Subject:
- NM_001042494.2
- Aligned Length:
- 3305
- Identities:
- 2796
- Gaps:
- 508
Alignment
Query 1 ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCACTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCACTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCA 74
Query 75 CCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGGGGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGGGGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGAC 148
Query 149 ATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAGAAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAGAAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTG 222
Query 223 GCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCCCTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCCCTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAA 296
Query 297 TCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCACTGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCACTGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCC 370
Query 371 CCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAAATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAAATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGC 444
Query 445 CTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCAATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCAATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAAT 518
Query 519 GTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGTGCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGTGCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTT 592
Query 593 CCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCTTTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCTTTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCC 666
Query 667 ATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTCCCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTCCCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGA 740
Query 741 CGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTACGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTACGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTAT 814
Query 815 TAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCACTTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCACTTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATC 888
Query 889 TTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCACACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCACACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCG 962
Query 963 CACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGAAATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGAAATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGT 1036
Query 1037 TATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCTGTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCTGTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTC 1110
Query 1111 ACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACAGAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACAGAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAA 1184
Query 1185 GGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTTAGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTTAGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTG 1258
Query 1259 TTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTCCCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTCCCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCA 1332
Query 1333 AACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATTGGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATTGGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTC 1406
Query 1407 CTTTGTTTTAGATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTATTGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCG 1480
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTTTGTTT---ATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTATTGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCG 1477
Query 1481 GTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGCCATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 GTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGCCATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCC 1551
Query 1555 TTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCACCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 TTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCACCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGA 1625
Query 1629 TAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAATGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 TAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAATGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAA 1699
Query 1703 CTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATCTTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATCTTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTT 1773
Query 1777 CTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACATTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 CTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACATTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCG 1847
Query 1851 ATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTATCTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 ATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTATCTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCT 1921
Query 1925 GGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACAAGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 GGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACAAGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAA 1995
Query 1999 GAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGGTTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 GAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGGTTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACC 2069
Query 2073 TCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAAACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 TCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAAACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATC 2143
Query 2147 CTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTCTCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 CTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTCTCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGG 2217
Query 2221 AACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACCATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 AACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACCATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGT 2291
Query 2295 AAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGGGAGGGCATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCC 2368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 AAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGAGAGGGCATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCC 2365
Query 2369 TTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATGGCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 TTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATGGCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCT 2439
Query 2443 TGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCATCTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 TGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCATCTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTC 2513
Query 2517 CTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGATGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 CTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGATGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGA 2587
Query 2591 TGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGCGAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 TGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGCGAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTA 2661
Query 2665 GCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCCACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662 GCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCCACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGC 2735
Query 2739 GGAGGTAGAAGTGGTGGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTTGAGATACAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATA 2812
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 GGAGGTAGAAGTGGTGGAGAT-----------------------------GCATGACAGTGATATATCAGCATA 2780
Query 2813 TACTTACGAGCGCACTT--------------------------------------------------------- 2829
|||||||||||||||||
Sbjct 2781 TACTTACGAGCGCACTTTGATGATGGAACAAAGGTCCCAGATGCTCCGGCACATGCGGCTATCCAAAACAGAGC 2854
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2855 GAGACAGAGAGGCACAATTGGTGAAAGACCGAAACTCAATGCTACGATTGACCAGCATTGGCTCTGATGAGGAC 2928
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2929 GAAGAGACAGAAACCTATCAGGAGAAGGTGCACATGACTTGGACAAAAGACAAGTACATGGCATCCCGGGGACA 3002
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3003 AAAAGCGAAGTCAATGGAAGGATTCCAGGACCTGCTTAACATGCGTCCGGACCAGTCCAATGTGAGGCGGATGC 3076
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3077 ATACAGCAGTGAAACTCAACGAGGTTATAGTTAACAAGTCCCATGAAGCAAAGCTGGTTTTATTGAATATGCCA 3150
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3151 GGGCCACCCCGAAACCCTGAGGGTGATGAAAACTACATGGAGTTCCTAGAGGTGCTTACCGAGGGACTAGAGCG 3224
Query 2830 ------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3225 AGTCCTACTTGTCCGGGGTGGTGGCAGTGAAGTGATCACCATTTATTCA 3273