Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_15687
Subject:
NM_001042495.2
Aligned Length:
1094
Identities:
923
Gaps:
154

Alignment

Query    1  MSEMSGATTSLATVALDPPSDRTSHPQDVIEDLSQNSITGEHSQLLDDGHKKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNL  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MSEMSGATTSLATVALDPPSDRTSHPQDVIEDLSQNSITGEHSQLLDDGHKKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNL  74

Query   75  ALFEEEMDTRPKVSSLLNRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLR  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ALFEEEMDTRPKVSSLLNRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLR  148

Query  149  LTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAA  222

Query  223  MYILGAIEIFLVYIVPRAAIFHSDDALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSI  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  MYILGAIEIFLVYIVPRAAIFHSDDALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSI  296

Query  297  LAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNV  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  LAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNV  370

Query  371  TSIQGIPGLASGIITENLWSNYLPKGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGS  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TSIQGIPGLASGIITENLWSNYLPKGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGS  444

Query  445  NRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTTSFVLDLSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGS  518
            |||||||||||||||||||||||||||. |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  NRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTTSFVY-LSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGS  517

Query  519  FFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASLDLVAPILSMFF  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  FFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASLDLVAPILSMFF  591

Query  593  LMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMIYKYIEYQGAEK  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  LMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMIYKYIEYQGAEK  665

Query  667  EWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  EWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVG  739

Query  741  NFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  NFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARA  813

Query  815  WKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNISFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKVWRKCSIRIFTV  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  WKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNISFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKVWRKCSIRIFTV  887

Query  889  AQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEM----------VRKLSLRYKSMTVIYQHILTSAL---------  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||          .|.|.....|.  ...|...|..         
Sbjct  888  AQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQ--MLRHMRLSKTERDREAQLV  959

Query  944  --------------------------------------------------------------------------  943
                                                                                      
Sbjct  960  KDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQKAKSMEGFQDLLNMRPDQSNVRRMHTAVKLNE  1033

Query  944  ----------------------------------------------------------  943
                                                                      
Sbjct 1034  VIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS  1091