Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_15687
Subject:
NM_001042496.2
Aligned Length:
1144
Identities:
923
Gaps:
204

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------MSEMSGATTSLATVALDPPSDRTS  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MASVRFMVTPTKIDDIPGLSDTSPDLSSRSSSRVRFSSRESVPETSRSEPMSEMSGATTSLATVALDPPSDRTS  74

Query   25  HPQDVIEDLSQNSITGEHSQLLDDGHKKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLNRMANYT  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  HPQDVIEDLSQNSITGEHSQLLDDGHKKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLNRMANYT  148

Query   99  NLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCT  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  NLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCT  222

Query  173  MLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFHSD  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  MLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFHSD  296

Query  247  DALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGN  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  DALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGN  370

Query  321  RTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIITENLWSNYLP  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  RTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIITENLWSNYLP  444

Query  395  KGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTT  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  KGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTT  518

Query  469  SFVLDLSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAK  542
            |||. |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SFVY-LSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAK  591

Query  543  DNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASLDLVAPILSMFFLMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRP  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  DNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASLDLVAPILSMFFLMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRP  665

Query  617  RFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEG  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  RFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEG  739

Query  691  PPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEK  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  PPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEK  813

Query  765  VKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNI  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  VKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNI  887

Query  839  SFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKVWRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIE  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  SFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKVWRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIE  961

Query  913  AEVEVVEM----------VRKLSLRYKSMTVIYQHILTSAL---------------------------------  943
            ||||||||          .|.|.....|.  ...|...|..                                 
Sbjct  962  AEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQ--MLRHMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQ  1033

Query  944  --------------------------------------------------------------------------  943
                                                                                      
Sbjct 1034  EKVHMTWTKDKYMASRGQKAKSMEGFQDLLNMRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPE  1107

Query  944  ----------------------------------  943
                                              
Sbjct 1108  GDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS  1141