Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15687
- Subject:
- NM_001042497.2
- Aligned Length:
- 3482
- Identities:
- 2751
- Gaps:
- 730
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCATCCTCCAGAAACCACCACCAAGATGGCTTCAGTTCGGTTCATGGTGACACCGACAAAGATCGATGACAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCAGGTTTGTCAGACACCAGTCCGGACCTCAGCTCTCGATCTAGTTCCCGAGTAAGATTTAGCTCCCGGGAAA 148
Query 1 -----------------------------ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGTGCCTGAAACAAGCCGGAGTGAGCCTATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA 222
Query 46 CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGG 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAG-------------------------- 270
Query 120 GGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG 193
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 -------------------GACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG 325
Query 194 AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC 399
Query 268 CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC 473
Query 342 TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAA 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAA 547
Query 416 ATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCA 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 ATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCA 621
Query 490 ATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 ATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT 695
Query 564 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT 769
Query 638 TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC 843
Query 712 CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA 917
Query 786 CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC 991
Query 860 TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA 1065
Query 934 CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA 1139
Query 1008 AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT 1213
Query 1082 GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA 1287
Query 1156 GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT 1361
Query 1230 AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC 1435
Query 1304 CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT 1509
Query 1378 GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTTTAGATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTT---ATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1580
Query 1452 TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC 1525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC 1654
Query 1526 CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA 1728
Query 1600 CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA 1802
Query 1674 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC 1876
Query 1748 TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA 1821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA 1950
Query 1822 TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTAT 1895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTAT 2024
Query 1896 CTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACA 1969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 CTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACA 2098
Query 1970 AGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGG 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 AGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGG 2172
Query 2044 TTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAA 2117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 TTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAA 2246
Query 2118 ACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTC 2191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2247 ACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTC 2320
Query 2192 TCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACC 2265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321 TCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACC 2394
Query 2266 ATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGGGAGGG 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2395 ATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGAGAGGG 2468
Query 2340 CATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATG 2413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2469 CATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATG 2542
Query 2414 GCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCAT 2487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2543 GCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCAT 2616
Query 2488 CTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGA 2561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2617 CTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGA 2690
Query 2562 TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGC 2635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2691 TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGC 2764
Query 2636 GAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCC 2709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2765 GAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCC 2838
Query 2710 ACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTTGAGATA 2783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2839 ACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGAT------------------------ 2888
Query 2784 CAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTT---------------------------- 2829
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2889 -----GCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTTTGATGATGGAACAAAGGTCCCAGATGCT 2957
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2958 CCGGCACATGCGGCTATCCAAAACAGAGCGAGACAGAGAGGCACAATTGGTGAAAGACCGAAACTCAATGCTAC 3031
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3032 GATTGACCAGCATTGGCTCTGATGAGGACGAAGAGACAGAAACCTATCAGGAGAAGGTGCACATGACTTGGACA 3105
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3106 AAAGACAAGTACATGGCATCCCGGGGACAAAAAGCGAAGTCAATGGAAGGATTCCAGGACCTGCTTAACATGCG 3179
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3180 TCCGGACCAGTCCAATGTGAGGCGGATGCATACAGCAGTGAAACTCAACGAGGTTATAGTTAACAAGTCCCATG 3253
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3254 AAGCAAAGCTGGTTTTATTGAATATGCCAGGGCCACCCCGAAACCCTGAGGGTGATGAAAACTACATGGAGTTC 3327
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3328 CTAGAGGTGCTTACCGAGGGACTAGAGCGAGTCCTACTTGTCCGGGGTGGTGGCAGTGAAGTGATCACCATTTA 3401
Query 2830 ---- 2829
Sbjct 3402 TTCA 3405