Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15687
• Subject: NM_001042497.2
• Aligned Length: 1153
• Identities: 908
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  -----------------------------------------------------------MSEMSGATTSLATVA  15
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct    1  MHPPETTTKMASVRFMVTPTKIDDIPGLSDTSPDLSSRSSSRVRFSSRESVPETSRSEPMSEMSGATTSLATVA  74

Query   16  LDPPSDRTSHPQDVIEDLSQNSITGEHSQLLDDGHKKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSS  89
            ||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LDPPSDRTSHPQDVIE---------------DDGHKKARNAYLNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSS  133

Query   90  LLNRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFA  163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  134  LLNRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFA  207

Query  164  IVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIV  237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  208  IVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIV  281

Query  238  PRAAIFHSDDALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPP  311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  282  PRAAIFHSDDALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPP  355

Query  312  HFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIIT  385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  356  HFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNATCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIIT  429

Query  386  ENLWSNYLPKGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPI  459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  ENLWSNYLPKGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPI  503

Query  460  GTILAILTTSFVLDLSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGA  533
            ||||||||||||. ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  GTILAILTTSFVY-LSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLSWPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGA  576

Query  534  PRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASLDLVAPILSMFFLMCYLFVNLACALQT  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  PRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASLDLVAPILSMFFLMCYLFVNLACALQT  650

Query  608  LLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAAR  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  LLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAAR  724

Query  682  FALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQT  755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  FALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQT  798

Query  756  IKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAH  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  IKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWPNGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAH  872

Query  830  LALLVAKNISFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKVWRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLA  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  LALLVAKNISFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKVWRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLA  946

Query  904  TFLYHLRIEAEVEVVEM----------VRKLSLRYKSMTVIYQHILTSAL------------------------  943
            |||||||||||||||||          .|.|.....|.  ...|...|..                        
Sbjct  947  TFLYHLRIEAEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQ--MLRHMRLSKTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSD  1018

Query  944  --------------------------------------------------------------------------  943
                                                                                      
Sbjct 1019  EDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQKAKSMEGFQDLLNMRPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLN  1092

Query  944  -------------------------------------------  943
                                                       
Sbjct 1093  MPGPPRNPEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS  1135