Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15687
• Subject: NM_005135.2
• Aligned Length: 1105
• Identities: 900
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ---------MSEMSGATTSLATVALDPP-SDRTSHPQDVIE-DLSQNSITGEHSQLLDDGHKKARNAYLNNSNY  63
                     .....||.   |.....|. .|.....||..| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MPHFTVTKVEDPEEGAA---ASISQEPSLADIKARIQDSDEPDLSQNSITGEHSQLLDDGHKKARNAYLNNSNY  71

Query   64  EEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLNRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCL  137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  EEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLNRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGKKKPTKTPQMGTFMGVYLPCL  145

Query  138  QNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGL  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  QNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGL  219

Query  212  CFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFHSDDALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFA  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  CFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIVPRAAIFHSDDALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFA  293

Query  286  SLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNA  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  SLFLACVIVSILAIYAGAIKSSFAPPHFPVCMLGNRTLSSRHIDVCSKTKEINNMTVPSKLWGFFCNSSQFFNA  367

Query  360  TCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIITENLWSNYLPKGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIF  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TCDEYFVHNNVTSIQGIPGLASGIITENLWSNYLPKGEIIEKPSAKSSDVLGSLNHEYVLVDITTSFTLLVGIF  441

Query  434  FPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTTSFVLDLSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLS  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||. ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  FPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIPIGTILAILTTSFVY-LSNVVLFGACIEGVVLRDKFGDAVKGNLVVGTLS  514

Query  508  WPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASL  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  WPSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHSKANGEPTWALLLTAAIAELGILIASL  588

Query  582  DLVAPILSMFFLMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMI  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  DLVAPILSMFFLMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRPRFRYYHWALSFMGMSICLALMFISSWYYAIVAMVIAGMI  662

Query  656  YKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGK  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  YKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGK  736

Query  730  GLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWP  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  GLTIVGSVIVGNFLENYGEALAAEQTIKHLMEAEKVKGFCQLVVAAKLREGISHLIQSCGLGGMKHNTVVMGWP  810

Query  804  NGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNISFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKV  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  NGWRQSEDARAWKTFIGTVRVTTAAHLALLVAKNISFFPSNVEQFSEGNIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLKQHKV  884

Query  878  WRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEM----------VRKLSLRYKSMTVIYQHILTS  941
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          .|.|.....|.  ...|...|
Sbjct  885  WRKCSIRIFTVAQLEDNSIQMKKDLATFLYHLRIEAEVEVVEMHDSDISAYTYERTLMMEQRSQ--MLRHMRLS  956

Query  942  AL------------------------------------------------------------------------  943
            ..                                                                        
Sbjct  957  KTERDREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQKAKSMEGFQDLLNMRPDQSNV  1030

Query  944  ---------------------------------------------------------------------  943
                                                                                 
Sbjct 1031  RRMHTAVKLNEVIVNKSHEAKLVLLNMPGPPRNPEGDENYMEFLEVLTEGLERVLLVRGGGSEVITIYS  1099