Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15687
- Subject:
- NM_133648.2
- Aligned Length:
- 3364
- Identities:
- 2502
- Gaps:
- 602
Alignment
Query 1 ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCACTGGATCC----------ACCCAG----- 59
||| |..|||||| ||||| || || ||||||
Sbjct 1 ---------ATG--------CCGCACTTC-------ACTGT-------GA-CCAAGGTAGAAGACCCAGAGGAG 42
Query 60 --------TGACCGGACTTCTCACC----CCCAG-------GATGTCA----------TCGAG----------- 93
||.|| .|.||||.|| ||||| ||.||.| || ||
Sbjct 43 GGGGCAGCTGGCC--CCCTCTCTCCTGAGCCCAGCTCAGCAGAAGTAAAAGCCCGGATTC-AGGATCCCCAAGA 113
Query 94 ----GACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGGGGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAA 163
||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 114 ACCAGACCCGAGTCAGAACTCCATCACAGGGGAGCACAGCCAGCTGTTAGATGACGGCCATAAAAAAGCCCGAA 187
Query 164 ATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAGAAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAA 237
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 ATGCTTATCTCAATAATTCCAACTATGAAGAAGGAGACGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAA 261
Query 238 GAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCCCTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGC 311
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 262 GAAATGGACACCAGACCAAAGGTGTCTTCTCTCCTCAACCGCATGGCCAACTATACAAATCTGACACAAGGAGC 335
Query 312 AAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCACTGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCT 385
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 336 AAAGGAACATGAAGAGGCAGAGAACATCACTGAAGGGAAAAAGAAGCCTACCAAGAGCCCCCAAATGGGTACTT 409
Query 386 TCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAAATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTG 459
||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||..|.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 410 TCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAGAACATCTTTGGAGTGATCCTCTTCCTGCGTCTTACCTGGGTAGTG 483
Query 460 GGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCAATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTC 533
||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 484 GGAACAGCTGGAATCCTTCAGGCCTTTGCAATTGTCCTCATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTAACTGCCATCTC 557
Query 534 CATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGTGCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCC 607
||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||
Sbjct 558 CATGAGCGCCATCGCCACTAACGGAGTGGTGCCAGCTGGGGGCTCATACTTCATGATTTCCAGAGCCCTGGGCC 631
Query 608 CAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCTTTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGT 681
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 632 CAGAGTTTGGCGGGGCTGTAGGCCTCTGCTTTTATCTTGGCACCACATTTGCAGCAGCCATGTATATTCTTGGT 705
Query 682 GCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTCCCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATC 755
||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||..|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 706 GCCATTGAAATCTTTCTGGTATACATTGTCCCCCGAGCTGCCATCTTTCGGAGTGACGATGCACTCAAGGAGTC 779
Query 756 AGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTACGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCG 829
||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||
Sbjct 780 AGCAGCTATGCTGAACAACATGCGCGTCTATGGTACAGCCTTCTTGGTCCTCATGGTCTTGGTGGTATTCATCG 853
Query 830 GCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCACTTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCT 903
||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 854 GCGTACGCTATGTGAATAAGTTTGCCTCACTCTTCCTGGCCTGTGTAATTGTGTCGATCTTGGCTATCTATGCT 927
Query 904 GGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCACACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAG 977
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 928 GGTGCCATCAAGTCTTCCTTTGCTCCACCACACTTCCCGGTCTGTATGCTGGGCAACCGTACCCTGTCATCAAG 1001
Query 978 ACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGAAATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCT 1051
||||.|||||.|||||||||||||||||||..||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 ACACCTTGACATTTGCTCTAAGACCAAGGAGGTTGACAACATGACAGTACCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCT 1075
Query 1052 GTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCTGTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGC 1125
|.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||.|||
Sbjct 1076 GCAACTCGAGTCAGTTCTTTAATGCCACCTGTGATGAGTACTTTGTTCACAATAACGTCATCTCAATCCAAGGC 1149
Query 1126 ATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACAGAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGA 1199
|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||..||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1150 ATTCCAGGGTTGGCTAGTGGTATCATTACTGAAAATCTTTGGAGTAATTATTTACCAAAGGGTGAGATAATTGA 1223
Query 1200 AAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTTAGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCT 1273
||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 1224 AAAGCCATCAGCCAAGTCATCTGATGTCTTAGGCAACTTAAACCATGAATATGTTCTTGCTGATATCACCACCT 1297
Query 1274 CCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTCCCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGAT 1347
|||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1298 CCTTCACTCTGCTGGTGGGGATCTTCTTTCCCTCGGTCACAGGTATCATGGCTGGGTCAAACAGATCTGGAGAT 1371
Query 1348 CTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATTGGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTTTAGATTT 1421
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.| ||||
Sbjct 1372 CTGAAAGATGCCCAGAAGTCTATTCCCATTGGGACCATCCTTGCCATCCTGACCACATCCTTTGTGT---ATTT 1442
Query 1422 AAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTATTGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAG 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 1443 AAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTATTGAAGGAGTCGTTCTCAGAGACAAATTTGGGGATGCTGTAAAAG 1516
Query 1496 GTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGCCATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGT 1569
|.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517 GGAATTTGGTTGTAGGCACCTTATCCTGGCCATCCCCGTGGGTGATCGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGT 1590
Query 1570 GGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCACCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTT 1643
||||||||.||.|||||||||||||||||.||..|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1591 GGGGCTGGGCTGCAGAGCCTCACAGGTGCGCCTCGGCTGCTGCAGGCTATCGCCAAGGATAACATCATACCTTT 1664
Query 1644 TCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAATGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAG 1717
.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1665 CCTTAGGGTTTTTGGTCACAGCAAAGCTAATGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATAGCAG 1738
Query 1718 AGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATCTTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTC 1791
||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 AGCTGGGAATTCTCATCGCCTCCCTGGATCTCGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTC 1812
Query 1792 TTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACATTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCA 1865
|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1813 TTTGTGAACTTGGCTTGTGCCTTGCAAACATTGCTGCGAACCCCCAACTGGAGGCCTCGATTCCGCTATTATCA 1886
Query 1866 TTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTATCTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTG 1939
.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1887 CTGGGCCCTCTCTTTCATGGGAATGAGTATCTGTCTAGCTCTGATGTTCATTTCTTCTTGGTATTATGCCATTG 1960
Query 1940 TAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACAAGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGT 2013
||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1961 TAGCTATGGTAATAGCTGGCATGATCTACAAGTACATTGAATATCAAGGGGCTGAGAAAGAATGGGGGGATGGT 2034
Query 2014 ATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGGTTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAA 2087
||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2035 ATCCGTGGGCTGTCGCTCAGTGCAGCCCGCTTCGCTTTGCTCCGTCTAGAGGAAGGACCTCCTCACACTAAAAA 2108
Query 2088 CTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAAACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCT 2161
|||||||||||||.||||.||..|||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2109 CTGGAGGCCTCAGCTGCTCGTCCTACTGAAGCTGGATGAAGATTTACACGTCAAGCACCCTCGCCTCCTCACCT 2182
Query 2162 TTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTCTCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAAC 2235
|||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 2183 TTGCCTCCCAGCTCAAGGCAGGAAAGGGACTCACGATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCTTGGAGAAC 2256
Query 2236 TACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACCATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCA 2309
||.|||||.||..|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 TATGGTGACGCGCTCGCGGCAGAGCAGACCATTAAGCACCTAATGGAGGCAGAAAAGGTAAAAGGATTCTGCCA 2330
Query 2310 GCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGGGAGGGCATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGC 2383
..||||||||||.||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 2331 ATTGGTGGTGGCTGCCAAGCTGAAAGAGGGCATTTCACACCTCATCCAGTCCTGTGGCCTCGGAGGCATGAAAC 2404
Query 2384 ACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATGGCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATT 2457
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 2405 ACAACACAGTGGTGATGGGCTGGCCCAATGGCTGGCGTCAGAGTGAAGATGCTCGCGCTTGGAAGACTTTCATT 2478
Query 2458 GGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCATCTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAA 2531
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 2479 GGCACAGTACGAGTGACAACTGCTGCCCATCTAGCCCTGCTGGTGGCTAAAAATGTCTCCTTCTTTCCCAGCAA 2552
Query 2532 TGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGATGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTAC 2605
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||
Sbjct 2553 TGTGGAGCAGTTTTCTGAGGGCAACATTGATGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGCATGCTCATGCTATTAC 2626
Query 2606 CATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGCGAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGAC 2679
|.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2627 CGTTCCTGCTGAAACAGCACAAGGTTTGGCGGAAATGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAACTAGAAGAC 2700
Query 2680 AACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCCACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGT 2753
|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.|||.|.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 2701 AACAGTATCCAGATGAAGAAGGATCTGGCCACCTTTCTGTACCACCTGCGCATTGAGGCAGAAGTGGAAGTGGT 2774
Query 2754 GGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTTGAGATACAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCAC 2827
|||||| |||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 2775 GGAGAT-----------------------------GCACGACAGTGACATATCTGCCTATACATATGAGCGCAC 2819
Query 2828 TT------------------------------------------------------------------------ 2829
..
Sbjct 2820 CCTGATGATGGAGCAGAGGTCCCAGATGCTTCGGCATATGCGGCTGTCCAAAACAGAGCGAGACAGGGAGGCAC 2893
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2894 AGCTGGTGAAAGATCGAAACTCAATGCTACGCTTGACCAGCATTGGCTCTGATGAGGACGAAGAGACAGAAACG 2967
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2968 TACCAGGAGAAGGTGCACATGACTTGGACCAAGGATAAATACATGGCATCCCGGGGGCAAAAGGTCAAGTCAAT 3041
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3042 GGAAGGATTCCAGGACCTACTTAATATGCGTCCGGACCAGTCCAACGTGAGACGGATGCATACAGCAGTGAAGC 3115
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3116 TCAATGAAGTTATAGTCAACAAGTCTCATGAAGCAAAGCTGGTTTTGTTGAATATGCCAGGACCACCCCGGAAC 3189
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3190 CCTGAAGGTGATGAAAACTACATGGAATTTCTAGAAGTGCTCACTGAGGGATTAGAACGAGTCCTTCTTGTCCG 3263
Query 2830 ---------------------------------- 2829
Sbjct 3264 GGGTGGTGGCAGTGAGGTCATCACCATTTACTCA 3297
