Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15687
- Subject:
- XM_006498545.3
- Aligned Length:
- 3482
- Identities:
- 2488
- Gaps:
- 730
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCATCCACCAGAAGCCACCACCAAGATGTCCTCAGTTCGGTTCATGGTGACACCAACTAAGATTGATGACAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCAGGTTTGTCAGACACCAGCCCGGACCTCAGCTCTCGGTCTAGTTCTCGAGTAAGATTTAGCTCCCGAGAAA 148
Query 1 -----------------------------ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA 45
|||||.||..||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 GTGTGCCAGAAACAAGCCGTAGTGAGCCTATGAGCGAACTGTCTGGGGCTACTACTTCTCTGGCAACTGTTGCC 222
Query 46 CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGG 119
||.|||||..|||||||||||||||||.|.|||||||||||.|..|||
Sbjct 223 CTAGATCCTTCCAGTGACCGGACTTCTAATCCCCAGGATGTTACGGAG-------------------------- 270
Query 120 GGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG 193
||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 271 -------------------GATGACGGCCATAAAAAAGCCCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAACTATGAAG 325
Query 194 AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC 267
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 326 AAGGAGACGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCAAAGGTGTCTTCT 399
Query 268 CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC 341
||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 400 CTCCTCAACCGCATGGCCAACTATACAAATCTGACACAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAGAACATCAC 473
Query 342 TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAA 415
||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 474 TGAAGGGAAAAAGAAGCCTACCAAGAGCCCCCAAATGGGTACTTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAGA 547
Query 416 ATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCA 489
|.||.||||||||||||||.||..|.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||
Sbjct 548 ACATCTTTGGAGTGATCCTCTTCCTGCGTCTTACCTGGGTAGTGGGAACAGCTGGAATCCTTCAGGCCTTTGCA 621
Query 490 ATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT 563
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 622 ATTGTCCTCATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTAACTGCCATCTCCATGAGCGCCATCGCCACTAACGGAGTGGT 695
Query 564 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT 637
|||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 696 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTCATGATTTCCAGAGCCCTGGGCCCAGAGTTTGGCGGGGCTGTAGGCCTCTGCT 769
Query 638 TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC 711
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 770 TTTATCTTGGCACCACATTTGCAGCAGCCATGTATATTCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTATACATTGTC 843
Query 712 CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA 785
|||||||||||||||||||..|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 844 CCCCGAGCTGCCATCTTTCGGAGTGACGATGCACTCAAGGAGTCAGCAGCTATGCTGAACAACATGCGCGTCTA 917
Query 786 CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC 859
.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 918 TGGTACAGCCTTCTTGGTCCTCATGGTCTTGGTGGTATTCATCGGCGTACGCTATGTGAATAAGTTTGCCTCAC 991
Query 860 TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA 933
|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 992 TCTTCCTGGCCTGTGTAATTGTGTCGATCTTGGCTATCTATGCTGGTGCCATCAAGTCTTCCTTTGCTCCACCA 1065
Query 934 CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA 1007
||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1066 CACTTCCCGGTCTGTATGCTGGGCAACCGTACCCTGTCATCAAGACACCTTGACATTTGCTCTAAGACCAAGGA 1139
Query 1008 AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT 1081
..||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1140 GGTTGACAACATGACAGTACCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGCAACTCGAGTCAGTTCTTTAATGCCACCT 1213
Query 1082 GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA 1155
|||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1214 GTGATGAGTACTTTGTTCACAATAACGTCATCTCAATCCAAGGCATTCCAGGGTTGGCTAGTGGTATCATTACT 1287
Query 1156 GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT 1229
||.|||||||||||||||||..||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1288 GAAAATCTTTGGAGTAATTATTTACCAAAGGGTGAGATAATTGAAAAGCCATCAGCCAAGTCATCTGATGTCTT 1361
Query 1230 AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC 1303
|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1362 AGGCAACTTAAACCATGAATATGTTCTTGCTGATATCACCACCTCCTTCACTCTGCTGGTGGGGATCTTCTTTC 1435
Query 1304 CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT 1377
||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1436 CCTCGGTCACAGGTATCATGGCTGGGTCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCCCAGAAGTCTATTCCCATT 1509
Query 1378 GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTTTAGATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1451
||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 GGGACCATCCTTGCCATCCTGACCACATCCTTTGTGT---ATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1580
Query 1452 TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC 1525
||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1581 TGAAGGAGTCGTTCTCAGAGACAAATTTGGGGATGCTGTAAAAGGGAATTTGGTTGTAGGCACCTTATCCTGGC 1654
Query 1526 CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA 1599
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1655 CATCCCCGTGGGTGATCGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGGCTGCAGAGCCTCACAGGTGCG 1728
Query 1600 CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA 1673
||..|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1729 CCTCGGCTGCTGCAGGCTATCGCCAAGGATAACATCATACCTTTCCTTAGGGTTTTTGGTCACAGCAAAGCTAA 1802
Query 1674 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC 1747
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1803 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATAGCAGAGCTGGGAATTCTCATCGCCTCCCTGGATC 1876
Query 1748 TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA 1821
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1877 TCGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTGAACTTGGCTTGTGCCTTGCAAACA 1950
Query 1822 TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTAT 1895
||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 TTGCTGCGAACCCCCAACTGGAGGCCTCGATTCCGCTATTATCACTGGGCCCTCTCTTTCATGGGAATGAGTAT 2024
Query 1896 CTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACA 1969
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2025 CTGTCTAGCTCTGATGTTCATTTCTTCTTGGTATTATGCCATTGTAGCTATGGTAATAGCTGGCATGATCTACA 2098
Query 1970 AGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGG 2043
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2099 AGTACATTGAATATCAAGGGGCTGAGAAAGAATGGGGGGATGGTATCCGTGGGCTGTCGCTCAGTGCAGCCCGC 2172
Query 2044 TTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAA 2117
||.||||||||.||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||..|||||||
Sbjct 2173 TTCGCTTTGCTCCGTCTAGAGGAAGGACCTCCTCACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGCTGCTCGTCCTACTGAA 2246
Query 2118 ACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTC 2191
.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 2247 GCTGGATGAAGATTTACACGTCAAGCACCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCCCAGCTCAAGGCAGGAAAGGGAC 2320
Query 2192 TCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACC 2265
||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||..|.||.||.|||||||||
Sbjct 2321 TCACGATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCTTGGAGAACTATGGTGACGCGCTCGCGGCAGAGCAGACC 2394
Query 2266 ATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGGGAGGG 2339
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||..|||||
Sbjct 2395 ATTAAGCACCTAATGGAGGCAGAAAAGGTAAAAGGATTCTGCCAATTGGTGGTGGCTGCCAAGCTGAAAGAGGG 2468
Query 2340 CATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATG 2413
||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2469 CATTTCACACCTCATCCAGTCCTGTGGCCTCGGAGGCATGAAACACAACACAGTGGTGATGGGCTGGCCCAATG 2542
Query 2414 GCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCAT 2487
||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2543 GCTGGCGTCAGAGTGAAGATGCTCGCGCTTGGAAGACTTTCATTGGCACAGTACGAGTGACAACTGCTGCCCAT 2616
Query 2488 CTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGA 2561
||.||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2617 CTAGCCCTGCTGGTGGCTAAAAATGTCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAGTTTTCTGAGGGCAACATTGA 2690
Query 2562 TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGC 2635
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2691 TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGCATGCTCATGCTATTACCGTTCCTGCTGAAACAGCACAAGGTTTGGC 2764
Query 2636 GAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCC 2709
|.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 2765 GGAAATGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAACTAGAAGACAACAGTATCCAGATGAAGAAGGATCTGGCC 2838
Query 2710 ACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTTGAGATA 2783
|||||.||.||.|||.|.|||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2839 ACCTTTCTGTACCACCTGCGCATTGAGGCAGAAGTGGAAGTGGTGGAGAT------------------------ 2888
Query 2784 CAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTT---------------------------- 2829
|||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||..
Sbjct 2889 -----GCACGACAGTGACATATCTGCCTATACATATGAGCGCACCCTGATGATGGAGCAGAGGTCCCAGATGCT 2957
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2958 TCGGCATATGCGGCTGTCCAAAACAGAGCGAGACAGGGAGGCACAGCTGGTGAAAGATCGAAACTCAATGCTAC 3031
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3032 GCTTGACCAGCATTGGCTCTGATGAGGACGAAGAGACAGAAACGTACCAGGAGAAGGTGCACATGACTTGGACC 3105
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3106 AAGGATAAATACATGGCATCCCGGGGGCAAAAGGTCAAGTCAATGGAAGGATTCCAGGACCTACTTAATATGCG 3179
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3180 TCCGGACCAGTCCAACGTGAGACGGATGCATACAGCAGTGAAGCTCAATGAAGTTATAGTCAACAAGTCTCATG 3253
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3254 AAGCAAAGCTGGTTTTGTTGAATATGCCAGGACCACCCCGGAACCCTGAAGGTGATGAAAACTACATGGAATTT 3327
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3328 CTAGAAGTGCTCACTGAGGGATTAGAACGAGTCCTTCTTGTCCGGGGTGGTGGCAGTGAGGTCATCACCATTTA 3401
Query 2830 ---- 2829
Sbjct 3402 CTCA 3405
