Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15687
- Subject:
- XM_006498546.3
- Aligned Length:
- 3340
- Identities:
- 2476
- Gaps:
- 599
Alignment
Query 1 ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCACTGGATCC----------ACCCAG----- 59
||| |..|||||| ||||| || || ||||||
Sbjct 1 ---------ATG--------CCGCACTTC-------ACTGT-------GA-CCAAGGTAGAAGACCCAGAGGAG 42
Query 60 --------TGACCGGACTTCTCACC----CCCAG-------GATGTCATCGAGGACCTGAGTCA-GAACTCCAT 113
||.|| .|.||||.|| ||||| ||.||.| |.|.||.||.||| ||.|.|||
Sbjct 43 GGGGCAGCTGGCC--CCCTCTCTCCTGAGCCCAGCTCAGCAGAAGTAA---AAGCCCGGATTCAGGATCCCCA- 110
Query 114 CACAGGGGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATT 187
.|||| .|||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 111 ------AGAAC------------CAGATGACGGCCATAAAAAAGCCCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAACT 166
Query 188 ATGAAGAAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTG 261
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 167 ATGAAGAAGGAGACGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCAAAGGTG 240
Query 262 TCTTCCCTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAA 335
|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 241 TCTTCTCTCCTCAACCGCATGGCCAACTATACAAATCTGACACAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAGAA 314
Query 336 CATCACTGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTC 409
||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 CATCACTGAAGGGAAAAAGAAGCCTACCAAGAGCCCCCAAATGGGTACTTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTC 388
Query 410 TACAAAATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCT 483
||||.||.||.||||||||||||||.||..|.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.
Sbjct 389 TACAGAACATCTTTGGAGTGATCCTCTTCCTGCGTCTTACCTGGGTAGTGGGAACAGCTGGAATCCTTCAGGCC 462
Query 484 TTTGCAATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGG 557
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 463 TTTGCAATTGTCCTCATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTAACTGCCATCTCCATGAGCGCCATCGCCACTAACGG 536
Query 558 AGTGGTGCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCC 631
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 537 AGTGGTGCCAGCTGGGGGCTCATACTTCATGATTTCCAGAGCCCTGGGCCCAGAGTTTGGCGGGGCTGTAGGCC 610
Query 632 TCTGCTTTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTAT 705
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 611 TCTGCTTTTATCTTGGCACCACATTTGCAGCAGCCATGTATATTCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTATAC 684
Query 706 ATCGTCCCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCG 779
||.||||||||||||||||||||||..|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 685 ATTGTCCCCCGAGCTGCCATCTTTCGGAGTGACGATGCACTCAAGGAGTCAGCAGCTATGCTGAACAACATGCG 758
Query 780 TGTCTACGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTG 853
.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 759 CGTCTATGGTACAGCCTTCTTGGTCCTCATGGTCTTGGTGGTATTCATCGGCGTACGCTATGTGAATAAGTTTG 832
Query 854 CCTCACTTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCT 927
|||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 833 CCTCACTCTTCCTGGCCTGTGTAATTGTGTCGATCTTGGCTATCTATGCTGGTGCCATCAAGTCTTCCTTTGCT 906
Query 928 CCTCCACACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGAC 1001
||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 907 CCACCACACTTCCCGGTCTGTATGCTGGGCAACCGTACCCTGTCATCAAGACACCTTGACATTTGCTCTAAGAC 980
Query 1002 CAAGGAAATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATG 1075
||||||..||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 981 CAAGGAGGTTGACAACATGACAGTACCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGCAACTCGAGTCAGTTCTTTAATG 1054
Query 1076 CCACCTGTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATA 1149
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1055 CCACCTGTGATGAGTACTTTGTTCACAATAACGTCATCTCAATCCAAGGCATTCCAGGGTTGGCTAGTGGTATC 1128
Query 1150 ATTACAGAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGA 1223
|||||.||.|||||||||||||||||..||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1129 ATTACTGAAAATCTTTGGAGTAATTATTTACCAAAGGGTGAGATAATTGAAAAGCCATCAGCCAAGTCATCTGA 1202
Query 1224 TGTCTTAGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCT 1297
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1203 TGTCTTAGGCAACTTAAACCATGAATATGTTCTTGCTGATATCACCACCTCCTTCACTCTGCTGGTGGGGATCT 1276
Query 1298 TCTTTCCCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATT 1371
||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1277 TCTTTCCCTCGGTCACAGGTATCATGGCTGGGTCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCCCAGAAGTCTATT 1350
Query 1372 CCGATTGGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTTTAGATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGC 1445
||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 CCCATTGGGACCATCCTTGCCATCCTGACCACATCCTTTGTGT---ATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGC 1421
Query 1446 ATGTATTGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTAT 1519
||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1422 ATGTATTGAAGGAGTCGTTCTCAGAGACAAATTTGGGGATGCTGTAAAAGGGAATTTGGTTGTAGGCACCTTAT 1495
Query 1520 CTTGGCCATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACA 1593
|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1496 CCTGGCCATCCCCGTGGGTGATCGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGGCTGCAGAGCCTCACA 1569
Query 1594 GGTGCACCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAA 1667
|||||.||..|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1570 GGTGCGCCTCGGCTGCTGCAGGCTATCGCCAAGGATAACATCATACCTTTCCTTAGGGTTTTTGGTCACAGCAA 1643
Query 1668 AGCCAATGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCC 1741
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1644 AGCTAATGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATAGCAGAGCTGGGAATTCTCATCGCCTCCC 1717
Query 1742 TGGATCTTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTG 1815
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1718 TGGATCTCGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTGAACTTGGCTTGTGCCTTG 1791
Query 1816 CAAACATTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAAT 1889
||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1792 CAAACATTGCTGCGAACCCCCAACTGGAGGCCTCGATTCCGCTATTATCACTGGGCCCTCTCTTTCATGGGAAT 1865
Query 1890 GAGTATCTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGA 1963
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1866 GAGTATCTGTCTAGCTCTGATGTTCATTTCTTCTTGGTATTATGCCATTGTAGCTATGGTAATAGCTGGCATGA 1939
Query 1964 TCTACAAGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCA 2037
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1940 TCTACAAGTACATTGAATATCAAGGGGCTGAGAAAGAATGGGGGGATGGTATCCGTGGGCTGTCGCTCAGTGCA 2013
Query 2038 GCCCGGTTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATT 2111
|||||.||.||||||||.||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||..|
Sbjct 2014 GCCCGCTTCGCTTTGCTCCGTCTAGAGGAAGGACCTCCTCACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGCTGCTCGTCCT 2087
Query 2112 ACTGAAACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAA 2185
||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2088 ACTGAAGCTGGATGAAGATTTACACGTCAAGCACCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCCCAGCTCAAGGCAGGAA 2161
Query 2186 AAGGTCTCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAG 2259
|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||..|.||.||.|||
Sbjct 2162 AGGGACTCACGATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCTTGGAGAACTATGGTGACGCGCTCGCGGCAGAG 2235
Query 2260 CAGACCATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAG 2333
||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||.
Sbjct 2236 CAGACCATTAAGCACCTAATGGAGGCAGAAAAGGTAAAAGGATTCTGCCAATTGGTGGTGGCTGCCAAGCTGAA 2309
Query 2334 GGAGGGCATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGC 2407
.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2310 AGAGGGCATTTCACACCTCATCCAGTCCTGTGGCCTCGGAGGCATGAAACACAACACAGTGGTGATGGGCTGGC 2383
Query 2408 CTAATGGCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCT 2481
|.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2384 CCAATGGCTGGCGTCAGAGTGAAGATGCTCGCGCTTGGAAGACTTTCATTGGCACAGTACGAGTGACAACTGCT 2457
Query 2482 GCCCATCTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAA 2555
||||||||.||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2458 GCCCATCTAGCCCTGCTGGTGGCTAAAAATGTCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAGTTTTCTGAGGGCAA 2531
Query 2556 CATTGATGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGG 2629
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2532 CATTGATGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGCATGCTCATGCTATTACCGTTCCTGCTGAAACAGCACAAGG 2605
Query 2630 TGTGGCGAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGAC 2703
|.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2606 TTTGGCGGAAATGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAACTAGAAGACAACAGTATCCAGATGAAGAAGGAT 2679
Query 2704 CTAGCCACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTT 2777
||.||||||||.||.||.|||.|.|||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2680 CTGGCCACCTTTCTGTACCACCTGCGCATTGAGGCAGAAGTGGAAGTGGTGGAGAT------------------ 2735
Query 2778 GAGATACAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTT---------------------- 2829
|||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||..
Sbjct 2736 -----------GCACGACAGTGACATATCTGCCTATACATATGAGCGCACCCTGATGATGGAGCAGAGGTCCCA 2798
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2799 GATGCTTCGGCATATGCGGCTGTCCAAAACAGAGCGAGACAGGGAGGCACAGCTGGTGAAAGATCGAAACTCAA 2872
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2873 TGCTACGCTTGACCAGCATTGGCTCTGATGAGGACGAAGAGACAGAAACGTACCAGGAGAAGGTGCACATGACT 2946
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 2947 TGGACCAAGGATAAATACATGGCATCCCGGGGGCAAAAGGTCAAGTCAATGGAAGGATTCCAGGACCTACTTAA 3020
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3021 TATGCGTCCGGACCAGTCCAACGTGAGACGGATGCATACAGCAGTGAAGCTCAATGAAGTTATAGTCAACAAGT 3094
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3095 CTCATGAAGCAAAGCTGGTTTTGTTGAATATGCCAGGACCACCCCGGAACCCTGAAGGTGATGAAAACTACATG 3168
Query 2830 -------------------------------------------------------------------------- 2829
Sbjct 3169 GAATTTCTAGAAGTGCTCACTGAGGGATTAGAACGAGTCCTTCTTGTCCGGGGTGGTGGCAGTGAGGTCATCAC 3242
Query 2830 ---------- 2829
Sbjct 3243 CATTTACTCA 3252
