Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15687
• Subject: XM_006720793.4
• Aligned Length: 3482
• Identities: 2649
• Gaps: 832

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCATCCTCCAGAAACCACCACCAAGATGGCTTCAGTTCGGTTCATGGTGACACCGACAAAGATCGATGACAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCAGGTTTGTCAGACACCAGTCCGGACCTCAGCTCTCGATCTAGTTCCCGAGTAAGATTTAGCTCCCGGGAAA  148

Query    1  -----------------------------ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA  45
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGTGCCTGAAACAAGCCGGAGTGAGCCTATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA  222

Query   46  CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGG  119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGG  296

Query  120  GGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG  193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG  370

Query  194  AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC  444

Query  268  CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC  341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC  518

Query  342  TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAA  415
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  519  TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAG-------------------------------------------------  543

Query  416  ATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCA  489
                                                                                      
Sbjct  544  --------------------------------------------------------------------------  543

Query  490  ATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT  563
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  ------------------------ACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT  593

Query  564  GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT  667

Query  638  TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC  741

Query  712  CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA  815

Query  786  CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC  889

Query  860  TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA  963

Query  934  CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA  1037

Query 1008  AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038  AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT  1111

Query 1082  GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112  GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA  1185

Query 1156  GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186  GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT  1259

Query 1230  AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260  AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC  1333

Query 1304  CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334  CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT  1407

Query 1378  GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTTTAGATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT  1451
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408  GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTT---ATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT  1478

Query 1452  TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC  1552

Query 1526  CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA  1626

Query 1600  CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA  1700

Query 1674  TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC  1747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC  1774

Query 1748  TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA  1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775  TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA  1848

Query 1822  TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTAT  1895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849  TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTAT  1922

Query 1896  CTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACA  1969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923  CTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACA  1996

Query 1970  AGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGG  2043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997  AGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGG  2070

Query 2044  TTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAA  2117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071  TTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAA  2144

Query 2118  ACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTC  2191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145  ACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTC  2218

Query 2192  TCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACC  2265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219  TCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACC  2292

Query 2266  ATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGGGAGGG  2339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2293  ATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGAGAGGG  2366

Query 2340  CATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATG  2413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367  CATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATG  2440

Query 2414  GCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCAT  2487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441  GCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCAT  2514

Query 2488  CTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGA  2561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515  CTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGA  2588

Query 2562  TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGC  2635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589  TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGC  2662

Query 2636  GAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCC  2709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2663  GAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCC  2736

Query 2710  ACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTTGAGATA  2783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct 2737  ACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGAT------------------------  2786

Query 2784  CAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTT----------------------------  2829
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 2787  -----GCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTTTGATGATGGAACAAAGGTCCCAGATGCT  2855

Query 2830  --------------------------------------------------------------------------  2829
                                                                                      
Sbjct 2856  CCGGCACATGCGGCTATCCAAAACAGAGCGAGACAGAGAGGCACAATTGGTGAAAGACCGAAACTCAATGCTAC  2929

Query 2830  --------------------------------------------------------------------------  2829
                                                                                      
Sbjct 2930  GATTGACCAGCATTGGCTCTGATGAGGACGAAGAGACAGAAACCTATCAGGAGAAGGTGCACATGACTTGGACA  3003

Query 2830  --------------------------------------------------------------------------  2829
                                                                                      
Sbjct 3004  AAAGACAAGTACATGGCATCCCGGGGACAAAAAGCGAAGTCAATGGAAGGATTCCAGGACCTGCTTAACATGCG  3077

Query 2830  --------------------------------------------------------------------------  2829
                                                                                      
Sbjct 3078  TCCGGACCAGTCCAATGTGAGGCGGATGCATACAGCAGTGAAACTCAACGAGGTTATAGTTAACAAGTCCCATG  3151

Query 2830  --------------------------------------------------------------------------  2829
                                                                                      
Sbjct 3152  AAGCAAAGCTGGTTTTATTGAATATGCCAGGGCCACCCCGAAACCCTGAGGGTGATGAAAACTACATGGAGTTC  3225

Query 2830  --------------------------------------------------------------------------  2829
                                                                                      
Sbjct 3226  CTAGAGGTGCTTACCGAGGGACTAGAGCGAGTCCTACTTGTCCGGGGTGGTGGCAGTGAAGTGATCACCATTTA  3299

Query 2830  ----  2829
                
Sbjct 3300  TTCA  3303